中文摘要 | 第1-10页 |
英文摘要 | 第10-13页 |
前言 | 第13-14页 |
第一章 同源探针的制备和cDNA文库的筛选 | 第14-22页 |
1 材料和方法 | 第14-17页 |
·材料 | 第14-15页 |
·藻种 | 第14页 |
·菌种 | 第14页 |
·试剂和试剂盒 | 第14页 |
·盐生杜氏藻培养基 | 第14-15页 |
·仪器 | 第15页 |
·方法 | 第15-17页 |
·盐生杜氏藻的培养 | 第15页 |
·盐生杜氏藻总RNA的提取 | 第15页 |
·总RNA质量的检测 | 第15页 |
·反转录PCR | 第15-16页 |
·探针扩增引物的设计 | 第16页 |
·核酸探针的扩增和纯化 | 第16-17页 |
·探针的标记和文库筛选 | 第17页 |
·测序 | 第17页 |
·EST的拼接和初步的BLASTX分析 | 第17页 |
2 结果与分析 | 第17-19页 |
·盐藻总RNA的质量检测 | 第17-18页 |
·引物的各项参数 | 第18页 |
·核酸探针的PCR扩增 | 第18页 |
·盐生杜氏藻cDNA文库筛选后的测序结果 | 第18-19页 |
3 讨论 | 第19-22页 |
·获得高质量的总RNA | 第19-20页 |
·探针引物的设计和杂交温度的选择 | 第20页 |
·测序和序列的拼接 | 第20-22页 |
第二章 盐生杜氏藻DsLhcII-3基因cDNA的全长克隆 | 第22-28页 |
1 材料和方法 | 第22-24页 |
·材料 | 第22页 |
·藻种 | 第22页 |
·菌种 | 第22页 |
·试剂和试剂盒 | 第22页 |
·盐生杜氏藻培养基 | 第22页 |
·仪器 | 第22页 |
·方法 | 第22-24页 |
·盐生杜氏藻的培养 | 第22-23页 |
·盐生杜氏藻总RNA的提取及质量的检测 | 第23页 |
·5’RACE的反转录反应 | 第23页 |
·5’RACE引物的设计 | 第23页 |
·5’RACE的PCR反应 | 第23-24页 |
·胶回收和TA克隆 | 第24页 |
·全长cDNA序列的拼接 | 第24页 |
2 结果与分析 | 第24-26页 |
·5’RACE特异扩增引物的设计 | 第25页 |
·5’RACE的结果 | 第25-26页 |
·测序结果的拼接 | 第26页 |
3 讨论 | 第26-28页 |
·5’RACE引物的设计 | 第26-27页 |
·5’RACE的PCR反应条件优化 | 第27-28页 |
第三章 盐生杜氏藻DsLhcII基因组序列的克隆 | 第28-37页 |
1 材料和方法 | 第28-31页 |
·材料 | 第28-29页 |
·藻种 | 第28页 |
·菌种 | 第28页 |
·试剂和试剂盒 | 第28页 |
·盐生杜氏藻培养基 | 第28页 |
·仪器 | 第28-29页 |
·方法 | 第29-31页 |
·盐生杜氏藻的培养 | 第29页 |
·盐生杜氏藻基因组的提取 | 第29页 |
·基因组扩增引物的设计 | 第29-30页 |
·PCR反应 | 第30页 |
·胶回收和TA克隆 | 第30-31页 |
·内含子结构的分析 | 第31页 |
2 结果与分析 | 第31-35页 |
·盐生杜氏藻基因组DNA的提取 | 第31-32页 |
·盐生杜氏藻DsLhcII基因组序列的扩增 | 第32-33页 |
·盐生杜氏藻DsLhcII基因内含子结构的分析 | 第33-35页 |
3 讨论 | 第35-37页 |
·盐生杜氏藻基因组的提取 | 第35-36页 |
·基因扩增引物的设计 | 第36页 |
·基因内含子的确定 | 第36-37页 |
第四章 盐生杜氏藻DsLhcii基因的生物信息学分析 | 第37-58页 |
1 分析方法 | 第37-38页 |
·核苷酸序列的相关分析 | 第37-38页 |
·GC含量的分布 | 第37页 |
·ORF分析 | 第37页 |
·相似性搜索 | 第37页 |
·核苷酸的多重序列比对 | 第37-38页 |
·蛋白质序列的相关分析 | 第38页 |
·蛋白质的基本性质分析 | 第38页 |
·蛋白质的多重序列比对 | 第38页 |
·蛋白质细胞定位的预测 | 第38页 |
·跨膜结构预测 | 第38页 |
·转运肽的预测 | 第38页 |
·功能结构域预测 | 第38页 |
·三级结构的预测 | 第38页 |
·系统发育分析 | 第38页 |
2 结果与分析 | 第38-55页 |
·核苷酸序列的相关分析 | 第39-42页 |
·GC含量分布图 | 第39-41页 |
·ORF分析 | 第41页 |
·相似性搜索 | 第41页 |
·核苷酸的多重序列比对 | 第41-42页 |
·蛋白质序列的相关分析 | 第42-55页 |
·蛋白质的基本性质分析 | 第42页 |
·蛋白质的多重序列比对 | 第42-46页 |
·蛋白质的细胞定位 | 第46-47页 |
·跨膜结构预测 | 第47-49页 |
·转运肽的预测 | 第49-50页 |
·功能结构域预测 | 第50-52页 |
·三级结构的预测 | 第52-54页 |
·系统发育分析 | 第54-55页 |
3 讨论 | 第55-58页 |
·DsLhcII-2.1和DsLhcII-2.2 | 第55-56页 |
·跨膜结构预测结果的讨论 | 第56页 |
·转运肽预测结果的讨论 | 第56-58页 |
第五章 盐生杜氏藻DsLhcII-3基因的差异表达研究 | 第58-69页 |
1 材料和方法 | 第58-60页 |
·材料 | 第58-59页 |
·藻种 | 第58页 |
·菌种 | 第58页 |
·试剂和试剂盒 | 第58页 |
·盐生杜氏藻培养基 | 第58页 |
·仪器 | 第58-59页 |
·方法 | 第59-60页 |
·盐生杜氏藻的培养条件 | 第59页 |
·盐生杜氏藻总RNA的提取及质量的检测 | 第59页 |
·反转录反应 | 第59页 |
·内参基因的选择 | 第59页 |
·特异引物和内参引物的设计 | 第59-60页 |
·引物的验证 | 第60页 |
·荧光定量 PCR | 第60页 |
·实验结果的处理 | 第60页 |
2 结果与分析 | 第60-65页 |
·引物参数 | 第60-61页 |
·引物的验证 | 第61-62页 |
·荧光定量PCR的结果 | 第62-65页 |
3 讨论 | 第65-69页 |
·研究盐藻LHCII蛋白基因差异表达的方法 | 第65页 |
·荧光定量PCR的原理和引物设计要求 | 第65-66页 |
·荧光定量PCR的研究方法 | 第66-67页 |
·荧光定量PCR条件优化 | 第67-68页 |
·LHCII蛋白基因的差异表达 | 第68-69页 |
第六章 盐生杜氏藻DsLhcII-3基因的原核表达研究 | 第69-79页 |
1 材料和方法 | 第69-73页 |
·材料 | 第69-70页 |
·菌株和质粒 | 第69页 |
·试剂和试剂盒 | 第69-70页 |
·仪器 | 第70页 |
·方法 | 第70-73页 |
·盐生杜氏藻DsLhcII-3基因ORF扩增引物的设计 | 第70页 |
·ORF序列的扩增 | 第70页 |
·TA克隆和测序 | 第70-71页 |
·重组表达载体的构建 | 第71页 |
·SDS聚丙烯酰胺凝胶的配制 | 第71-72页 |
·样品的制备和电泳 | 第72页 |
·凝胶染色 | 第72-73页 |
·通过金属螯合亲和层析纯化DsLhcII-3蛋白 | 第73页 |
2 结果与分析 | 第73-78页 |
·引物参数 | 第73页 |
·ORF序列的扩增 | 第73-74页 |
·TA克隆和测序 | 第74-75页 |
·构建重组表达载体 | 第75-76页 |
·SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第76页 |
·蛋白的纯化 | 第76-78页 |
3 讨论 | 第78-79页 |
·表达载体和酶切位点的选择 | 第78页 |
·盐藻DsLhcII-3原核表达蛋白的应用 | 第78-79页 |
结论 | 第79-81页 |
致谢 | 第81-82页 |
综述 | 第82-93页 |
参考文献 | 第93-97页 |
在校期间学习情况 | 第97-98页 |