| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-18页 |
| ·生物信息学 | 第8-13页 |
| ·生物信息学的研究背景 | 第8-9页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第9-11页 |
| ·研究的技术方法 | 第11-13页 |
| ·物种系统发育分析 | 第13-14页 |
| ·物种系统发育分析的目的及意义 | 第13页 |
| ·物种系统发育分析方法 | 第13-14页 |
| ·非编码 RNA 预测 | 第14-15页 |
| ·非编码 RNA 的相关概念 | 第14-15页 |
| ·非编码 RNA 的预测方法 | 第15页 |
| ·本课题的主要工作及创新 | 第15-16页 |
| ·论文的组织结构 | 第16-18页 |
| 第二章 系统发育分析和非编码 RNA 预测的理论方法 | 第18-28页 |
| ·系统发育分析的理论方法 | 第18-23页 |
| ·一种改进的碱基间隔距离模型 | 第18-22页 |
| ·距离方法 | 第22-23页 |
| ·构建系统发育树 | 第23页 |
| ·基于碱基间隔距离模型的非编码 RNA 预测方法 | 第23-27页 |
| ·碱基间隔距离特征提取 | 第24页 |
| ·支持向量机 | 第24-26页 |
| ·非编码 RNA 预测流程 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第三章 基于碱基间隔距离模型的基因组进化分析 | 第28-42页 |
| ·脊椎动物线粒体基因组进化分析 | 第28-35页 |
| ·数据和方法 | 第29-32页 |
| ·结果和讨论 | 第32-35页 |
| ·多瘤病毒基因组进化分析 | 第35-40页 |
| ·数据和方法 | 第36-37页 |
| ·结果和讨论 | 第37-40页 |
| ·本章小结 | 第40-42页 |
| 第四章 基于碱基间隔距离模型的非编码 RNA 预测 | 第42-48页 |
| ·数据准备和特征提取 | 第42-43页 |
| ·SVM 预测非编码 RNA 序列 | 第43-45页 |
| ·结果与讨论 | 第45-47页 |
| ·实验平台 | 第45页 |
| ·评价指标 | 第45-46页 |
| ·结果分析 | 第46-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第五章 总结与展望 | 第48-50页 |
| ·论文总结 | 第48页 |
| ·未来展望 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 攻读学位期间主要的研究成果 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55页 |