| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-24页 |
| ·驯化和人工选择及其研究进展 | 第12-18页 |
| ·驯化和人工选择的定义 | 第12-14页 |
| ·驯化和人工选择对动物的影响 | 第14-15页 |
| ·研究动物驯化以及人工选择的常用方法 | 第15-16页 |
| ·驯化以及人工选择的分子机制 | 第16-18页 |
| ·动物驯化及人工选择的研究价值 | 第18页 |
| ·全基因组测序及其在农业中的应用 | 第18-23页 |
| ·全基因组测序定义 | 第18-19页 |
| ·全基因组测序技术的三大平台 | 第19-21页 |
| ·全基因组重测序及其在农业动物中的应用 | 第21-23页 |
| ·猪是重要的经济动物和模式动物 | 第23-24页 |
| ·猪是重要的经济动物 | 第23页 |
| ·猪是重要的模式动物 | 第23-24页 |
| 2. 主要内容和目的、意义 | 第24-26页 |
| ·研究目的和意义 | 第24-25页 |
| ·主要研究内容 | 第25-26页 |
| 3 材料与方法 | 第26-35页 |
| ·实验材料 | 第26-28页 |
| ·样本的采集 | 第26页 |
| ·主要仪器设备 | 第26-27页 |
| ·实验所需试剂 | 第27-28页 |
| ·试验方法 | 第28-35页 |
| ·基因组DNA的抽提 | 第28-29页 |
| ·基因组DNA的质检 | 第29页 |
| ·cDNA文库的构建 | 第29-30页 |
| ·重测序数据分析 | 第30-35页 |
| 4 结果与分析 | 第35-49页 |
| ·DNA的的抽提以及重测序文库的构建 | 第35-37页 |
| ·单碱基多态位点(SNP位点)的鉴定 | 第37-39页 |
| ·插入/缺失多态性(insertion or deletion polymorphisms,InDels)的鉴定及分析 | 第39-41页 |
| ·群体遗传学分析 | 第41-44页 |
| ·选择性清除区域筛选及分析 | 第44-46页 |
| ·体长相关基因的筛选 | 第46-49页 |
| 5 讨论 | 第49-53页 |
| ·基因组DNA抽提、cDNA文库构建以及测序数据综述 | 第49页 |
| ·SNP和Indel的鉴定 | 第49-50页 |
| ·插入/缺失的鉴定 | 第50页 |
| ·进化关系分析和混合分析 | 第50-51页 |
| ·选择性清楚区域的筛选和分析 | 第51-53页 |
| 6. 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 附录 | 第61-70页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第70页 |