基因组尺度人类代谢网络的亚细胞及组织定位
中文摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-8页 |
第一章 绪论 | 第8-23页 |
·基因组尺度代谢网络构建 | 第8-11页 |
·人类基因组尺度代谢网络构建的研究现状 | 第11-14页 |
·研究意义 | 第14-15页 |
·人类代谢网络的亚细胞及组织定位 | 第15-20页 |
·人类代谢网络的亚细胞定位 | 第15-18页 |
·人类代谢网络的组织定位 | 第18-20页 |
·论文的主要内容 | 第20-21页 |
·论文结构 | 第21-23页 |
第二章 基因组尺度人类代谢网络的亚细胞定位 | 第23-40页 |
·亚细胞信息的初步获得 | 第23-28页 |
·蛋白亚细胞信息的初步获得 | 第23-26页 |
·反应亚细胞信息的初步获得 | 第26-28页 |
·基于途径连结性分析的亚细胞位置修正 | 第28-35页 |
·网络空白填补 | 第31-33页 |
·孤立反应修正 | 第33-35页 |
·基于文献的亚细胞位置修正 | 第35-36页 |
·亚细胞位置修正过程举例 | 第36-39页 |
·本章小结 | 第39-40页 |
第三章 基因组尺度人类代谢网络运输反应的添加 | 第40-52页 |
·基于Recon 1 的运输反应及蛋白 | 第40-41页 |
·基于数据库的运输反应及蛋白 | 第41-42页 |
·基于代谢末端分析的运输反应 | 第42-48页 |
·代谢末端查找 | 第42-44页 |
·运输反应添加 | 第44-48页 |
·来源编码添加 | 第48-49页 |
·EHMN与其他代谢网络的比较 | 第49-51页 |
·本章小结 | 第51-52页 |
第四章 基因组尺度人类代谢网络功能分析 | 第52-73页 |
·EHMN的途经分析 | 第52-65页 |
·途径分析工具分析方法 | 第52-53页 |
·氨基酸合成及降解途径分析 | 第53-58页 |
·氨基酸合成途径分析 | 第53-56页 |
·氨基酸降解途径分析 | 第56-58页 |
·核苷酸及脱氧核苷酸代谢途径分析 | 第58-62页 |
·脂肪酸代谢途径分析 | 第62页 |
·固醇、多聚糖及其他物质代谢途径分析 | 第62-65页 |
·EHMN主要亚细胞功能分析 | 第65-72页 |
·细胞质 | 第66-67页 |
·细胞核 | 第67页 |
·内质网 | 第67-69页 |
·高尔基体 | 第69-70页 |
·溶酶体 | 第70页 |
·过氧化物酶体 | 第70-71页 |
·线粒体 | 第71-72页 |
·本章小结 | 第72-73页 |
第五章 基因组尺度人类代谢网络的组织定位 | 第73-90页 |
·组织信息的初步获得 | 第73-75页 |
·蛋白组织信息的初步获得 | 第73-75页 |
·反应组织信息的初步获得 | 第75页 |
·基于途径连结性分析的组织位置修正 | 第75-81页 |
·网络空白填补 | 第76-79页 |
·孤立反应修正 | 第79-81页 |
·基于文献的组织位置修正 | 第81-82页 |
·组织位置修正过程举例 | 第82-85页 |
·EHMN与Recon 1 的比较 | 第85-89页 |
·本章小结 | 第89-90页 |
第六章 网络拓扑结构分析 | 第90-102页 |
·网络的拓扑结构参数 | 第90-92页 |
·网络密度 | 第90页 |
·网络直径和平均路径长度 | 第90-91页 |
·连接体 | 第91页 |
·蝴蝶结结构 | 第91-92页 |
·模块化指标 | 第92页 |
·网络解耦方法 | 第92-94页 |
·创建反应图 | 第92-93页 |
·根据分类树初步解耦网络 | 第93页 |
·网络解耦的优化 | 第93-94页 |
·线粒体、脑及总网络的基本拓扑性质 | 第94-96页 |
·线粒体代谢网络的结构与功能分析 | 第96-98页 |
·脑代谢网络的结构与功能分析 | 第98-101页 |
·本章小结 | 第101-102页 |
第七章 结论与展望 | 第102-105页 |
·结论与创新点 | 第102-103页 |
·结论 | 第102-103页 |
·主要创新点 | 第103页 |
·展望 | 第103-105页 |
参考文献 | 第105-114页 |
附录一一些名称的中英文对照 | 第114-116页 |
发表论文和科研情况说明 | 第116-117页 |
致谢 | 第117-118页 |