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从江香猪FSHR和PDIA4基因候选SNP分析及其功能研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 前言第10-16页
    1 单核苷酸多态性研究第10-11页
    2 FSHR和PDIA4基因多态性研究进展第11-12页
    3 猪繁殖性状SNP研究第12-13页
    4 SNP检测方法第13-14页
    5 从江香猪第14-15页
    6 研究目的及意义第15-16页
第二章 材料与方法第16-39页
    1 实验材料与仪器试剂第16-21页
        1.1 实验材料第16页
        1.2 实验仪器第16-17页
        1.3 实验试剂第17-19页
        1.4 配制试剂第19-21页
    2 实验方法第21-39页
        2.1 DNA及RNA的提取与检测第21-24页
        2.2 Illumina Hiseq 2000 全基因组重测序及数据分析第24-25页
        2.3 AS-PCR及测序引物的设计与合成第25-28页
        2.4 PCR反应体系及程序第28-29页
        2.5 目的DNA片段的克隆与测序第29-32页
        2.6 AS-PCR检测SNP在香猪群体中的基因型第32页
        2.7 单倍型检测及构建第32-34页
        2.8 关联分析第34-35页
        2.9 PDIA4基因表达量检测第35-36页
        2.10 PDIA4编码蛋白Western Blot检测第36-39页
第三章 结果第39-85页
    1 香猪繁殖性状统计第39页
    2 基因组DNA与RNA的提取结果第39-40页
        2.1 基因组DNA的提取结果第39-40页
        2.2 香猪子宫RNA的提取结果第40页
    3 候选SNP的AS-PCR校验结果第40-49页
        3.1 rs322800083位点的验证第40-44页
        3.2 rs81384737位点的验证第44-46页
        3.3 rs81211903位点的验证第46-47页
        3.4 rs331867016、rs343292829位点的验证第47-49页
    4 候选SNP的直接测序校验结果第49-52页
        4.1 rs695495204位点的验证第49-50页
        4.2 rs81216658位点的验证第50-52页
    5 FSHR和PDIA4基因外显子10的多态性结果第52-81页
        5.1 FSHR基因外显子10的多态性结果第52-61页
        5.2 PDIA4基因外显子10的多态性结果第61-81页
    6 香猪子宫PDIA4基因的m RNA表达水平第81-83页
        6.1 标准曲线的制备第81-82页
        6.2 PDIA4基因的mRNA表达水平第82-83页
    7 香猪子宫PDIA4编码蛋白的表达水平第83-85页
第四章 讨论第85-89页
    1 FSHR基因外显子10的基因型频率及遗传特异性分析第85页
    2 FSHR基因外显子10基因多态性与香猪产仔数的相关分析第85-86页
    3 PDIA4基因外显子10的多态性及连锁不平衡分析第86-87页
    4 PDIA4基因rs81216658位点的密码子偏好性分析第87页
    5 PDIA4编码蛋白对猪繁殖性状的影响第87-89页
第五章 结论第89-90页
参考文献第90-95页
致谢第95-96页
附录第96-103页
论文资助第103页
在校期间已发表的文章第103页
在校期间获得的奖励第103-104页

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