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云南杂草双生病毒的分子鉴定

致谢第1-9页
摘要第9-11页
Abstract第11-13页
第一章 文献综述第13-40页
 1 双生病毒的发生与危害第13-14页
 2 双生病毒的分类与基因组结构第14-17页
  2.1 玉米线条病毒属(Mastrevirus)第14页
  2.2 甜菜曲顶病毒属(Curtovirus)第14-15页
  2.3 番茄伪曲顶病毒属(Topocuvirus)第15-16页
  2.4 菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)第16-17页
 3 双生病毒的侵染第17-27页
  3.1 双生病毒的复制第17-21页
   3.1.1 双生病毒复制所需的细胞环境——寄主细胞周期的激活第18-19页
   3.1.2 双生病毒复制相关的结构域第19-20页
   3.1.3 双生病毒的滚环复制第20-21页
  3.2 双生病毒的转录第21-23页
  3.3 双生病毒的移动第23-26页
   3.3.1 双组份双生病毒的移动第23-24页
   3.3.2 单组份双生病毒的移动第24-26页
  3.4 双生病毒的介体传毒第26-27页
 4 双生病毒的致病因子第27-28页
 5 双生病毒基因组的变异第28-31页
  5.1 突变第28页
  5.2 缺失和获取外源DNA第28-29页
  5.3 假重组第29-30页
  5.4 重组第30-31页
   5.4.1 属间重组第30页
   5.4.2 属内重组第30-31页
 6 双生病毒伴随的小分子DNA第31-34页
  6.1 DNA1分子第31-32页
  6.2 DNAβ分子第32-34页
  6.3 双生病毒与小分子DNA形成病害复合体第34页
 7 杂草上双生病毒研究进展第34-39页
  7.1 杂草上双生病毒的研究意义第34-35页
  7.2 杂草上双生病毒的发生状况第35-37页
  7.3 杂草上双生病毒的检测方法第37-39页
 8 立题意义第39-40页
第二章 材料与方法第40-49页
 1 材料第40页
  1.1 病毒第40页
  1.2 植物材料第40页
  1.3 菌株和质粒第40页
  1.4 试剂与仪器第40页
  1.5 常用缓冲液的配制第40页
 2 方法第40-49页
  2.1 植物总DNA提取第40-41页
  2.2 PCR技术第41页
   2.2.1 反应体系第41页
   2.2.2 反应参数第41页
  2.3 PCR产物纯化第41-42页
  2.4 DNA克隆技术第42-43页
   2.4.1 载体的去磷酸化第42页
   2.4.2 连接第42页
   2.4.3 感受态细胞制备方法第42-43页
   2.4.4 转化第43页
  2.5 重组质粒的提取与鉴定第43-45页
   2.5.1 碱裂解法第43-44页
   2.5.2 质粒微量提取试剂盒第44-45页
   2.5.3 PCR鉴定第45页
   2.5.4 酶切鉴定第45页
  2.6 Southern blot分析第45-47页
   2.6.1 转膜第45页
   2.6.2 探针标记第45-46页
   2.6.3 杂交和洗膜第46页
   2.6.4 免疫显色第46-47页
  2.7 侵染性克隆的转化第47页
   2.7.1 三亲交配法第47页
   2.7.2 电击法第47页
  2.8 农杆菌接种第47-49页
第三章 云南杂草上双生病毒的PCR快速检测第49-54页
 1 材料与方法第49页
  1.1 病毒第49页
  1.2 植物总DNA提取第49页
  1.3 PCR扩增、克隆及序列测定第49页
  1.4 序列分析第49页
 2 结果与分析第49-51页
 3 讨论第51-54页
第四章 侵染赛葵的双生病毒的分子鉴定第54-88页
 第一节 云南赛葵黄脉病毒及其卫星DNA的基因组结构第54-64页
  1 材料与方法第54-55页
   1.1 病毒第54页
   1.2 植物总 DNA提取第54页
   1.3 PCR扩增、克隆和测序第54页
   1.4 序列分析第54-55页
  2 结果与分析第55-62页
   2.1 病毒基因组 DNA-A结构第55页
   2.2 Y160 DNA-A与其它双生病毒的比较及分子进化分析第55-60页
   2.3 病毒基因组 DNAβ结构第60-61页
   2.4 Y160 DNAβ与其它双生病毒DNAβ的比较及其分子进化分析第61-62页
  3 讨论第62-64页
 第二节 云南赛葵黄脉病毒及其卫星DNA的致病性研究第64-74页
  1 材料与方法第64-68页
   1.1 MYVYNV-Y160 DNA-A侵染性克隆的构建第64-65页
   1.2 MYVYNV-Y160 DNAβ侵染性克隆的构建第65页
   1.3 MYVYNV-Y160 DNA-A和DNAβ在同一植物表达载体上的构建第65页
   1.4 侵染性克隆的转化第65-68页
   1.5 农杆菌接种第68页
   1.6 病毒DNA的PCR鉴定第68页
   1.7 病毒DNA的Southern印迹检测第68页
  2 结果与分析第68-71页
   2.1 MYVYNV-Y160 DNA-A和DNAβ的致病性测定第68-69页
   2.2 MYVYNV-Y160寄主范围的测定第69-70页
   2.3 病毒DNA的Southern印迹检测分析第70-71页
  3 讨论第71-74页
 第三节 赛葵黄脉病毒卫星DNA的基因组结构及变异第74-79页
  1 材料与方法第74页
   1.1 病毒第74页
   1.2 植物总DNA提取第74页
   1.3 PCR扩增、克隆和测序第74页
   1.4 序列分析第74页
  2 结果与分析第74-78页
   2.1 DNAβ分子的结构特征及变异第74-75页
   2.2 DNAβ核苷酸序列及分子进化分析第75-78页
  3 讨论第78-79页
 第四节 赛葵上双生病毒复合侵染的测定第79-88页
  1 赛葵是中国番茄黄化曲叶病毒的寄主第79-83页
   1.1 材料与方法第79页
    1.1.1 病毒第79页
    1.1.2 植物总 DNA提取第79页
    1.1.3 PCR扩增、克隆和测序第79页
   1.2 结果与分析第79-82页
    1.2.1 DNA-A复合侵染检测第79-80页
    1.2.2 DNAβ复合侵染检测第80-82页
   1.3 讨论第82-83页
  2 侵染赛葵的中国番茄黄化曲叶病毒的基因组结构第83-88页
   2.1 材料与方法第83-84页
    2.1.1 病毒第83页
    2.1.2 植物总 DNA提取第83页
    2.1.3 PCR扩增、克隆和测序第83-84页
    2.1.4 序列分析第84页
   2.2 结果与讨论第84-88页
    2.2.1 病毒基因组DNA-A结构第84-85页
    2.2.2 Y193、Y194 DNA-A与其它双生病毒的比较及分子进化分析第85-86页
    2.2.3 Y193、Y194是重组形成的TYLCCNV分离物第86-88页
第五章 侵染胜红蓟的双生病毒的分子鉴定第88-99页
 1 材料与方法第88-89页
  1.1 病毒第88页
  1.2 植物总DNA提取第88页
  1.3 PCR扩增、克隆和测序第88页
  1.4 序列分析第88-89页
 2 结果与分析第89-97页
  2.1 Y206 DNA-A和DNAβ基因组结构及分子进化分析4第89-94页
  2.2 Y282 DNA-A基因组结构及分子进化分析第94-95页
  2.3 Y283 DNA-A基因组结构及分子进化分析第95-97页
 3 讨论第97-99页
第六章 稀硷上与中国番茄黄化曲叶病毒伴随的卫星 DNA的基因组结构第99-103页
 1 材料与方法第99页
  1.1 病毒第99页
  1.2 植物总 DNA提取第99页
  1.3 PCR扩增、克隆和测序第99页
  1.4 序列分析第99页
 2 结果与讨论第99-103页
  2.1 病毒基因组 DNAβ结构第99-100页
  2.2 从稀硷中分离的6个 DNAβ与其它双生病毒DNAβ的比较第100页
  2.3 与TYLCCNV伴随的DNAβ分子的进化分析第100-103页
全文小结第103-104页
参考文献第104-115页
附录A: 常用化学试剂、分子生物学试剂及仪器第115-116页
附录B: 常用缓冲液及培养基配方第116-119页
附录C: EMBL登陆基因第119-122页
附录D: 博士研究生期间发表及投稿中的学术论文第122页

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