| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 1 引言 | 第12-18页 |
| ·毛色遗传的研究现状 | 第12-13页 |
| ·C-kit 基因研究 | 第13-14页 |
| ·C-kit 基因研究的现状 | 第13页 |
| ·C-kit 基因的作用机理 | 第13-14页 |
| ·试验中所涉及的分子标记方法 | 第14-16页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第14页 |
| ·限制性片段长度多态性 | 第14-15页 |
| ·单链构象多态性 | 第15页 |
| ·单倍型分析 | 第15-16页 |
| ·本研究的目的、意义及主要内容 | 第16-18页 |
| ·研究的目的和意义 | 第16页 |
| ·研究的主要内容 | 第16-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-32页 |
| ·试验材料 | 第18-20页 |
| ·试验山羊样品来源及采样方法 | 第18-19页 |
| ·主要仪器设备 | 第19页 |
| ·溶液试剂配制 | 第19-20页 |
| ·主要分子生物学软件 | 第20页 |
| ·主要试验方法和步骤 | 第20-29页 |
| ·山羊DNA 的提取 | 第20-21页 |
| ·基因组DNA 浓度和纯度的检测 | 第21-22页 |
| ·C-kit 基因PCR 引物的设计与合成 | 第22-24页 |
| ·PCR 反应体系 | 第24-27页 |
| ·C-kit 基因PCR 产物的测序与分析 | 第27页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳的步骤 | 第27-29页 |
| ·C-kit 基因外显子16 变异位点的PCR-RFLP 分析 | 第29页 |
| ·C-kit 基因内含子10 多态位点的PCR-SSCP 分析 | 第29页 |
| ·实验数据统计方法 | 第29-32页 |
| ·基因频率和基因型频率的计算 | 第29-30页 |
| ·基因频率和基因型频率差异显著性检验（χ2 独立性检验） | 第30页 |
| ·群体内遗传变异的度量指标—杂合度(Heterozygosity，He) | 第30-31页 |
| ·有效等位基因数(effective number of alleles,Ne） | 第31页 |
| ·遗传距离 | 第31页 |
| ·聚类分析 | 第31-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-46页 |
| ·山羊样品基因组DNA 的提取结果 | 第32页 |
| ·C-kit 基因序列的获得与分析 | 第32-37页 |
| ·C-kit 基因PCR 扩增结果 | 第32-35页 |
| ·C-kit 基因的测序结果分析 | 第35-37页 |
| ·山羊C-kit 基因外显子16 的多态位点g.40545G>A 分析 | 第37-40页 |
| ·外显子16 的多态位点g.40545G>A 的扩增和酶切结果 | 第37-38页 |
| ·外显子16 的多态位点g.40545G>A 的群体遗传学分析 | 第38-39页 |
| ·不同山羊群体中g.40545G>A 位点的遗传多样性 | 第39-40页 |
| ·山羊C-kit 基因内含子10 插入位点分析 | 第40-42页 |
| ·内含子10 插入位点的PCR 扩增和SSCP 分析结果 | 第40-41页 |
| ·内含子10 的35818 插入位点的群体遗传学分析 | 第41-42页 |
| ·不同山羊群体中35818 插入位点的遗传多样性 | 第42页 |
| ·不同山羊群体35818 与40545 两个位点的综合遗传分化 | 第42-43页 |
| ·不同物种C-kit 基因CDS 序列变异特征和遗传分化分析 | 第43-46页 |
| ·不同物种 C-kit 基因核苷酸歧异度与遗传距离 | 第43-44页 |
| ·不同物种C-kit 氨基酸多样性 | 第44-45页 |
| ·不同物种C-kit 基因聚类分析 | 第45-46页 |
| 4 讨论 | 第46-52页 |
| ·DNA 的提取 | 第46页 |
| ·最佳PCR 条件的建立 | 第46-48页 |
| ·引物设计 | 第46页 |
| ·引物退火温度 | 第46-47页 |
| ·降落PCR | 第47页 |
| ·引物浓度 | 第47页 |
| ·引物纯度和稳定性 | 第47-48页 |
| ·酶活性 | 第48页 |
| ·影响SSCP 检测效果的因素 | 第48-49页 |
| ·PCR 扩增产物的长度 | 第48页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶的交联度和胶浓度 | 第48页 |
| ·SSCP 结果的分析 | 第48-49页 |
| ·电泳条件 | 第49页 |
| ·PCR-RFLP 反应的影响因素 | 第49-50页 |
| ·PCR 的扩增效果 | 第49页 |
| ·限制性内切酶的选择 | 第49页 |
| ·酶切体系的确定 | 第49-50页 |
| ·外显子16 的g.40545G>A 位点在山羊群体中的遗传分化 | 第50页 |
| ·内含子10 的35818 插入位点在山羊群体中的遗传分化 | 第50-51页 |
| ·不同物种C-kit 基因的遗传变异 | 第51-52页 |
| ·变异位点与遗传学效应 | 第51页 |
| ·非同义替代与密码子偏爱性 | 第51页 |
| ·物种间C-kit 基因的聚类分析 | 第51-52页 |
| 5 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 在读期间发表的论文 | 第56-57页 |
| 作者简历 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
