| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第1章 引言 | 第14-32页 |
| 1.1 海洋球石藻Emiliania huxleyi及其特异性病毒 | 第14-15页 |
| 1.2 球石藻病毒与宿主的相互作用 | 第15-16页 |
| 1.3 海洋病毒感染重塑宿主代谢网络 | 第16-23页 |
| 1.3.1 海洋病毒操纵宿主代谢的分子策略 | 第16-20页 |
| 1.3.2 球石藻病毒感染重构宿主代谢网络 | 第20-23页 |
| 1.4 MicroRNA及其与脂质代谢关系 | 第23-27页 |
| 1.4.1 MicroRNA的生物发生和作用方式 | 第23-26页 |
| 1.4.2 MicroRNA与脂代谢 | 第26-27页 |
| 1.4.3 MicroRNA与病毒感染 | 第27页 |
| 1.5 组学技术在浮游植物响应环境胁迫研究中的应用 | 第27-30页 |
| 1.5.1 MicroRNA-mRNA转录组联合分析 | 第28页 |
| 1.5.2 LncRNA-mRNA-蛋白质组联合分析 | 第28-29页 |
| 1.5.3 mRNA-代谢组联合分析 | 第29-30页 |
| 1.5.4 mRNA-蛋白质组-代谢组联合分析 | 第30页 |
| 1.6 本论文的目的意义及主要研究内容 | 第30-32页 |
| 第2章 海洋球石藻病毒感染靶向脂代谢的转录组重构 | 第32-62页 |
| 2.1 材料与方法 | 第32-40页 |
| 2.1.1 试剂 | 第32页 |
| 2.1.2 仪器 | 第32-33页 |
| 2.1.3 分析软件 | 第33-34页 |
| 2.1.4 实验藻种和病毒来源 | 第34页 |
| 2.1.5 海洋球石藻的培养 | 第34页 |
| 2.1.6 病毒颗粒的制备和浓缩 | 第34页 |
| 2.1.7 实验设置和样品收集 | 第34-35页 |
| 2.1.8 藻细胞总RNA提取和质量检测 | 第35-36页 |
| 2.1.9 转录组文库制备和测序 | 第36页 |
| 2.1.10 Small RNA转录组文库制备和测序 | 第36页 |
| 2.1.11 mRNA转录组测序数据分析 | 第36-40页 |
| 2.1.12 病毒感染重塑宿主转录组分析 | 第40页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第40-60页 |
| 2.2.1 RNA质检结果 | 第40-41页 |
| 2.2.2 测序数据分析结果 | 第41-55页 |
| 2.2.3 病毒感染重编程宿主代谢通路 | 第55-60页 |
| 2.3 本章小结 | 第60-62页 |
| 第3章 miRNA-mRNA-脂质代谢组的多组学关联分析 | 第62-102页 |
| 3.1 材料与方法 | 第62-65页 |
| 3.1.1 分析软件 | 第62页 |
| 3.1.2 miRNA前体和成熟体序列定位 | 第62-63页 |
| 3.1.3 miRNAs保守性分析 | 第63页 |
| 3.1.4 miRNAs的茎环qRT-PCR检测 | 第63-65页 |
| 3.1.5 差异表达miRNAs的靶基因预测及其功能注释 | 第65页 |
| 3.1.6 miRNAs/tRF在病毒介导的宿主脂代谢中的功能 | 第65页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第65-100页 |
| 3.2.1 miRNA前体及成熟体在基因组上的定位 | 第65-70页 |
| 3.2.2 miRNAs保守性特点 | 第70-75页 |
| 3.2.3 miRNAs茎环qRT-PCR验证结果 | 第75-77页 |
| 3.2.4 差异表达miRNAs/tRF的靶基因预测结果 | 第77-79页 |
| 3.2.5 差异表达靶基因的功能注释 | 第79-83页 |
| 3.2.6 miRNAs/tRF靶向光合作用相关基因 | 第83-86页 |
| 3.2.7 miRNAs/tRF靶向转录因子相关基因 | 第86-89页 |
| 3.2.8 病毒感染诱导的miRNAs/tRF在重塑宿主脂代谢中的作用 | 第89-100页 |
| 3.3 本章小结 | 第100-102页 |
| 第4章t RF3-ArgTCT与PSBO-1 基因之间靶向关系的验证 | 第102-113页 |
| 4.1 材料与方法 | 第102-107页 |
| 4.1.1 试剂 | 第102-103页 |
| 4.1.2 仪器 | 第103页 |
| 4.1.3 miRNAs/tRF与脂代谢相关酶基因的靶向关系分析 | 第103页 |
| 4.1.4 双荧光素酶报告载体及细胞株系 | 第103-104页 |
| 4.1.5 psi CHECK-2-PSBO-1 双荧光素酶报告载体构建 | 第104-106页 |
| 4.1.6 荧光素酶活性的测定 | 第106-107页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第107-111页 |
| 4.2.1 miRNAs/tRF与脂代谢相关酶基因之间靶向关系的预测 | 第107-109页 |
| 4.2.2 psi CHECK-2-PSBO-1 双荧光素酶报告载体构建结果 | 第109-110页 |
| 4.2.3 miRNAs/tRF对脂代谢相关酶基因的靶向作用特点 | 第110-111页 |
| 4.3 本章小结 | 第111-113页 |
| 第5章 结论与展望 | 第113-115页 |
| 5.1 本文主要结论 | 第113页 |
| 5.2 本论文的创新性 | 第113-114页 |
| 5.3 展望 | 第114-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-128页 |
| 附录 | 第128-132页 |
| 附录A:正文图 2.11 和 2.12 所用酶名称的缩写 | 第128-132页 |
| 在学期间发表的学术论文 | 第132页 |
