| 图目录 | 第1-7页 |
| 表目录 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| ·课题背景 | 第10-11页 |
| ·基于XML的生物信息数据管理的研究现状 | 第11-13页 |
| ·生物信息数据管理平台 | 第11页 |
| ·XML数据存储和查询优化 | 第11-13页 |
| ·本文主要工作 | 第13-14页 |
| ·各章内容安排 | 第14-15页 |
| 第二章 生物信息数据管理平台MyWorkSpace | 第15-21页 |
| ·MyWorkSpace项目背景 | 第15-17页 |
| ·MyWorkSpace数据处理流程 | 第17-18页 |
| ·生物信息数据提交 | 第18-19页 |
| ·数据转换 | 第18-19页 |
| ·数据导入 | 第19页 |
| ·生物信息数据存储与发布 | 第19-21页 |
| ·数据入库 | 第19-20页 |
| ·数据发布 | 第20-21页 |
| 第三章 生物信息数据转换 | 第21-29页 |
| ·生物信息数据存储格式 | 第21-23页 |
| ·原始生物数据的管理 | 第21-22页 |
| ·XML表示和存储数据 | 第22-23页 |
| ·生物信息数据转换为XML文档 | 第23-29页 |
| ·Txt2xml转换规则 | 第23-24页 |
| ·转换实现 | 第24-26页 |
| ·提取规则 | 第26页 |
| ·提取实现 | 第26-29页 |
| 第四章 MyWorkSpace日志管理 | 第29-36页 |
| ·日志管理系统总体结构 | 第29页 |
| ·日志管理关键技术 | 第29-32页 |
| ·用户权限管理 | 第29-32页 |
| ·同步更新 | 第32页 |
| ·日志管理系统实现 | 第32-35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第五章 生物信息数据的Web发布 | 第36-41页 |
| ·服务器架构 | 第36-37页 |
| ·用户权限管理 | 第37页 |
| ·Web发布 | 第37-40页 |
| ·生物信息数据Web发布方式 | 第37-40页 |
| ·生物信息数据Web查询 | 第40页 |
| ·小结 | 第40-41页 |
| 第六章 面向生物信息数据的XML查询优化 | 第41-58页 |
| ·基于生物信息数据特点的全路径索引方法 | 第41-44页 |
| ·现有的一些索引结构的分析 | 第41-42页 |
| ·基于Lucene的全路径索引 | 第42-43页 |
| ·性能测试及评价 | 第43-44页 |
| ·XML数据库查询优化 | 第44-50页 |
| ·XML数据的模式信息提取 | 第44-46页 |
| ·基于模式信息的路径表达式优化 | 第46-50页 |
| ·性能测试及评价 | 第50页 |
| ·XQuery查询处理的代数优化 | 第50-58页 |
| ·XQuery查询引擎 | 第50页 |
| ·XQuery实现的总体结构 | 第50-51页 |
| ·XQuery实现的详细算法 | 第51-55页 |
| ·XQuery的代数优化 | 第55-56页 |
| ·性能测试及评价 | 第56-58页 |
| 第七章 总结和展望 | 第58-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-64页 |