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维氏气单胞菌反式翻译底物的鉴定与研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 引言第9-15页
    1.1 核糖体滞留与核糖体拯救第9页
    1.2 反式翻译第9-12页
        1.2.1 反式翻译的发生机制第10页
        1.2.2 反式翻译的生理意义第10-11页
        1.2.3 反式翻译的底物第11-12页
    1.3 核糖体滞留与基因的转录后水平调控第12页
    1.4 研究内容、目的及意义第12-14页
    1.5 技术路线第14-15页
2 材料与方法第15-25页
    2.1 实验材料第15-19页
        2.1.1 菌株和质粒第15页
        2.1.2 引物第15-16页
        2.1.3 分子生物操作技术常用酶及抗体第16页
        2.1.4 试剂与药品第16-17页
        2.1.5 培养基及试剂配方第17-18页
        2.1.6 抗生素及其他药品试剂的配方第18页
        2.1.7 仪器和设备第18-19页
    2.2 实验方法第19-25页
        2.2.1 菌株的活化与保藏第19页
        2.2.2 质粒提取第19页
        2.2.3 细菌基因组DNA提取第19页
        2.2.4 PCR扩增第19-20页
        2.2.5 融合PCR的方法第20-21页
        2.2.6 琼脂糖凝胶切胶产物回收第21页
        2.2.7 PCR产物纯化回收第21页
        2.2.8 大肠杆菌电击感受态的制备第21页
        2.2.9 DNA片段与载体的酶切与连接第21-22页
        2.2.10 大肠杆菌电击转化第22页
        2.2.11 双亲结合第22-23页
        2.2.12 维氏气单胞菌生长曲线的测定第23页
        2.2.13 His_6/Flag标签蛋白的Western blot检测第23-24页
        2.2.14 维氏气单胞菌反式翻译底物的纯化第24页
        2.2.15 反式翻译底物的质谱鉴定第24-25页
3 结果与分析第25-44页
    3.1 维氏气单胞菌tmRNA突变体(MutmRNA)的构建与表达第25-32页
        3.1.1 tmRNA标记肽突变位点的设计第25-28页
        3.1.2 tmRNA突变体表达载体的构建第28-30页
        3.1.3 tmRNA突变体对△tmRNA生长缺陷的回补第30-31页
        3.1.4 tmRNA突变体标记蛋白的Western检测第31-32页
    3.2 维氏气单胞菌反式翻译底物的纯化与鉴定第32-40页
        3.2.1 维氏气单胞菌反式翻译底物的纯化分离第32-33页
        3.2.2 维氏气单胞菌反式翻译底物的质谱鉴定与验证第33-34页
        3.2.3 维氏气单胞菌SmpB-MutmRNA在E.coli BL21中的功能验证第34-37页
        3.2.4 FLAG-PspA在BL21中表达载体的构建第37-39页
        3.2.5 E.coli BL21中截短体FLAG-PspA的检测第39-40页
    3.3 维氏气单胞菌反式翻译底物滞留位点的研究第40-44页
        3.3.1 维氏气单胞菌反式翻译底物标记位点的质谱鉴定第40-42页
        3.3.2 AsmA引起核糖体滞留机制预测第42-44页
4 讨论第44-47页
    4.1 核糖体滞留与基因表达的调控第44页
    4.2 tmRNA突变体的构建第44页
    4.3 反式翻译底物的纯化第44-45页
    4.4 反式翻译底物的质谱鉴定第45页
    4.5 反式翻译底物的验证第45-46页
    4.6 反式翻译底物引起核糖体滞留机制的预测第46-47页
5 结论第47-48页
参考文献第48-51页
基金项目资助第51-52页
攻读硕士期间发表的文章第52-53页
致谢第53页

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