基于GMM的基因外显子预测算法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-12页 |
| ·生物信息学 | 第7-9页 |
| ·生物信息学的含义和发展历史 | 第7-8页 |
| ·生物信息学的任务 | 第8页 |
| ·生物信息学的研究内容 | 第8-9页 |
| ·基因预测的研究现状及意义 | 第9-11页 |
| ·本文的内容安排 | 第11-12页 |
| 第二章 DNA序列的结构和数值映射 | 第12-19页 |
| ·DNA序列的结构 | 第12-13页 |
| ·基因编码区的周期三特性 | 第13页 |
| ·DNA序列的数值映射 | 第13-17页 |
| ·VOSS映射 | 第14页 |
| ·复数描述 | 第14-15页 |
| ·Z曲线描述 | 第15页 |
| ·成对数值映射 | 第15-17页 |
| ·小结 | 第17-19页 |
| 第三章 基因预测的特征提取 | 第19-30页 |
| ·频域处理方法 | 第19-23页 |
| ·基于DFT的特征提取 | 第19-22页 |
| ·PWSR方法提取特征 | 第22-23页 |
| ·时域处理方法 | 第23-26页 |
| ·反陷波滤波器 | 第24-25页 |
| ·AMDF以及CAMDF特征计算 | 第25页 |
| ·奇异值分解SVD提取特征 | 第25-26页 |
| ·改进的特征提取方法 | 第26-28页 |
| ·基于信息熵(IE)的特征提取 | 第26-27页 |
| ·SMDSF特征的提取 | 第27-28页 |
| ·多维特征的后处理 | 第28-29页 |
| ·小结 | 第29-30页 |
| 第四章 GMM分类算法研究 | 第30-37页 |
| ·GMM概述 | 第30-31页 |
| ·GMM中参数估计中的EM算法研究 | 第31-34页 |
| ·GMM分类在生物序列中的应用 | 第34-35页 |
| ·小结 | 第35-37页 |
| 第五章 评估标准和结果分析 | 第37-53页 |
| ·数据库的选取 | 第37-38页 |
| ·评估标准 | 第38-40页 |
| ·结果分析 | 第40-52页 |
| ·四种映射方法的比较 | 第40-42页 |
| ·特征提取方法的比较 | 第42-52页 |
| ·小结 | 第52-53页 |
| 第六章 总结与展望 | 第53-55页 |
| ·总结 | 第53-54页 |
| ·展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-58页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
