生物信息学数据整合的应用研究
| 提要 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-17页 |
| ·背景介绍 | 第11-13页 |
| ·生物信息数据整合研究现状 | 第13-15页 |
| ·本文的主要工作及意义 | 第15-17页 |
| 第2章 系统生物学及生物数据通路介绍 | 第17-24页 |
| ·系统生物学 | 第17-20页 |
| ·系统生物学数据 | 第17-18页 |
| ·系统生物学研究方法 | 第18-20页 |
| ·生物数据通路定义 | 第20页 |
| ·生物通路的数据来源 | 第20-22页 |
| ·文献搜集 | 第20-21页 |
| ·逆向工程 | 第21-22页 |
| ·直向同源通路 | 第22页 |
| ·生物通路数据库 | 第22-24页 |
| 第3章 数据库模式整合设计方法 | 第24-30页 |
| ·数据库整合步骤 | 第24-25页 |
| ·设计方法与基础理论 | 第25-27页 |
| ·XML 简介 | 第25-26页 |
| ·基于 XML 的数据整合 | 第26-27页 |
| ·中间件模式映射 | 第27-30页 |
| ·GAV 方法和 LAV 方法 | 第27-28页 |
| ·中间件模式工作流程 | 第28-30页 |
| 第4章 数据整合相关技术 | 第30-35页 |
| ·WEB SERVICE | 第30-31页 |
| ·XML 数据模型 | 第31-32页 |
| ·XML 解析器 | 第32-35页 |
| ·SAX 和 DOM | 第32-33页 |
| ·DOM 结构及.NET 实现 | 第33-35页 |
| 第5章 系统生物学建模 | 第35-40页 |
| ·系统生物学建模工具—BLENX4BIO | 第35-36页 |
| ·生物通路模型 | 第36-40页 |
| ·KEGG 数据库中生物通路模型 | 第37-39页 |
| ·PID 数据库中生物通路模型 | 第39-40页 |
| 第6章 建模工具整合功能的实现 | 第40-54页 |
| ·整合流程图 | 第40页 |
| ·实现代码 | 第40-42页 |
| ·整合过程 | 第42-51页 |
| ·实验结果与意义 | 第51-54页 |
| 第7章 总结与展望 | 第54-56页 |
| ·总结 | 第54-55页 |
| ·展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-59页 |
| 作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
