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百合切花茎基端PPOs基因表达及采切创伤转录组分析

摘要第1-5页
Abstract第5-7页
缩略词表第7-10页
第一章 绪论第10-19页
   ·植物响应机械创伤的机制第10-17页
     ·机械创伤与抗氧化酶系统第10-12页
     ·机械创伤与信号转导途径第12-14页
     ·机械创伤与植物次生代谢第14-17页
   ·转录组测序研究进展第17-18页
     ·转录组学研究第17页
     ·观赏植物转录组学研究概况第17-18页
   ·本研究的目的和意义第18-19页
第二章 材料与方法第19-34页
   ·试验材料第19-20页
     ·植物材料及其处理第19页
     ·主要仪器设备第19-20页
     ·试验用酶、试剂盒与相关试剂第20页
   ·试验方法第20-34页
     ·百合总RNA的提取及检测第20页
     ·百合DNA的提取及检测第20页
     ·PCR扩增方法第20-28页
     ·目的片段的回收、重组质粒的连接转化及阳性克隆的鉴定第28-29页
     ·生物信息学分析第29页
     ·半定量PCR第29-30页
     ·RNA文库的构建、质控及测序第30-31页
     ·转录组测序数据组装第31页
     ·转录组测序文库质量评估第31页
     ·Unigenes功能注释第31页
     ·基因表达量分析第31-32页
     ·差异表达分析第32页
     ·差异表达基因富集分析第32页
     ·实时荧光定量PCR第32-34页
第三章 结果与分析第34-72页
   ·百合切花3个PPOs基因的克隆与序列分析第34-50页
     ·百合切花DNA、RNA的提取与检测第34页
     ·百合切花3个PPOs基因cDNA序列全长的克隆第34-40页
     ·百合切花3个PPOs基因gDNA序列的克隆第40-41页
     ·百合切花PPOs基因序列的生物信息学分析第41-45页
     ·LhPPO1和LhPPO2基因启动子的克隆及其顺式作用元件预测第45-50页
   ·百合切花不同组织中LhPPOs基因的表达情况第50页
   ·百合切花采后茎基端转录组分析第50-70页
     ·百合总RNA的提取与检测、文库构建与检测第50-51页
     ·测序数据质量控制及组装第51-54页
     ·Unigene功能注释第54-58页
     ·差异表达分析第58-60页
     ·差异表达基因功能注释和富集分析第60-68页
     ·荧光定量PCR对转录组测序结果的验证第68-70页
   ·‘罗宾娜’与‘蒂伯’两个百合品种间PPOs基因的对比第70-72页
第四章 讨论与结论第72-79页
   ·讨论第72-78页
     ·3 个百合PPOs基因的cDNA及gDNA的主要特征第72-73页
     ·百合LhPPO1和LhPPO2基因上游启动子的主要特征第73-74页
     ·转录组测序评估第74-75页
     ·植物激素信号转导对切割创伤的响应第75-76页
     ·苯丙烷代谢对切割创伤的响应第76页
     ·百合切花PPOs基因表达特征第76-78页
   ·结论第78-79页
致谢第79-80页
参考文献第80-90页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第90-92页

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