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植物ADH基因家族的生物信息学分析及棉花Zn结合脱氢酶的克隆与原核表达

目录第1-7页
中文摘要第7-9页
英文摘要第9-10页
第一部分 引言第10-11页
第二部分 文献综述第11-22页
 1. 植物锌结合脱氢酶第11-17页
   ·乙醇脱氢酶的克隆及其功能研究第11-14页
     ·植物乙醇脱氢酶的克隆第11页
     ·乙醇脱氢酶的功能研究第11-14页
   ·山梨醇脱氢酶的克隆及其功能研究第14-15页
     ·植物山梨醇脱氢酶基因的克隆第14-15页
     ·山梨醇脱氢酶的功能研究第15页
   ·谷氨酸脱氧酶的克隆及其功能研究第15-16页
     ·谷氨酸脱氧酶基因的克隆第16页
     ·谷氨酸脱氧酶的功能研究第16页
   ·葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的克隆及其功能研究第16-17页
     ·葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因的克隆第16-17页
     ·葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的功能研究第17页
 2. 植物中的其他重要含锌酶第17-20页
   ·碳酸酐酶第18页
     ·碳酸酐酶在干旱中的表现第18页
     ·碳酸酐酶在光照、高盐、高温、缺氮、缺钾环境中的活性变化第18页
   ·超氧化物歧化酶第18-20页
     ·SOD基因的克隆第19页
     ·棉花中SOD研究进展第19-20页
 3. 生物信息学概述第20-22页
   ·序列片段的拼接第20-21页
   ·基因区域的预测第21页
   ·基因功能预测第21页
   ·分子进化的研究第21-22页
第三部分 乙醇脱氢酶(ADH)家族生物信息学分析第22-32页
 1.前言第22-23页
 2.材料和方法第23-24页
   ·数据来源与获取第23页
   ·数据处理与计算机软件第23-24页
     ·保守结构域预测第23页
     ·二级结构预测第23-24页
     ·多重序列比对和系统树构建第24页
 3.结果与分析第24-30页
   ·ADH的保守结构域分析第24-25页
   ·玉米等物种中MDH的二级结构分析第25-28页
   ·玉米等物种中ADH的多重序列比对和进化关系分析第28-30页
 4.讨论第30-31页
 5.小结第31-32页
第四部分 一个新的百脉根乙醇脱氢酶基因(LcADH(t))的in silico注释第32-40页
 1.前言第32页
 2.材料和方法第32-33页
   ·数据序列来源与获取第32-33页
   ·数据处理与计算机软件第33页
     ·LcADH(t)保守结构域预测第33页
     ·LcADH(t)二级结构预测第33页
     ·LcADH(t)与其他物种的多重序列比对和进化树构建第33页
 3.结果与分析第33-38页
   ·LcADH(t)的保守结构域分析第33-34页
   ·LcADH(t)的二级结构分析第34-37页
   ·LcADH(t)与其他物种的多重序列比对和进化树分析第37-38页
 4.讨论第38-39页
 5.小结第39-40页
第五部分:陆地棉锌结合脱氢酶基因克隆及生物信息学分析第40-54页
 1.前言第40页
 2.材料和方法第40-45页
   ·试验材料第40-41页
     ·供试植物材料第40页
     ·棉花EST序列的获得第40-41页
     ·主要分子生物学试剂第41页
     ·制备大肠杆菌感受态细胞所需试剂第41页
   ·试验方法第41-45页
     ·基于EST的in silico分析及引物设计第41-42页
     ·棉花总RNA的提取第42-43页
     ·RNA反转录成cDNA第43页
     ·PCR以及产物的回收第43页
     ·连接与转化第43-44页
     ·重组质粒DNA的提取与酶切鉴定第44-45页
     ·锌结合脱氢酶基因的序列对比和分析第45页
     ·推导氨基酸序列的保守结构域预测以及二级结构预测第45页
 3.结果与分析第45-52页
   ·棉花锌结合脱氢酶基因(GhZBDH)的克隆第45-46页
   ·棉花锌结合脱氢酶蛋白基因(GhZBDH)的序列对比和分析第46-48页
   ·棉花ZBDH的功能预测第48-52页
     ·棉花锌结合脱氢酶(GhZBDH)的保守结构域预测以及二级结构预测第48-52页
 4.讨论第52页
 5.小结第52-54页
第六部分:棉花锌结合脱氢酶(GhZBDH)的原核表达与蛋白纯化第54-62页
 1.前言第54页
 2.材料与方法第54-57页
   ·材料与试剂第54-55页
   ·实验方法第55-57页
     ·原核表达载体pQE 30-GhV3构建及转化第55-56页
     ·His-V3融合蛋白的小量诱导表达第56页
     ·棉花锌结合脱氢酶蛋白在大肠杆菌中的大量表达与纯化第56-57页
 3.结果与分析第57-60页
   ·原核表达载体pQE 30-GhV3构建、转化及鉴定第57-58页
   ·pQE 30-GhV3融合蛋白的小量诱导表达第58-59页
   ·棉花锌结合脱氢酶蛋白在M15中的大量表达与纯化第59-60页
 4.讨论第60页
 5.小结第60-62页
第七部分:讨论第62-67页
 1.ADH的进化历史第62页
 2.基于全基因组测序数据注释新基因——百脉根的LcADH(t)第62页
 3.基于全基因组测序数据PCR克隆新基因——棉花的GhZBDH第62-63页
 4.GhADH在棉花抗黄萎病过程中执行什么功能?第63-67页
参考文献第67-77页
附录1第77-78页
附录2第78-79页
附录3:图版第79-89页
致谢第89-92页

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