| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-25页 |
| 1 隐孢子虫简介 | 第12-14页 |
| 2 隐孢子虫分类 | 第14-16页 |
| 3 隐孢子虫的分子鉴定 | 第16-20页 |
| 4 松鼠猴和骆驼源隐孢子虫研究现状 | 第20-22页 |
| 5 牛源隐孢子虫研究现状 | 第22-24页 |
| 6 目的与意义 | 第24-25页 |
| 第二章 松鼠猴源、骆驼源隐孢子虫的虫种鉴定 | 第25-37页 |
| 1 材料和方法 | 第25-31页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第25-26页 |
| 1.2 粪便样品采集 | 第26-28页 |
| 1.3 样品处理 | 第28-29页 |
| 1.3.1 粪便隐孢子虫卵囊镜检 | 第28页 |
| 1.3.2 卵囊样品的回收 | 第28页 |
| 1.3.3 粪便DNA提取 | 第28-29页 |
| 1.4 PCR扩增 | 第29-31页 |
| 1.4.1 PCR引物的设计与反应 | 第29-31页 |
| 1.4.2 PCR产物检测 | 第31页 |
| 1.4.3 PCR产物测序 | 第31页 |
| 1.5 测序结果分析 | 第31页 |
| 1.5.1 相关序列搜索与下载 | 第31页 |
| 1.5.2 同源性分析 | 第31页 |
| 1.5.3 种系发育分析 | 第31页 |
| 2 结果 | 第31-35页 |
| 2.1 镜检结果 | 第31页 |
| 2.2 PCR扩增结果 | 第31-32页 |
| 2.3 测序结果 | 第32页 |
| 2.4 同源性分析 | 第32-33页 |
| 2.5 种系发育分析 | 第33-35页 |
| 3 讨论 | 第35-37页 |
| 3.1 松鼠猴源隐孢子虫 | 第35页 |
| 3.2 骆驼源隐孢子虫 | 第35-37页 |
| 第三章 牛源隐孢子虫的虫种鉴定 | 第37-46页 |
| 1 材料和方法 | 第37-38页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第37页 |
| 1.2 粪便样品 | 第37页 |
| 1.3 样品处理 | 第37-38页 |
| 1.3.1 清洗样品 | 第37页 |
| 1.3.2 DNA提取 | 第37-38页 |
| 1.4 PCR扩增 | 第38页 |
| 1.4.1 PCR引物的设计与反应 | 第38页 |
| 1.4.2 PCR产物检测 | 第38页 |
| 1.4.3 PCR产物测序 | 第38页 |
| 1.5 测序结果分析 | 第38页 |
| 1.5.1 相关序列搜索与下载 | 第38页 |
| 1.5.2 同源性分析 | 第38页 |
| 1.5.3 种系发育分析 | 第38页 |
| 2 结果 | 第38-42页 |
| 2.1 PCR扩增结果 | 第38-39页 |
| 2.2 测序结果 | 第39页 |
| 2.3 同源性分析 | 第39-40页 |
| 2.4 种系发育分析 | 第40-42页 |
| 2.5 不同年龄段牛感染隐孢子虫种类 | 第42页 |
| 3 讨论 | 第42-44页 |
| 3.1 牛源C.parvum | 第42-43页 |
| 3.2 牛源C.ryanae | 第43页 |
| 3.3 牛源C.andersoni | 第43-44页 |
| 3.4 牛源C.bovis | 第44页 |
| 4 小结 | 第44-46页 |
| 第四章 隐孢子虫的亚型鉴定与分析 | 第46-59页 |
| 1 材料和方法 | 第46-48页 |
| 1.1 主要仪器和试剂 | 第46页 |
| 1.2 样品 | 第46页 |
| 1.3 PCR扩增 | 第46-48页 |
| 1.3.1 PCR引物的设计与反应 | 第46-48页 |
| 1.3.2 PCR产物检测 | 第48页 |
| 1.3.3 PCR产物测序 | 第48页 |
| 1.4 测序结果分析 | 第48页 |
| 1.4.1 相关序列搜索与下载 | 第48页 |
| 1.4.2 种系发育分析 | 第48页 |
| 1.5 C.andersoni种群特征分析 | 第48页 |
| 2 结果 | 第48-56页 |
| 2.1 PCR扩增结果 | 第48-50页 |
| 2.1.1 GP60位点扩增结果 | 第48-50页 |
| 2.1.2 MS1、MS2、MS3和MS16扩增结果 | 第50页 |
| 2.2 测序结果 | 第50-51页 |
| 2.3 种系发育分析 | 第51-55页 |
| 2.3.1 GP60种系发育分析 | 第51-52页 |
| 2.3.2 MS1、MS2、MS3和MS16种系发育分析 | 第52-55页 |
| 2.4 C.andersoni种群结构分析 | 第55-56页 |
| 3 讨论 | 第56-59页 |
| 3.1 GP60亚型 | 第56-57页 |
| 3.1.1 SCSM01的亚型 | 第56页 |
| 3.1.2 SC01-SC07的亚型 | 第56-57页 |
| 3.2 MLST亚型 | 第57-58页 |
| 3.3 C.andersoni种群特征 | 第58-59页 |
| 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-70页 |
| 致谢 | 第70-72页 |
| 附录 | 第72-79页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第79页 |