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实时定量PCR检测血中白念珠菌DNA及快速药敏试验的方法学研究

中文摘要第1-8页
Abstract第8-10页
中英文名词对照第10-12页
前言第12-15页
第一部分 实时定量PCR检测血中白念珠菌(C.al)DNA的方法学及临床标本验证第15-62页
 一、实验材料第16-19页
  (一) 主要仪器第16页
  (二) 试剂及耗材第16-18页
  (三) 菌种来源第18页
  (四) 标本采集第18-19页
 二、实验方法第19-40页
  (一) 特异性引物及TaqMan探针设计第19页
  (二) 培养基的制备第19-20页
  (三) 基因组DNA提取第20-22页
  (四) 引物有效性及特异性验证第22-23页
  (五) 探针有效性及特异性验证第23-24页
  (六) 标准品质粒的制备第24-30页
  (七) 实时定量PCR引物和探针浓度优化第30-35页
  (八) 实时定量PCR反应体系建立及实验流程第35-37页
  (九) 检测限、灵敏度和特异度测试第37-38页
  (十) 标准曲线建立第38页
  (十一) 仪器准确性及重复性测试第38页
  (十二) 模拟血标本中白念珠菌DNA提取效率测定第38页
  (十三) 模拟标本存放稳定性监测第38页
  (十四) RQ-PCR对临床标本白念珠菌的检测第38-39页
  (十五) 统计学处理第39-40页
 三、实验结果第40-57页
  (一) 特异性引物及TaqMan探针序列第40页
  (二) 引物和探针特异性验证第40-41页
  (三) 菌落PCR第41-42页
  (四) 测序第42-44页
  (五) 比对第44-45页
  (六) 质粒电泳第45-46页
  (七) 质粒PCR第46-47页
  (八) 质粒DNA拷贝数的换算第47页
  (九) 实时定量PCR引物和探针浓度优化第47-50页
  (十) 检测限、灵敏度和特异度测定第50-51页
  (十一) 标准曲线线性范围第51-52页
  (十二) 仪器的准确性及重复性第52-53页
  (十三) 血标本中白念珠菌DNA提取效率第53页
  (十四) 储存标本的稳定性第53-54页
  (十五) 临床标本检测结果第54-57页
 四、讨论第57-62页
第二部分 实时定量PCR检测外科发热患者血中白念珠菌并与血培养结果的对照研究第62-72页
 一、实验材料第63-65页
  (一) 主要仪器第63页
  (二) 试剂及耗材第63-64页
  (三) 标本采集第64-65页
 二、实验方法第65-66页
  (一) 患者血标本培养第65页
  (二) 临床血标本白念珠菌基因组DNA提取第65页
  (三) 检测限和灵敏度、特异度的确定第65页
  (四) 健康成年人全血基因组的检测第65页
  (五) 临床标本检测第65页
  (六) 统计学处理第65-66页
 三、实验结果第66-69页
  (一) 健康成年人血标本检测结果第66页
  (二) 发热外科患者血标本实时定量PCR检测结果第66-68页
  (三) 外科发热患者血培养结果第68-69页
 四、讨论第69-72页
第三部分 实时定量PCR检测白念珠菌在YPD培养基和血中对抗生素的敏感性第72-86页
 一、实验材料第74-76页
  (一) 主要仪器第74页
  (二) 试剂及耗材第74-75页
  (三) 菌种来源第75-76页
 二、实验方法第76-79页
  (一) YPD液体培养基配制第76页
  (二) 抗生素的稀释第76页
  (三) YPD液体培养基中药物敏感性试验第76-77页
  (四) 健康人全血中药物敏感性试验第77页
  (五) 基因组DNA的提取第77页
  (六) 引物和探针、标准品第77-78页
  (七) 实时定量PCR反应体系第78-79页
 三、实验结果第79-83页
  (一) YPD液体培养基中白念珠菌抗生素药物敏感性试验第79-81页
  (二) 健康人全血中白念珠菌抗生素药物敏感性试验第81-83页
 四、讨论第83-86页
文献综述第86-94页
参考文献第94-100页
致谢第100-101页
个人简历第101-102页

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