| 符号说明 | 第1-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 1 前言 | 第13-30页 |
| ·尼罗罗非鱼 | 第13页 |
| ·脊椎动物的性别决定机制 | 第13-15页 |
| ·遗传性别决定机制 | 第13-14页 |
| ·环境性别决定机制 | 第14-15页 |
| ·基因-温度性别决定 | 第15页 |
| ·性别分化相关基因 | 第15-24页 |
| ·芳香化酶基因 | 第16-21页 |
| ·芳香化酶和雌激素 | 第16-17页 |
| ·芳香化酶基因和其启动子区结构 | 第17-18页 |
| ·芳香化酶和雌激素在鱼类性别分化和性别决定中的作用 | 第18-19页 |
| ·温度对芳香化酶基因表达的影响 | 第19-20页 |
| ·芳香化酶基因的相关转录因子 | 第20-21页 |
| ·Foxl2基因 | 第21页 |
| ·Sf1基因 | 第21-22页 |
| ·Sox9基因 | 第22-23页 |
| ·Dmrt1基因 | 第23页 |
| ·Amh基因（MIS） | 第23-24页 |
| ·Dax1基因 | 第24页 |
| ·表观遗传研究现状 | 第24-27页 |
| ·表观遗传学 | 第24-25页 |
| ·DNA甲基化 | 第25-26页 |
| ·组蛋白修饰 | 第26-27页 |
| ·甲基化研究技术手段 | 第27-29页 |
| ·全基因组甲基化研究技术 | 第27-29页 |
| ·单基因甲基化程度检测方法 | 第29页 |
| ·组蛋白甲基化检测方法 | 第29页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第29-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-42页 |
| ·实验材料 | 第30-31页 |
| ·尼罗罗非鱼家系的建立 | 第30页 |
| ·尼罗罗非鱼的高温诱导 | 第30-31页 |
| ·样品的采集和性别鉴定 | 第31页 |
| ·实验仪器与试剂 | 第31-32页 |
| ·实验仪器 | 第31-32页 |
| ·实验试剂 | 第32页 |
| ·主要数据库及软件 | 第32页 |
| ·试验方法 | 第32-42页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第32-33页 |
| ·MeDIP-seq样品处理 | 第33页 |
| ·尼罗罗非鱼遗传性别的鉴定 | 第33-34页 |
| ·亚硫酸氢盐测序 | 第34-35页 |
| ·染色质免疫共沉淀（ChIP）检测组蛋白甲基化 | 第35-38页 |
| ·总RNA的提取 | 第38-39页 |
| ·反转录合成cDNA | 第39-40页 |
| ·cDNA检测 | 第40页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第40-41页 |
| ·统计分析 | 第41-42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-64页 |
| ·MeDIP-seq测序结果分析 | 第42-60页 |
| ·MeDIP-seq测序结果数据量统计 | 第42页 |
| ·MeDIP-seq测序结果的reads在全基因组每条染色体上的分布 | 第42-49页 |
| ·各组间差异甲基化基因数量统计 | 第49-51页 |
| ·各组间DMRs在基因不同位置的分布情况 | 第51-52页 |
| ·各组间基因差异甲基化程度分析 | 第52-59页 |
| ·性别分化相关基因表达量验证 | 第59-60页 |
| ·cyp19a1a启动子区甲基化程度及mRNA表达量差异分析 | 第60-63页 |
| ·基因组的提取 | 第60页 |
| ·尼罗罗非鱼cyp19a1a启动子区目的片段的扩增 | 第60页 |
| ·高温诱导对尼罗罗非鱼cyp19a1a启动子区甲基化水平及mRNA水平的影响 | 第60-61页 |
| ·不同年龄段尼罗罗非鱼cyp19a1a启动子区甲基化水平及mRNA表达量分析 | 第61-63页 |
| ·cyp19a1a组蛋白甲基化程度差异分析 | 第63页 |
| ·尼罗罗非鱼遗传性别鉴定 | 第63-64页 |
| 4 讨论 | 第64-67页 |
| ·高温诱导对尼罗罗非鱼全基因组甲基化水平的影响 | 第64-65页 |
| ·高温诱导对尼罗罗非鱼cyp19a1a启动子区甲基化水平和mRNA表达量的影响 | 第65-66页 |
| ·不同年龄段雌雄尼罗罗非鱼 cyp19a1a 启动子区甲基化水平和 m RNA 表达量的变化 | 第66-67页 |
| ·高温诱导对尼罗罗非鱼 cyp19a1a 基因组蛋白 H3K9 甲基化的影响 | 第67页 |
| 5 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
