| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-27页 |
| 1 暗纹东方鱿的研究概况 | 第11-14页 |
| ·暗纹东方纯的分类地位,分布及外部形态特征 | 第11页 |
| ·暗纹东方纯的生活习性 | 第11-12页 |
| ·暗纹东方纯的繁殖习性 | 第12页 |
| ·暗纹东方纯的苗种培育和人工养殖技术研究 | 第12-13页 |
| ·暗纹东方纯的经济意义 | 第13页 |
| ·暗纹东方纯分子遗传学研究 | 第13-14页 |
| 2 分子标记在鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第14-20页 |
| ·基于RFLP标记技术研究 | 第15-16页 |
| ·基于RAPD标记技术研究 | 第16-17页 |
| ·基于AFLP标记技术研究 | 第17-18页 |
| ·基于SRAP标记技术研究 | 第18页 |
| ·基于TRAP标记技术研究 | 第18-19页 |
| ·基于线粒体DNA标记技术研究 | 第19页 |
| ·基于SNP标记技术研究 | 第19-20页 |
| 3 微卫星分子标记及其在水产动物研究中的应用 | 第20-25页 |
| ·微卫星(mieorsatellite)DNA的定义 | 第20页 |
| ·微卫星分子标记的优点和缺点 | 第20-21页 |
| ·微卫星序列的获得 | 第21-22页 |
| ·利用近缘物种的微卫星序列 | 第21页 |
| ·寻找已经发表的微卫星序列或引物 | 第21页 |
| ·基因组文库测序法 | 第21-22页 |
| ·富集微卫星分离法 | 第22页 |
| ·微卫星在水产动物研究中的应用 | 第22-25页 |
| ·遗传多样性和遗传结构分析 | 第22-23页 |
| ·遗传图谱构建 | 第23-24页 |
| ·数量性状定位 | 第24页 |
| ·亲缘关系分析 | 第24页 |
| ·进化方面的应用 | 第24-25页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第25-27页 |
| 第二章 红鳍东方纯微卫星标记对的暗纹东方纯适用性 | 第27-35页 |
| 1. 实验材料和方法 | 第27-30页 |
| ·实验材料 | 第27页 |
| ·主要仪器设备、试剂和配制方法 | 第27-29页 |
| ·主要仪器设备 | 第27-28页 |
| ·主要药品和试剂 | 第28页 |
| ·主要试剂配制 | 第28-29页 |
| ·实验方法 | 第29-30页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第29页 |
| ·基因组DNA电泳检测 | 第29-30页 |
| ·微卫星引物筛选和PCR扩增 | 第30页 |
| ·微卫星PCR产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第30页 |
| ·银染检测 | 第30页 |
| 2 结果与分析 | 第30-33页 |
| ·暗纹东方纯肌肉组织基因组DNA提取结果 | 第31-33页 |
| ·微卫星引物筛选结果 | 第33页 |
| 3 讨论 | 第33-35页 |
| 第三章 暗纹东方纯4个群体的遗传多样性分析 | 第35-47页 |
| 1 材料和方法 | 第35-37页 |
| ·材料来源 | 第35页 |
| ·基因组DNA提取 | 第35-36页 |
| ·微卫星引物合成 | 第36页 |
| ·P C R扩增及产物电泳检测 | 第36页 |
| ·数据处理 | 第36-37页 |
| ·有效等位基因数(Effective number of alleles,Ne) | 第36页 |
| ·杂合度(Heterozygosity,H) | 第36页 |
| ·遗传相似系数(Genetic identity,I) | 第36页 |
| ·遗传距离(Genetic distance,D) | 第36-37页 |
| ·基因分化系数(Fixation index,Fst) | 第37页 |
| ·基因流(Gene flow,Nm) | 第37页 |
| ·Hardy—Weinberg平衡偏离指数 | 第37页 |
| ·多态信息含量(Polymorphism Information Content,PIC) | 第37页 |
| 2 结果与分析 | 第37-44页 |
| ·微卫星PCR结果 | 第37页 |
| ·遗传多样性分析 | 第37-41页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡分析 | 第41-43页 |
| ·群体遗传结构分析 | 第43-44页 |
| ·基因流和种群分化指数 | 第43-44页 |
| ·遗传相似系数和遗传距离 | 第44页 |
| ·聚类分析 | 第44页 |
| 3 讨论 | 第44-47页 |
| ·引物适用性 | 第44-45页 |
| ·群体遗传多样性分析 | 第45-46页 |
| ·群体Hadery-Weinberg平衡检测 | 第46页 |
| ·群体间遗传结构分析 | 第46-47页 |
| 第四章 暗纹东方纯SRAP-PCR体系的建立 | 第47-55页 |
| 1 材料与方法 | 第47-48页 |
| ·材料和试剂 | 第47页 |
| ·基因组DNA提取 | 第47页 |
| ·PCR反应 | 第47页 |
| ·正交设计及优化体系的检验 | 第47-48页 |
| 2 结果与分析 | 第48-53页 |
| ·正交试验结果及分析 | 第48页 |
| ·因素内各水平对PCR结果的影响 | 第48-53页 |
| ·Mg~(2+)浓度对PCR结果的影响 | 第48页 |
| ·Taq酶用量对PCR结果的影响 | 第48-49页 |
| ·模板DNA含量对PCR结果的影响 | 第49页 |
| ·dNTPs浓度对PCR结果的影响 | 第49-52页 |
| ·引物浓度对PCR结果的影响 | 第52-53页 |
| ·体系验证 | 第53页 |
| 3 讨论 | 第53-55页 |
| 第五章 利用SRAP标记研究暗纹东方纯群体4个群体的遗传多样性 | 第55-65页 |
| 1 实验材料和方法 | 第55-56页 |
| ·实验材料 | 第55页 |
| ·基因组DNA提取 | 第55-56页 |
| ·SRAP-PCR反应 | 第56页 |
| ·电泳检测 | 第56页 |
| ·数据处理与分析 | 第56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-61页 |
| ·SRAP引物筛选和扩增图谱 | 第56页 |
| ·群体遗传多样性分析 | 第56-60页 |
| ·群体变异分析 | 第60页 |
| ·遗传距离和聚类分析 | 第60-61页 |
| 3 讨论 | 第61-65页 |
| ·SRAP技术在暗纹东方纯种质资源研究中的可靠性 | 第61-62页 |
| ·遗传多样性水平 | 第62页 |
| ·群体遗传分化分析 | 第62-63页 |
| ·遗传多样性保护与利用 | 第63页 |
| ·SSR和SRAP两种分子标记结果的比较 | 第63-65页 |
| 全文结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-79页 |
| 致谢 | 第79-81页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第81页 |
