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多维液相色谱-质谱联用技术在蛋白质组学中的应用

第一章 文献综述第1-64页
 第一节 蛋白质组学的研究背景第12-13页
 第二节 蛋白质组学的研究方法和技术平台第13-24页
     ·蛋白质组学的总体研究策略第13-14页
     ·蛋白质组学中的研究技术第14-24页
       ·蛋白质组学研究中的分离技术第14-20页
         ·双向凝胶电泳第15页
         ·多维高效液相色谱第15-20页
       ·蛋白质组学研究中的鉴定技术第20-24页
 第三节 磷酸化蛋白质组研究第24-35页
     ·蛋白质磷酸化概况第24-25页
     ·磷酸化蛋白质的富集第25-26页
     ·磷酸化肽段的富集第26-27页
     ·磷酸化肽段的质谱检测第27-35页
       ·以MALDI为离子源的质谱对磷酸化肽段的检测第28-29页
       ·以ESI为离子源的质谱对磷酸化肽段的检测第29-32页
         ·前离子扫描(precursor ion scan)第30-31页
         ·中性丢失扫描(neutral loss scan)第31-32页
       ·蛋白质磷酸化位点的质谱分析第32-35页
         ·CID(collision induced dissociation,碰撞诱导分裂)碎片分析第33-34页
         ·ECD(electron capture dissociation,电子俘获分裂)碎片分析第34-35页
 第四节 毛细管电色谱整体柱研究进展第35-43页
     ·毛细管电色谱简介第35-36页
     ·毛细管电色谱整体柱的制备第36-41页
       ·有机多孔聚合物毛细管电色谱整体柱的制备第37-40页
         ·基于聚丙烯酰胺的整体柱第37-38页
         ·基于聚苯乙烯的整体柱第38页
         ·基于聚甲基丙烯酸酯的整体柱第38-40页
       ·无机多孔聚合物毛细管电色谱整体柱的制备第40页
       ·颗粒固定化型整体柱的制备第40-41页
     ·毛细管电色谱整体柱的应用第41-43页
       ·反相第41页
       ·离子交换第41-42页
       ·体积排租第42页
       ·正相第42页
       ·手性分离第42-43页
       ·蛋白质和多肽第43页
 参考文献第43-64页
第二章 二维高效液相色谱蛋白质预分级和电喷雾—线性离子阱串连质谱连用技术的人类血浆蛋白质组分析第64-89页
   ·引言第64-66页
   ·实验部分第66-69页
     ·仪器和材料第66页
     ·试剂第66-67页
     ·人血浆样品的制备第67页
     ·二维液相色谱分离血浆蛋白第67-68页
     ·质谱前样品制备第68页
     ·Capillary LC-ESI MS/MS分析第68-69页
     ·数据分析第69页
   ·结果与讨论第69-83页
     ·二维高效液相色谱对人血浆蛋白质的分离和组分收集第69-72页
     ·毛细管反相毛细管色谱—电喷雾—线性离子阱质谱对人血浆蛋白质的大规模鉴定第72-73页
     ·被鉴定蛋白质的基本物化性质第73-75页
     ·穿膜区预测第75-77页
     ·信号肽预测第77-78页
     ·蛋白质分类第78-81页
       ·基于分子功能的分类第80页
       ·基于生物进程的分类第80-81页
     ·鉴定所得蛋白质的总体描述第81-83页
   ·小结第83-84页
 参考文献第84-89页
第三章 固定化金属亲和色谱纯化和纳升级电喷雾串连质谱联用技术的小鼠肝组织磷酸化蛋白质组分析第89-111页
   ·引言第89-90页
   ·实验部分第90-93页
     ·仪器和材料第90-91页
     ·生物样品和化学试剂第91页
     ·小鼠肝组织样品制备第91-92页
     ·酶解第92页
     ·酶解产物的IMAC纯化第92-93页
     ·NanoLC-ESI MS/MS分析第93页
     ·数据库搜索第93页
   ·结果和讨论第93-104页
     ·NanoLC和LTQ质谱鉴定第93-94页
     ·磷酸化肽段的碰撞诱导分裂第94-95页
     ·磷酸化肽段图谱的解读和MS/MS/MS的作用第95-104页
     ·NSI进行肽段磷酸化分析的优势第104页
   ·小结第104-105页
 参考文献第105-111页
第四章 基于预柱不保留和强阴离子交换多维色谱的小鼠磷酸化蛋白质组的分析第111-133页
   ·引言第111-112页
   ·实验部分第112-116页
     ·仪器和材料第113页
     ·生物样品和化学试剂第113页
     ·小鼠肝组织样品制备第113-114页
     ·小鼠肝组织样品和磷酸化标准蛋白样品酶解第114页
     ·用聚苯乙烯色谱柱纯化磷酸化肽段第114-115页
     ·离线的RP-SAXLC纯化小鼠肝组织磷酸化肽段第115页
     ·Capillary RPLC-ESI MS/MS分析第115页
     ·数据库搜索第115-116页
   ·结果和讨论第116-125页
     ·聚苯乙烯—二乙烯基苯反相色谱对磷酸化肽段的纯化第116-118页
     ·串联聚苯乙烯—二乙烯基苯反相色谱和强阴离子交换色谱用于C57小鼠肝组织磷酸化肽段的纯化第118-120页
     ·Capillary RPLC-ESI MS/MS对磷酸化肽段的鉴定和磷酸化位点的分析第120-125页
   ·小结第125-129页
 参考文献第129-133页
第五章 聚苯乙烯—二乙烯基苯整体柱的快速制备及其在毛细管电色谱中的应用第133-167页
 第一节 引言第133-134页
 第二节 负电荷型聚苯乙烯整体柱的快速制备和应用第134-154页
     ·聚苯乙烯—二乙烯基苯—甲基丙烯酸毛细管整体柱的制备第134-145页
       ·实验部分第135-137页
         ·试剂、材料和仪器第135页
         ·试剂前处理第135-136页
         ·毛细管预处理第136页
         ·整体柱的制备第136-137页
       ·结果和讨论第137-145页
         ·毛细管管壁的预处理第137-138页
         ·毛细管内的聚合反应以及单体比例的选择第138页
         ·致孔剂及其比例选择第138-140页
         ·聚合时间第140-142页
         ·柱寿命和重现性第142页
         ·电渗流第142-145页
     ·聚苯乙烯—二乙烯基苯—甲基丙烯酸毛细管整体柱的应用第145-154页
       ·中性化合物在整体柱上的分离第145-148页
       ·离子型化合物在整体柱上的分离第148-151页
       ·生物小肽在整体柱上的分离第151-154页
 第三节 正电荷型聚苯乙烯整体柱的快速制备和应用第154-160页
     ·引言第154页
     ·实验部分第154-156页
       ·仪器与试剂第154-155页
       ·电色谱条件第155页
       ·毛细管的预处理第155-156页
       ·整体柱的制备第156页
     ·结果和讨论第156-160页
       ·整体柱的孔结构第156-157页
       ·整体柱的电渗流第157-158页
       ·重现性和柱寿命第158-159页
       ·苯的同系物在整体柱上的分离第159-160页
 第四节 小结第160-161页
 参考文献第161-167页
附录第167-191页
作者简介及发表论文第191-194页
致谢第194页

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