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花生种子不同发育时期的表达谱及DGAT基因的表达分析

致谢第4-8页
摘要第8-10页
第一章 文献综述第10-17页
    1.1 花生概括第10页
    1.2 花生油脂代谢机制研究第10-11页
    1.3 二酰甘油酰基转移酶(DGAT)研究现状第11-12页
    1.4 基因组测序现状第12-13页
    1.5 cDNA文库的概述第13页
    1.6 新一代测序技术第13-15页
        1.6.1 测序技术的发展第13-14页
        1.6.2 新一代测序技术应用第14页
        1.6.3 转录组测序及表达分析第14-15页
        1.6.4 数字基因表达谱第15页
    1.7 本研究的目的和意义第15-17页
第二章 花生种子不同发育时期的转录组测序及表达谱分析第17-35页
    2.1 材料与方法第17-22页
        2.1.1 材料第17页
        2.1.2 方法第17-22页
            2.1.2.1 花生总RNA的提取第17-18页
            2.1.2.2 提取花生种子总RNA的质量检测第18页
            2.1.2.3 花生高、低油份形成关键时期测序文库构建及检测第18页
            2.1.2.4 Solexa高通量测序和组装第18页
            2.1.2.5 Unigene功能注释第18-19页
            2.1.2.6 Unigene的GO分类第19页
            2.1.2.7 Unigene代谢通路分析第19页
            2.1.2.8 Unigene表达量注释第19-20页
            2.1.2.9 差异表达基因的筛选第20-21页
            2.1.2.10 差异表达基因的GO分析第21页
            2.1.2.11 差异表达基因的KEGG Pathway分析第21-22页
    2.2 结果与分析第22-34页
        2.2.1 提取花生种子总RNA的质量检测分析第22页
        2.2.2 转录组测序以及产量统计第22-23页
        2.2.3 转录组测序数据的组装和统计第23-24页
        2.2.4 花生种子转录组Unigene功能注释第24页
        2.2.5 Unigene的蛋白相邻类的聚簇分析第24-26页
        2.2.6 Unigene的基因功能分类分析第26-28页
        2.2.7 Unigene在细胞活动和生物体行为中的解析第28-30页
        2.2.8 花生种子油脂合成初期与高峰期表达谱数据库的比对分析第30-34页
            2.2.8.1 表达谱差异比较第30-31页
            2.2.8.2 KEGG数据库代谢通路第31-34页
    2.3 讨论第34-35页
第三章 DGAT基因的序列分析及表达研究第35-47页
    3.1 材料与方法第35-38页
        3.1.1 材料第35页
        3.1.2 方法第35-38页
            3.1.2.1 花生二酰甘油酰基转移酶(DGAT)基因的获得第35-36页
            3.1.2.2 生物信息学分析第36页
            3.1.2.3 总RNA的提取第36页
            3.1.2.4 引物设计与合成第36-37页
            3.1.2.5 反转录合成cDNA第37页
            3.1.2.6 花生二酰甘油酰基转移酶(DGAT)基因在种子不同发育时期的实时荧光定量PCR第37-38页
    3.2 结果与分析第38-46页
        3.2.1 二酰甘油酰基转移酶(DGAT)序列的获得第38-39页
        3.2.2 对花生二酰甘油酰基转移酶(DGAT)进行生物信息学分析第39-44页
            3.2.2.1 二酰甘油酰基转移酶(DGAT)序列分析第39-41页
            3.2.2.2 花生二酰甘油酰基转移酶(DGAT)蛋白序列分析第41-43页
            3.2.2.3 二酰甘油酰基转移酶(DGAT)基因系统进化树构建第43-44页
        3.2.3 花生DGAT基因在种子发育过程中的表达分析第44-46页
            3.2.3.1 总RNA的提取第44-45页
            3.2.3.2 花生二酰甘油酰基转移酶(DGAT)基因在种子不同发育时期的实时荧光定量PCR第45-46页
    3.3 讨论第46-47页
第四章 结论第47-49页
主要参考文献第49-52页
ABSTRACT第52-53页

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