摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-7页 |
缩略词表 | 第7-10页 |
第一章 绪论 | 第10-19页 |
·植物响应机械创伤的机制 | 第10-17页 |
·机械创伤与抗氧化酶系统 | 第10-12页 |
·机械创伤与信号转导途径 | 第12-14页 |
·机械创伤与植物次生代谢 | 第14-17页 |
·转录组测序研究进展 | 第17-18页 |
·转录组学研究 | 第17页 |
·观赏植物转录组学研究概况 | 第17-18页 |
·本研究的目的和意义 | 第18-19页 |
第二章 材料与方法 | 第19-34页 |
·试验材料 | 第19-20页 |
·植物材料及其处理 | 第19页 |
·主要仪器设备 | 第19-20页 |
·试验用酶、试剂盒与相关试剂 | 第20页 |
·试验方法 | 第20-34页 |
·百合总RNA的提取及检测 | 第20页 |
·百合DNA的提取及检测 | 第20页 |
·PCR扩增方法 | 第20-28页 |
·目的片段的回收、重组质粒的连接转化及阳性克隆的鉴定 | 第28-29页 |
·生物信息学分析 | 第29页 |
·半定量PCR | 第29-30页 |
·RNA文库的构建、质控及测序 | 第30-31页 |
·转录组测序数据组装 | 第31页 |
·转录组测序文库质量评估 | 第31页 |
·Unigenes功能注释 | 第31页 |
·基因表达量分析 | 第31-32页 |
·差异表达分析 | 第32页 |
·差异表达基因富集分析 | 第32页 |
·实时荧光定量PCR | 第32-34页 |
第三章 结果与分析 | 第34-72页 |
·百合切花3个PPOs基因的克隆与序列分析 | 第34-50页 |
·百合切花DNA、RNA的提取与检测 | 第34页 |
·百合切花3个PPOs基因cDNA序列全长的克隆 | 第34-40页 |
·百合切花3个PPOs基因gDNA序列的克隆 | 第40-41页 |
·百合切花PPOs基因序列的生物信息学分析 | 第41-45页 |
·LhPPO1和LhPPO2基因启动子的克隆及其顺式作用元件预测 | 第45-50页 |
·百合切花不同组织中LhPPOs基因的表达情况 | 第50页 |
·百合切花采后茎基端转录组分析 | 第50-70页 |
·百合总RNA的提取与检测、文库构建与检测 | 第50-51页 |
·测序数据质量控制及组装 | 第51-54页 |
·Unigene功能注释 | 第54-58页 |
·差异表达分析 | 第58-60页 |
·差异表达基因功能注释和富集分析 | 第60-68页 |
·荧光定量PCR对转录组测序结果的验证 | 第68-70页 |
·‘罗宾娜’与‘蒂伯’两个百合品种间PPOs基因的对比 | 第70-72页 |
第四章 讨论与结论 | 第72-79页 |
·讨论 | 第72-78页 |
·3 个百合PPOs基因的cDNA及gDNA的主要特征 | 第72-73页 |
·百合LhPPO1和LhPPO2基因上游启动子的主要特征 | 第73-74页 |
·转录组测序评估 | 第74-75页 |
·植物激素信号转导对切割创伤的响应 | 第75-76页 |
·苯丙烷代谢对切割创伤的响应 | 第76页 |
·百合切花PPOs基因表达特征 | 第76-78页 |
·结论 | 第78-79页 |
致谢 | 第79-80页 |
参考文献 | 第80-90页 |
攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第90-92页 |