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基因组尺度人类代谢网络的亚细胞及组织定位

中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-8页
第一章 绪论第8-23页
   ·基因组尺度代谢网络构建第8-11页
   ·人类基因组尺度代谢网络构建的研究现状第11-14页
   ·研究意义第14-15页
   ·人类代谢网络的亚细胞及组织定位第15-20页
     ·人类代谢网络的亚细胞定位第15-18页
     ·人类代谢网络的组织定位第18-20页
   ·论文的主要内容第20-21页
   ·论文结构第21-23页
第二章 基因组尺度人类代谢网络的亚细胞定位第23-40页
   ·亚细胞信息的初步获得第23-28页
     ·蛋白亚细胞信息的初步获得第23-26页
     ·反应亚细胞信息的初步获得第26-28页
   ·基于途径连结性分析的亚细胞位置修正第28-35页
     ·网络空白填补第31-33页
     ·孤立反应修正第33-35页
   ·基于文献的亚细胞位置修正第35-36页
   ·亚细胞位置修正过程举例第36-39页
   ·本章小结第39-40页
第三章 基因组尺度人类代谢网络运输反应的添加第40-52页
   ·基于Recon 1 的运输反应及蛋白第40-41页
   ·基于数据库的运输反应及蛋白第41-42页
   ·基于代谢末端分析的运输反应第42-48页
     ·代谢末端查找第42-44页
     ·运输反应添加第44-48页
   ·来源编码添加第48-49页
   ·EHMN与其他代谢网络的比较第49-51页
   ·本章小结第51-52页
第四章 基因组尺度人类代谢网络功能分析第52-73页
   ·EHMN的途经分析第52-65页
     ·途径分析工具分析方法第52-53页
     ·氨基酸合成及降解途径分析第53-58页
       ·氨基酸合成途径分析第53-56页
       ·氨基酸降解途径分析第56-58页
     ·核苷酸及脱氧核苷酸代谢途径分析第58-62页
     ·脂肪酸代谢途径分析第62页
     ·固醇、多聚糖及其他物质代谢途径分析第62-65页
   ·EHMN主要亚细胞功能分析第65-72页
     ·细胞质第66-67页
     ·细胞核第67页
     ·内质网第67-69页
     ·高尔基体第69-70页
     ·溶酶体第70页
     ·过氧化物酶体第70-71页
     ·线粒体第71-72页
   ·本章小结第72-73页
第五章 基因组尺度人类代谢网络的组织定位第73-90页
   ·组织信息的初步获得第73-75页
     ·蛋白组织信息的初步获得第73-75页
     ·反应组织信息的初步获得第75页
   ·基于途径连结性分析的组织位置修正第75-81页
     ·网络空白填补第76-79页
     ·孤立反应修正第79-81页
   ·基于文献的组织位置修正第81-82页
   ·组织位置修正过程举例第82-85页
   ·EHMN与Recon 1 的比较第85-89页
   ·本章小结第89-90页
第六章 网络拓扑结构分析第90-102页
   ·网络的拓扑结构参数第90-92页
     ·网络密度第90页
     ·网络直径和平均路径长度第90-91页
     ·连接体第91页
     ·蝴蝶结结构第91-92页
     ·模块化指标第92页
   ·网络解耦方法第92-94页
     ·创建反应图第92-93页
     ·根据分类树初步解耦网络第93页
     ·网络解耦的优化第93-94页
   ·线粒体、脑及总网络的基本拓扑性质第94-96页
   ·线粒体代谢网络的结构与功能分析第96-98页
   ·脑代谢网络的结构与功能分析第98-101页
   ·本章小结第101-102页
第七章 结论与展望第102-105页
   ·结论与创新点第102-103页
     ·结论第102-103页
     ·主要创新点第103页
   ·展望第103-105页
参考文献第105-114页
附录一一些名称的中英文对照第114-116页
发表论文和科研情况说明第116-117页
致谢第117-118页

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