以LpxC为靶点的新型抗菌药物计算机虚拟筛选、先导物优化及活性研究
| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 符号说明 | 第14-15页 |
| 第一章 前言 | 第15-30页 |
| ·细菌的感染与致病机制 | 第15-16页 |
| ·抗菌药物的研究进展 | 第16-17页 |
| ·细菌的耐药机制 | 第17-18页 |
| ·抗菌新靶点LpxC | 第18-25页 |
| ·LpxC的作用机制 | 第18-20页 |
| ·LpxC的结构 | 第20-25页 |
| ·LpxC抑制剂的研究进展 | 第25-29页 |
| ·本论文工作的研究意义 | 第29-30页 |
| 第二章 以LpxC为靶点的计算机虚拟筛选 | 第30-86页 |
| ·引言 | 第30-31页 |
| ·虚拟筛选的策略及流程 | 第31-35页 |
| ·类药性评价筛选 | 第35-36页 |
| ·分子对接筛选 | 第36-43页 |
| ·靶点蛋白的选择 | 第36-38页 |
| ·对接参数设定 | 第38-40页 |
| ·Glide对接打分评价函数 | 第40-41页 |
| ·对接方法适用性考察 | 第41-42页 |
| ·对接结果的选取 | 第42-43页 |
| ·基于受体结构的药效团模型筛选 | 第43-48页 |
| ·基于受体结构的药效团模型(SBP)的构建 | 第43-47页 |
| ·SBP药效团模型的验证及筛选结果 | 第47-48页 |
| ·分子结构的聚类分析及手动挑选 | 第48-50页 |
| ·结果与讨论 | 第50-86页 |
| ·SPECS库筛选结果 | 第50-62页 |
| ·CMC库筛选结果 | 第62-85页 |
| ·实验室已合成化合物汇总及其筛选结果 | 第85-86页 |
| 第三章 LpxC抑制剂先导物的结构改造 | 第86-117页 |
| ·LpxC抑制剂先导结构的选择 | 第86-89页 |
| ·构建基于配体的药效团模型 | 第89-92页 |
| ·Che-Mapper骨架跃迁 | 第92-97页 |
| ·Topomer Search先导物跃迁 | 第97-101页 |
| ·全新药物设计 | 第101-111页 |
| ·自行设计的药物片段及分子 | 第111-115页 |
| ·小结与讨论 | 第115-117页 |
| 第四章 筛选化合物的抗菌活性测定 | 第117-137页 |
| ·实验原理 | 第117页 |
| ·实验材料 | 第117-118页 |
| ·实验方法 | 第118-124页 |
| ·MIC测定结果 | 第124-128页 |
| ·小结与讨论 | 第128-137页 |
| 第五章 总结与展望 | 第137-141页 |
| ·实验总结 | 第137-138页 |
| ·展望 | 第138-141页 |
| 参考文献 | 第141-146页 |
| 致谢 | 第146-148页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第148-149页 |
| 附件 | 第149-156页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第156页 |
