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盐生杜氏藻光系统Ⅱ主要捕光叶绿素a/b结合蛋白基因的克隆与表达研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-13页
前言第13-14页
第一章 同源探针的制备和cDNA文库的筛选第14-22页
 1 材料和方法第14-17页
   ·材料第14-15页
     ·藻种第14页
     ·菌种第14页
     ·试剂和试剂盒第14页
     ·盐生杜氏藻培养基第14-15页
     ·仪器第15页
   ·方法第15-17页
     ·盐生杜氏藻的培养第15页
     ·盐生杜氏藻总RNA的提取第15页
     ·总RNA质量的检测第15页
     ·反转录PCR第15-16页
     ·探针扩增引物的设计第16页
     ·核酸探针的扩增和纯化第16-17页
     ·探针的标记和文库筛选第17页
     ·测序第17页
     ·EST的拼接和初步的BLASTX分析第17页
 2 结果与分析第17-19页
   ·盐藻总RNA的质量检测第17-18页
   ·引物的各项参数第18页
   ·核酸探针的PCR扩增第18页
   ·盐生杜氏藻cDNA文库筛选后的测序结果第18-19页
 3 讨论第19-22页
   ·获得高质量的总RNA第19-20页
   ·探针引物的设计和杂交温度的选择第20页
   ·测序和序列的拼接第20-22页
第二章 盐生杜氏藻DsLhcII-3基因cDNA的全长克隆第22-28页
 1 材料和方法第22-24页
   ·材料第22页
     ·藻种第22页
     ·菌种第22页
     ·试剂和试剂盒第22页
     ·盐生杜氏藻培养基第22页
     ·仪器第22页
   ·方法第22-24页
     ·盐生杜氏藻的培养第22-23页
     ·盐生杜氏藻总RNA的提取及质量的检测第23页
     ·5’RACE的反转录反应第23页
     ·5’RACE引物的设计第23页
     ·5’RACE的PCR反应第23-24页
     ·胶回收和TA克隆第24页
     ·全长cDNA序列的拼接第24页
 2 结果与分析第24-26页
   ·5’RACE特异扩增引物的设计第25页
   ·5’RACE的结果第25-26页
   ·测序结果的拼接第26页
 3 讨论第26-28页
   ·5’RACE引物的设计第26-27页
   ·5’RACE的PCR反应条件优化第27-28页
第三章 盐生杜氏藻DsLhcII基因组序列的克隆第28-37页
 1 材料和方法第28-31页
   ·材料第28-29页
     ·藻种第28页
     ·菌种第28页
     ·试剂和试剂盒第28页
     ·盐生杜氏藻培养基第28页
     ·仪器第28-29页
   ·方法第29-31页
     ·盐生杜氏藻的培养第29页
     ·盐生杜氏藻基因组的提取第29页
     ·基因组扩增引物的设计第29-30页
     ·PCR反应第30页
     ·胶回收和TA克隆第30-31页
     ·内含子结构的分析第31页
 2 结果与分析第31-35页
   ·盐生杜氏藻基因组DNA的提取第31-32页
   ·盐生杜氏藻DsLhcII基因组序列的扩增第32-33页
   ·盐生杜氏藻DsLhcII基因内含子结构的分析第33-35页
 3 讨论第35-37页
   ·盐生杜氏藻基因组的提取第35-36页
   ·基因扩增引物的设计第36页
   ·基因内含子的确定第36-37页
第四章 盐生杜氏藻DsLhcii基因的生物信息学分析第37-58页
 1 分析方法第37-38页
   ·核苷酸序列的相关分析第37-38页
     ·GC含量的分布第37页
     ·ORF分析第37页
     ·相似性搜索第37页
     ·核苷酸的多重序列比对第37-38页
   ·蛋白质序列的相关分析第38页
     ·蛋白质的基本性质分析第38页
     ·蛋白质的多重序列比对第38页
     ·蛋白质细胞定位的预测第38页
     ·跨膜结构预测第38页
     ·转运肽的预测第38页
     ·功能结构域预测第38页
     ·三级结构的预测第38页
     ·系统发育分析第38页
 2 结果与分析第38-55页
   ·核苷酸序列的相关分析第39-42页
     ·GC含量分布图第39-41页
     ·ORF分析第41页
     ·相似性搜索第41页
     ·核苷酸的多重序列比对第41-42页
   ·蛋白质序列的相关分析第42-55页
     ·蛋白质的基本性质分析第42页
     ·蛋白质的多重序列比对第42-46页
     ·蛋白质的细胞定位第46-47页
     ·跨膜结构预测第47-49页
     ·转运肽的预测第49-50页
     ·功能结构域预测第50-52页
     ·三级结构的预测第52-54页
     ·系统发育分析第54-55页
 3 讨论第55-58页
   ·DsLhcII-2.1和DsLhcII-2.2第55-56页
   ·跨膜结构预测结果的讨论第56页
   ·转运肽预测结果的讨论第56-58页
第五章 盐生杜氏藻DsLhcII-3基因的差异表达研究第58-69页
 1 材料和方法第58-60页
   ·材料第58-59页
     ·藻种第58页
     ·菌种第58页
     ·试剂和试剂盒第58页
     ·盐生杜氏藻培养基第58页
     ·仪器第58-59页
   ·方法第59-60页
     ·盐生杜氏藻的培养条件第59页
     ·盐生杜氏藻总RNA的提取及质量的检测第59页
     ·反转录反应第59页
     ·内参基因的选择第59页
     ·特异引物和内参引物的设计第59-60页
     ·引物的验证第60页
     ·荧光定量 PCR第60页
     ·实验结果的处理第60页
 2 结果与分析第60-65页
   ·引物参数第60-61页
   ·引物的验证第61-62页
   ·荧光定量PCR的结果第62-65页
 3 讨论第65-69页
   ·研究盐藻LHCII蛋白基因差异表达的方法第65页
   ·荧光定量PCR的原理和引物设计要求第65-66页
   ·荧光定量PCR的研究方法第66-67页
   ·荧光定量PCR条件优化第67-68页
   ·LHCII蛋白基因的差异表达第68-69页
第六章 盐生杜氏藻DsLhcII-3基因的原核表达研究第69-79页
 1 材料和方法第69-73页
   ·材料第69-70页
     ·菌株和质粒第69页
     ·试剂和试剂盒第69-70页
     ·仪器第70页
   ·方法第70-73页
     ·盐生杜氏藻DsLhcII-3基因ORF扩增引物的设计第70页
     ·ORF序列的扩增第70页
     ·TA克隆和测序第70-71页
     ·重组表达载体的构建第71页
     ·SDS聚丙烯酰胺凝胶的配制第71-72页
     ·样品的制备和电泳第72页
     ·凝胶染色第72-73页
     ·通过金属螯合亲和层析纯化DsLhcII-3蛋白第73页
 2 结果与分析第73-78页
   ·引物参数第73页
   ·ORF序列的扩增第73-74页
   ·TA克隆和测序第74-75页
   ·构建重组表达载体第75-76页
   ·SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳第76页
   ·蛋白的纯化第76-78页
 3 讨论第78-79页
   ·表达载体和酶切位点的选择第78页
   ·盐藻DsLhcII-3原核表达蛋白的应用第78-79页
结论第79-81页
致谢第81-82页
综述第82-93页
参考文献第93-97页
在校期间学习情况第97-98页

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