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丝羽乌骨鸡BAC文库的构建和黑色素相关基因TYRP1和ID的研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
缩略词第9-12页
文献综述第12-46页
 引言第12-14页
 1 鸡的基因组研究第14-28页
   ·鸡的基因组图谱第14-22页
     ·鸡的遗传图谱第15-16页
     ·鸡的物理图谱第16-22页
   ·鸡的功能基因组研究第22-23页
   ·比较图谱与比较基因组学第23-24页
   ·鸡的Z染色体研究第24-28页
 2 BAC文库及其在基因组学中的应用第28-35页
   ·BAC载体概述第28页
   ·BAC载体的发展历史第28-30页
   ·BAC文库构建方法第30-31页
   ·BAC文库筛选系统第31页
   ·BAC文库的参数第31-32页
   ·BAC文库的应用第32-34页
   ·世界上已有的鸡的BAC文库第34-35页
 3 黑色素的产生、形成和生化特点第35-38页
   ·黑色素的性质、功能及黑色素的合成第35-37页
   ·黑色素细胞的起源、分化及形成第37-38页
 4 影响黑色素相关性状的候选基因研究进展第38-43页
   ·酪氨酸酶相关蛋白家族第38-41页
   ·表皮黑色素抑制因子ID(dermal mclanin inhibitor)第41-42页
   ·其他影响黑色素性状的基因第42-43页
 5 乌骨鸡的黑色素研究现状第43-46页
第二章 材料与方法第46-69页
 1 主要药品和酶第46页
 2 主要仪器第46-47页
 3 常规试剂第47-48页
 4 总技术路线第48页
 5 BAC文库构建和ID区域BAC重叠群构建第48-61页
   ·实验动物第48-49页
   ·菌株,细胞系和克隆载体第49页
   ·试剂第49-52页
   ·实验方法第52-61页
     ·BAC文库构建与鉴定第52-56页
     ·荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)第56-59页
     ·BAC末端测序第59-60页
     ·BAC指纹法构建BAC重叠群第60-61页
 6 TYRP1基因的研究第61-69页
   ·实验动物第61页
   ·试剂第61-62页
   ·实验方法第62-69页
     ·TYRP1 BAC克隆直接测序第62-63页
     ·PCR产物的测序反应第63页
     ·测序产物纯化第63页
     ·总RNA提取和纯化第63-64页
     ·RT-PCR第64-65页
     ·Northern杂交第65-67页
     ·Gel-shift鉴定转录因子与DNA片段的结合第67-68页
     ·基因组扫描第68-69页
第二章 结果与分析第69-98页
 1 丝羽乌骨鸡基因组BAC文库的构建与鉴定第69-81页
   ·丝羽乌骨鸡BAC文库的构建第69-73页
   ·文库的管理和PCR筛选系统的构建第73页
   ·文库的鉴定和分析第73-80页
   ·小结第80-81页
 2 利用BAC文库对TYRP1基因的研究第81-94页
   ·丝羽乌骨鸡TYRP1的物理定位和基因组序列测定第81-84页
   ·基因组扫描法对TYRP1进行遗传定位第84-85页
   ·对内含子6中SNP的分析第85-88页
   ·丝羽乌骨鸡和白莱航鸡TYRP1表达分析第88-93页
   ·小结第93-94页
 3 ID基因区域的物理图谱的构建第94-98页
   ·PCR和染色体步行法筛选ID区域BAC克隆第94-95页
   ·BAC指纹分析第95-96页
   ·BAC重叠群的染色体定位第96页
   ·小结第96-98页
第四章 结论与讨论第98-106页
 1 讨论第98-104页
   ·丝羽乌骨鸡基因组文库的构建与鉴定第98-100页
     ·文库筛选系统第98页
     ·文库的质量第98页
     ·关于文库的构建技术第98-99页
     ·关于荧光原位杂交第99-100页
     ·展望第100页
   ·TYRP1基因的研究第100-102页
     ·SNP的检测和分析第100-101页
     ·TYRP1在丝羽乌骨鸡和白莱航鸡胚胎中的表达第101-102页
     ·关于TYRP1的基因组扫描结果第102页
     ·展望第102页
   ·ID区域BAC重叠群的构建第102-104页
     ·关于染色体步行第102-103页
     ·BAC指纹分析第103页
     ·重叠群的构建和分析第103页
     ·展望第103-104页
 2 结论第104-106页
参考文献第106-113页
致谢第113-114页
附录1: BAC文库PCR筛选系统构建第114-116页
附录2: 丝羽乌骨鸡TYRP1基因全序列第116-123页
个人简历第123页

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