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金斑喙凤蝶(鳞翅目:凤蝶科)四个地理种群的线粒体基因组及其系统发育地位研究

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
1 前言第10-18页
   ·蝴蝶的概述第10-11页
   ·金斑喙凤蝶研究概况第11-14页
     ·分布第12页
     ·形态学特征第12页
     ·生活史研究第12-13页
     ·寄主植物第13-14页
   ·分子系统学在蝶类昆虫中的应用概况第14-15页
     ·分子系统学概述第14-15页
     ·系统发生学在昆虫中的应用第15页
   ·蝶类昆虫线粒体基因组研究概况第15-17页
     ·昆虫线粒体DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)的结构和特点第15-16页
     ·蛋白质编码基因第16页
     ·核糖体基因(rDNA)第16页
     ·蝶类昆虫线粒体基因组研究进展第16-17页
   ·金斑喙凤蝶分子生物学研究概况第17页
   ·研究目的和意义第17-18页
2 材料与方法第18-25页
   ·实验材料第18-19页
     ·实验主要试剂第18-19页
     ·实验仪器第19页
   ·实验方法第19-22页
     ·mtDNA全序列和系统发育分析实验流程第19页
     ·基因组DNA提取方法第19-20页
     ·目的片段的PCR扩增第20-22页
     ·PCR产物的纯化和测序第22页
   ·数据处理第22-25页
     ·数据来源及外群确定第22-24页
     ·序列拼接和注释第24页
     ·系统发育树的建立第24-25页
3 金斑喙凤蝶线粒体基因全序列研究第25-39页
   ·线粒体基因组特征比较第25-31页
   ·蛋白质编码基因第31-34页
   ·tRNA基因与rRNA基因第34-37页
   ·A+T丰富区第37-39页
4 基于线粒体全序列的47种蝶类的系统发育第39-52页
   ·碱基替换和遗传距离分析第39-42页
     ·基于12SrRNA基因数据分析第39页
     ·基于16SrRNA基因数据分析第39-40页
     ·基于蛋白质编码基因数据分析第40-42页
   ·发育信号分析第42-46页
     ·碱基替换饱和性分析第42页
     ·树长分布偏斜性检验(g1检验)第42-46页
   ·系统发育分析第46-51页
     ·基于12SrRNA基因的系统发育分析第46页
     ·基于16SrRNA基因的系统发育分析第46-49页
     ·基于蛋白质编码基因的系统发育分析第49-51页
   ·分子发育关系结果讨论第51-52页
参考文献第52-57页
附录Ⅰ 基于12SrRNA、16SrRNA和总蛋白质编码基因的47种蝶类遗传距离和转换/颠换值(R值第57-63页
附录Ⅱ 基于13个蛋白质编码基因的47种蝶类系统发育树(MP树)第63-67页
附录Ⅲ 基于13个蛋白质编码基因的金斑喙凤蝶不同地理亚种系统发育树(MP树)第67-68页
攻读硕士学位期间发表的论文第68-69页
致谢第69-70页

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