| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-20页 |
| 1 藏系绵羊简介 | 第10-11页 |
| 2 遗传标记在藏系绵羊品种鉴定中的应用 | 第11-15页 |
| 2.1 形态学遗传标记的应用 | 第11-12页 |
| 2.2 细胞学遗传标记的应用 | 第12页 |
| 2.3 生化遗传标记的应用 | 第12-13页 |
| 2.4 分子遗传标记的应用 | 第13-15页 |
| 2.4.1 限制性片段长度多态性(RFLP) | 第13-14页 |
| 2.4.2 随机扩增多态性DNA (RAPD) | 第14页 |
| 2.4.3 扩增片段长度多态性(AFLP) | 第14页 |
| 2.4.4 简单重复序列(SSR) | 第14-15页 |
| 2.4.5 单核苷酸序列多态性(SNPs) | 第15页 |
| 3 选择信号 | 第15-18页 |
| 3.1 选择信号的分类 | 第16页 |
| 3.2 选择信号的检测方法 | 第16-18页 |
| 3.2.1 基于位点频率谱的检测方法 | 第17-18页 |
| 3.2.2 基于群体分化的检测方法 | 第18页 |
| 3.2.3 基于连锁不平衡的检测方法 | 第18页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 藏系绵羊群体遗传结构研究 | 第20-32页 |
| 1 材料与方法 | 第20-22页 |
| 1.1 实验动物和样品采集 | 第20页 |
| 1.2 主要实验仪器与试剂 | 第20-21页 |
| 1.3 基因组DNA提取 | 第21-22页 |
| 1.4 基因组DNA质量检测 | 第22页 |
| 2 芯片数据的分型和质量控制 | 第22-23页 |
| 2.1 基因分型 | 第22-23页 |
| 2.2 质量控制 | 第23页 |
| 3 遗传多样性分析 | 第23-24页 |
| 3.1 杂合度 | 第23-24页 |
| 3.2 近交系数 | 第24页 |
| 4 群体结构分析 | 第24-25页 |
| 4.1 主成分分析(PCA) | 第24页 |
| 4.2 系统发育树构建(NJ-tree) | 第24-25页 |
| 4.3 群体结构(STRUCTURE) | 第25页 |
| 5 结果 | 第25-30页 |
| 5.1 分型及质控结果 | 第25-26页 |
| 5.2 遗传多样性分析结果 | 第26-27页 |
| 5.3 群体关系分析结果 | 第27-30页 |
| 5.3.1 藏系绵羊群体进行PCA分析 | 第27-28页 |
| 5.3.2 藏系绵羊群体进行NJ树分析 | 第28-29页 |
| 5.3.3 藏系绵羊群体进行STRUCTURE分析 | 第29-30页 |
| 6 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 藏系绵羊品种特异性遗传标签的构建 | 第32-40页 |
| 1 群体分化指数F_(ST)检验 | 第32页 |
| 2 特异性遗传标签的构建方法 | 第32-33页 |
| 3 基因注释和富集分析 | 第33页 |
| 4 结果 | 第33-39页 |
| 4.1 地域特异性遗传标签的构建 | 第33-35页 |
| 4.2 品种特异性遗传标签的构建 | 第35-37页 |
| 4.3 富集分析结果 | 第37-39页 |
| 5 讨论 | 第39-40页 |
| 第四章 全文结论 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |