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用多相分类确定分离自菜豆、杭子梢和决明的根瘤菌的分类地位

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
1.文献综述第12-44页
   ·引言第12-13页
   ·根瘤菌的分类历史第13-34页
     ·根瘤菌的发现第14页
     ·以互接种族为依据的传统分类第14-17页
     ·以系统发育为基础的现代分类第17-25页
     ·多相分类在根瘤菌分类中的应用第25-34页
   ·根瘤菌分类的最新进展第34-44页
2.研究目标第44-46页
   ·分离自菜豆、杭子梢和决明的根瘤菌的分类现状第44-45页
   ·研究目标第45-46页
3.材料和方法第46-65页
   ·菌株第46页
   ·菌株的纯化和保藏第46页
   ·数值分类第46-53页
   ·全细胞可溶性蛋白电泳第53-55页
   ·rep-PCR指纹分析第55-57页
   ·16S rDNA PCR-RFLP第57-59页
   ·G+C mol%和DNA-DNA杂交第59-63页
   ·16S rDNA全序列测定及系统发育分析第63-65页
4.结果第65-96页
   ·数值分类第65-74页
     ·分离自菜豆、杭子梢和决明的根瘤菌的一般性状第65页
     ·数值分类聚类结果第65-66页
     ·中心菌株的确定第66-69页
     ·鉴别特征的确定第69-74页
   ·全细胞可溶性蛋白电泳第74-77页
   ·rep-PCR指纹分析第77-84页
   ·16S rDNA PCR-RFLP第84-90页
     ·16S rRNA基因的扩增第84页
     ·16S rDNA PCR-RFLP遗传类型谱第84页
     ·16S rDNA PCR-RLFP的聚类结果第84-90页
   ·G+Cmol%测定及DNA-DNA杂交第90-92页
     ·G+Cmol%测定结果第90页
     ·DNA-DNA杂交结果第90-92页
   ·16S rRNA基因全序列测定第92-96页
     ·数值分类中群1、3、4、6的中心菌株及已知根瘤菌的16S rDNA序列第92页
     ·16S rDNA系统发育树第92-96页
5.讨论第96-105页
   ·本研究采用多相分类技术的效果第96-101页
     ·数值分类初步确定分离自菜豆、杭子梢和决明的根瘤菌的分类地位第96页
     ·全细胞可溶性蛋白电泳是一种快速可靠的分群方法第96-97页
     ·rep-PCR指纹图谱分析中数据合并的效果分析第97-98页
     ·16S rDNA PCR-RFLP与基于16S rDNA全序列的系统发育分析有较好的一致性第98-100页
     ·DNA-DNA杂交和系统发育分析确定分离自菜豆、杭子梢和决明的根瘤菌的分类地位第100-101页
   ·分离自菜豆、杭子梢和决明的根瘤菌的多样性第101-103页
   ·总结第103-105页
参考文献第105-121页
附录1 数值分类原始数据表中菌号所对应的菌株号第121-122页
附录2 数值分类原始数据第122-134页
附录3 全细胞可溶性蛋白电泳原始数据第134-137页
附录4 rep-PCR指纹分析原始数据第137-141页
附录5 16S rDNA PCR-RFLP原始数据第141-143页
附录6 数值分类群1、3、4、6中心菌株及已知根瘤菌16S rDNA全序列第143-164页
附录7 实验中所用培养基及试剂配方第164-169页
致谢第169-170页

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