| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-33页 |
| ·分子系统发育研究概况 | 第15-21页 |
| ·系统进化树的构建方法 | 第15-17页 |
| ·分子进化和分子钟 | 第17页 |
| ·分子进化的动力 | 第17-19页 |
| ·分子进化的中性理论 | 第19页 |
| ·密码子水平适应性进化的检测 | 第19-21页 |
| ·动物线粒体基因组及系统发育研究进展 | 第21-27页 |
| ·线粒体基因组结构研究 | 第21-23页 |
| ·碱基组成 | 第23-24页 |
| ·与核DNA 相比,动物线粒体基因组的特点 | 第24-25页 |
| ·动物线粒体DNA 的分子系统学研究 | 第25-26页 |
| ·线粒体DNA 的提取及全序列的测定 | 第26-27页 |
| ·线粒体DNA 与山羊起源驯化 | 第27-31页 |
| ·我国山羊品种资源 | 第27-28页 |
| ·山羊遗传多样性研究概况 | 第28-29页 |
| ·山羊的多母系起源 | 第29页 |
| ·数据分析方法 | 第29-31页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| ·本研究的技术路线 | 第32-33页 |
| 第二章 山羊线粒体高变区分析 | 第33-64页 |
| ·材料与方法 | 第33-41页 |
| ·样品的采集 | 第33-34页 |
| ·试验方法 | 第34-41页 |
| ·结果 | 第41-58页 |
| ·基因组DNA 的提取结果检测 | 第41-42页 |
| ·PCR 产物的扩增结果 | 第42页 |
| ·PCR-SSCP 的结果分析 | 第42-44页 |
| ·线粒体D-loop 第一高变区序列扩增及克隆测序 | 第44-46页 |
| ·线粒体高变区序列及群体结构分析 | 第46-47页 |
| ·利用 D-Loop 高变区序列进行系统进化分析 | 第47页 |
| ·网络关系分析 | 第47页 |
| ·群体扩张分析 | 第47-52页 |
| ·群体间关系分析 | 第52-57页 |
| ·分化时间的估计 | 第57页 |
| ·4 个支系D-loop 高变区部分序列变异位点分析 | 第57-58页 |
| ·讨论 | 第58-64页 |
| ·中国山羊品种的多样性及地理关系 | 第58-61页 |
| ·山羊mtDNA B 支系的起源 | 第61-62页 |
| ·山羊线粒体高变区各支系的碱基变异特点 | 第62页 |
| ·山羊的群体扩张及分化时间 | 第62-64页 |
| 第三章 山羊线粒体全序列分析 | 第64-96页 |
| ·材料与方法 | 第64-67页 |
| ·样品的选择 | 第64页 |
| ·测序引物 | 第64-66页 |
| ·PCR 反应的体系和条件 | 第66页 |
| ·PCR 产物纯化与连接、转化、克隆 | 第66页 |
| ·统计分析 | 第66-67页 |
| ·结果 | 第67-91页 |
| ·PCR 扩增及回收 | 第67-68页 |
| ·克隆测序 | 第68-69页 |
| ·序列拼接、比对及DNA 序列多态性 | 第69页 |
| ·山羊线粒体编码基因的结构和组成 | 第69-74页 |
| ·山羊线粒体全基因组中的超级保守序列 | 第74-75页 |
| ·tRNA 和rRNA 结构分析 | 第75-81页 |
| ·山羊全序列核苷酸组成及与其它物种的相似度分析 | 第81-84页 |
| ·达尔文正选择检测 | 第84-89页 |
| ·物种内正选择检测 | 第89-91页 |
| ·讨论 | 第91-96页 |
| ·4 个山羊支系蛋白编码基因的变异 | 第91-92页 |
| ·分化时间的估计 | 第92-94页 |
| ·线粒体全序列与系统进化 | 第94-96页 |
| 第四章 全文结论 | 第96-98页 |
| ·利用线粒体高变区序列分析了中国12 个山羊品种的群体结构 | 第96页 |
| ·网络关系及群体扩张分析 | 第96页 |
| ·B 支系的起源 | 第96页 |
| ·4 个支系D-loop 高变区部分序列变异位点分析 | 第96页 |
| ·4 个支系DNA 序列多态性及氨基酸序列差异 | 第96-97页 |
| ·山羊线粒体全基因组中的超级保守序列 | 第97页 |
| ·tRNA 和rRNA 结构分析 | 第97页 |
| ·达尔文正选择检测 | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-108页 |
| 附录 | 第108-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 作者简历 | 第116页 |
