| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 文献综述 | 第11-26页 |
| 第一章 植物病原细菌中的harpin类蛋白研究进展 | 第12-20页 |
| 1 harpin蛋白的分子遗传学特性 | 第12-14页 |
| 1.1 harpin蛋白的产生 | 第12页 |
| 1.2 harpin蛋白的主要特征 | 第12-13页 |
| 1.3 harpin在植物细胞中的作用位点 | 第13-14页 |
| 2 harpin蛋白诱导植物防卫反应的分子机理 | 第14-17页 |
| 2.1 harpin蛋白在植物上的效应 | 第14-15页 |
| 2.2 harpin蛋白在植物上启动的信号通路 | 第15-17页 |
| 3 丁香假单胞菌种的harpin蛋白研究进展 | 第17-20页 |
| 3.1 丁香假单胞菌编码的HrpZ蛋白 | 第17页 |
| 3.2 HrpZ蛋白在植物上的生物学效应 | 第17-18页 |
| 3.3 HrpZ蛋白的功能域研究 | 第18-20页 |
| 第二章 植物转录组研究方法及其在植物上的应用 | 第20-26页 |
| 1 概述 | 第20页 |
| 2 转录组分析(转录组测序,RNA-Seq) | 第20-26页 |
| 2.1 转录组测序介绍 | 第20-21页 |
| 2.2 转录组测序流程及信息分析 | 第21-22页 |
| 2.3 转录组分析的应用 | 第22-23页 |
| 2.4 harpin蛋白对植物转录组的影响 | 第23-26页 |
| 研究内容 | 第26-80页 |
| 第一章 丁香假单胞大豆致病变种HrpZ_(PsgS1)重组蛋白编码基因的克隆与表达 | 第28-42页 |
| 1 材料和方法 | 第29-35页 |
| 1.1 菌株和质粒 | 第30-31页 |
| 1.2 主要试剂及仪器 | 第31页 |
| 1.3 缓冲液 | 第31页 |
| 1.4 引物的设计与合成 | 第31-32页 |
| 1.5 hrpZ_(PsgS1)重组片段的PCR扩增 | 第32页 |
| 1.6 hrpZ_(PsgS1)重组克隆载体的构建 | 第32-33页 |
| 1.7 hrpZ_(PsgS1)重组表达载体的构建 | 第33页 |
| 1.8 IPTG诱导HrpZ_(PsgS1)重组蛋白表达 | 第33-34页 |
| 1.9 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白的纯化 | 第34页 |
| 1.10 SDS-PAGE凝胶电泳检测 | 第34-35页 |
| 1.11 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白的脱盐和浓缩 | 第35页 |
| 1.12 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白的浓度测定 | 第35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-40页 |
| 2.1 丁香假单胞大豆致病变种hrpZ_(PsgS1)重组片段的设计 | 第35-36页 |
| 2.2 hrpZ_(PsgS1)重组片段的克隆 | 第36-39页 |
| 2.3 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白的表达纯化 | 第39-40页 |
| 2.4 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白的浓度测定 | 第40页 |
| 3 讨论 | 第40-42页 |
| 第二章 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白在植物上的抗病促生功能检测及机理研究 | 第42-58页 |
| 1 材料和方法 | 第44-48页 |
| 1.1 供试菌株与植物 | 第44页 |
| 1.2 引物的设计与合成 | 第44页 |
| 1.3 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白在烟草上HR能力检测 | 第44-45页 |
| 1.4 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白诱导烟草抗TMV能力检测 | 第45页 |
| 1.5 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白诱导水稻抗白叶枯能力检测 | 第45页 |
| 1.6 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白促水稻种子生长能力检测 | 第45-46页 |
| 1.7 烟草、水稻叶片RNA的提取、质量检测及反转录 | 第46-47页 |
| 1.8 Real-time PCR检测烟草水稻相关基因 | 第47-48页 |
| 2 结果与分析 | 第48-56页 |
| 2.1 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白在烟草上HR能力分析 | 第48-49页 |
| 2.2 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白诱导烟草抗TMV能力分析 | 第49-51页 |
| 2.3 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白诱导水稻抗白叶枯分析 | 第51-52页 |
| 2.4 HrpZ_(PsgS1)重组蛋白促进水稻生长分析 | 第52-53页 |
| 2.5 重组蛋白HrpZ_(Δ89-124)和HrpZ_(Δ254-298)激活烟草防卫反应相关基因的表达 | 第53-55页 |
| 2.6 重组蛋白HrpZ_(Δ89-124)和HrpZ_(Δ254-298)激活水稻促生、抗病相关基因的表达 | 第55-56页 |
| 3 讨论 | 第56-58页 |
| 第三章 HrpZ_(PsgS1)蛋白处理水稻后转录组测序分析 | 第58-80页 |
| 1 材料与方法 | 第60-62页 |
| 1.1 植物材料及供试蛋白 | 第60页 |
| 1.2 植物组织RNA的提取与Real-time PCR引物的合成 | 第60-61页 |
| 1.3 转录组测序 | 第61-62页 |
| 1.3.1 转录组测序实验流程 | 第61页 |
| 1.3.2 原始数据处理统计及测序质量评估 | 第61-62页 |
| 1.3.3 基因表达差异分析 | 第62页 |
| 2 结果与讨论 | 第62-76页 |
| 2.1 测序评估 | 第62-64页 |
| 2.1.1 测序质量分析 | 第62-63页 |
| 2.1.2 测序饱和度分析 | 第63页 |
| 2.1.3 测序基因覆盖度分析 | 第63-64页 |
| 2.1.4 转录组数据可靠性分析 | 第64页 |
| 2.2 HrpZ_(PsgS1)纯蛋白处理与清水处理水稻后差异表达基因分析 | 第64-76页 |
| 2.2.1 翻译(translation) | 第65-66页 |
| 2.2.2 能量代谢(energy metabolism) | 第66-67页 |
| 2.2.3 氨基酸代谢(amino acid metabolism) | 第67-68页 |
| 2.2.4 信号转导(signal transduction) | 第68-71页 |
| 2.2.5 次级代谢物合成(biosynthesis of other secondary metabolites) | 第71-72页 |
| 2.2.6 转录因子(Transcription factor) | 第72-75页 |
| 2.2.7 其他差异表达基因 | 第75-76页 |
| 3 结论 | 第76-80页 |
| 全文总结 | 第80-82页 |
| 论文创新点 | 第82-84页 |
| 参考文献 | 第84-92页 |
| 致谢 | 第92-94页 |
| 攻读硕士期间研究成果 | 第94页 |
