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黄鳝肠道cDNA文库构建、EST分析及抗菌肽基因的原核表达

摘要第1-6页
Abstracts第6-9页
常用缩略词第9-11页
目录第11-14页
第一章 绪论第14-39页
   ·前言第14-15页
   ·鱼类抗菌肽的研究第15-25页
     ·鱼类抗菌肽的生化特点与组成第15-17页
     ·鱼类抗菌肽的生物学活性与功能第17-18页
     ·鱼类抗菌肽的抗菌机制第18-23页
     ·鱼类抗菌肽表达调控第23-25页
   ·抗菌肽hepcidin的研究第25-28页
     ·Hepcidin的结构第26-27页
     ·Hepcidin的表达分布第27页
     ·Hepcidin与机体铁代谢第27-28页
     ·Hepcidin与炎症和贫血第28页
   ·抗菌肽基因工程第28-31页
     ·大肠杆菌表达系统第29-31页
     ·酵母表达系统第31页
   ·抗菌肽在水产养殖上的应用前景第31-32页
   ·cDNA文库与EST分析第32-36页
     ·cDNA文库构建技术第32-35页
     ·EST分析技术第35-36页
   ·本课题研究的目的与意义第36-37页
   ·本文技术路线第37-39页
第二章 黄鳝肠道cDNA文库的构建与分析第39-55页
   ·试验材料第39-42页
     ·组织样品第39页
     ·质粒和菌株第39页
     ·主要试剂与仪器第39-40页
     ·RNA提取试剂第40页
     ·缓冲液第40-42页
     ·培养基第42页
     ·提取RNA的实验用品第42页
   ·方法第42-50页
     ·黄鳝肠道组织样品的处理第42-43页
     ·总RNA提取第43页
     ·RNA甲醛变性凝胶电泳第43页
     ·mRNA的分离第43-44页
     ·cDNA文库构建第44-46页
     ·cDNA与重组接头连接第46页
     ·利用色谱柱分级分离cDNA及收集第46-47页
     ·BP重组反应第47页
     ·电转化至大肠杆菌DH10B第47-49页
     ·cDNA文库质量鉴定第49-50页
   ·结果与分析第50-53页
     ·黄鳝肠道总RNA的提取第50页
     ·mRNA分离第50页
     ·cDNA文库构建与鉴定第50-52页
     ·重组率和插入片段PCR鉴定第52-53页
   ·讨论第53-55页
第三章 黄鳝肠道EST分析第55-81页
   ·试验材料第55页
     ·材料第55页
     ·试剂及仪器第55页
   ·方法第55-57页
     ·文库阳性克隆菌液培养及鉴定第55-56页
     ·单向序列测定第56页
     ·信息收集与处理第56-57页
   ·结果与分析第57-78页
     ·黄鳝肠道ESTs初步分析第57-61页
     ·ESTs功能注释第61页
     ·GO分类第61-63页
     ·营养代谢相关的EST第63-68页
     ·免疫与抗病相关功能基因鉴定第68-77页
     ·与不同食性鱼类肠道cDNA文库的比较第77-78页
   ·讨论第78-81页
     ·EST序列代表性第78页
     ·EST序列长度第78页
     ·EST序列比对与拼接第78-79页
     ·基因注释及功能分类第79-80页
     ·黄鳝肠道基因整体表达情况第80-81页
第四章 黄鳝hepcidin序列获得与分析第81-93页
   ·材料第81页
   ·网络资源及应用软件第81-82页
   ·方法第82-85页
     ·cDNA文库混合质粒的制备第82-83页
     ·PCR反应第83页
     ·琼脂糖凝胶电泳检测第83页
     ·PCR产物回收纯化第83-84页
     ·连接反应第84页
     ·转化至感受态大肠杆菌DH5α第84页
     ·测序鉴定第84-85页
     ·序列分析第85页
   ·结果与分析第85-91页
     ·PCR及序列测定第85-86页
     ·编码的氨基酸序列第86页
     ·基本性质分析第86-87页
     ·三级结构预测第87-88页
     ·同源性分析第88-91页
   ·讨论第91-93页
第五章 黄鳝hepcidin原核表达研究第93-124页
   ·pet22b(+)-hepcidin重组表达载体构建与原核表达第94-102页
     ·材料第94页
     ·方法第94-99页
     ·结果与分析第99-102页
   ·pET43.1a(+)-hepcidin重组表达载体构建与原核表达第102-108页
     ·材料第102页
     ·方法第102页
     ·结果与分析第102-108页
   ·pET32a(+)与hepcidin基因重组载体构建与原核表达第108-120页
     ·材料第108页
     ·方法第108页
     ·结果与分析第108-120页
   ·讨论第120-124页
     ·关于原核表达载体第120-121页
     ·关于表达菌第121页
     ·含信号肽序列的hepcidin重组表达载体在原核细胞中不表达原因分析第121页
     ·BL21-CondonPlus(DE3)-RIPL中高效表达原因分析第121-122页
     ·关于pET32a(a)-nhepcidin表达条件优化第122-124页
第六章 总结与展望第124-126页
   ·结论第124-125页
   ·本研究的创新点第125页
   ·展望第125-126页
附录第126-131页
参考文献第131-150页
致谢第150-151页
博士期间发表的论文第151页

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