| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第12-14页 |
| 第一部分 文献综述 | 第14-25页 |
| 1 引言 | 第14-15页 |
| 2 基因组功能区域注释 | 第15-19页 |
| 2.1 转录组 | 第15-17页 |
| 2.2 蛋白组 | 第17-19页 |
| 3 基因组结构多态性注释 | 第19-22页 |
| 3.1 转座子 | 第20页 |
| 3.2 单核苷酸多态性和短片段插入缺失多态性 | 第20-21页 |
| 3.3 基因组结构变异 | 第21-22页 |
| 4 基因组多态性的遗传研究的应用 | 第22-25页 |
| 4.1 群体遗传结构 | 第23页 |
| 4.2 有效种群大小分析 | 第23页 |
| 4.3 基因组的选择信号检测 | 第23-24页 |
| 4.4 比较基因组的研究 | 第24-25页 |
| 第二部分 猪的基因组功能区域注释 | 第25-76页 |
| 第一章 猪编码基因的表达谱 | 第25-41页 |
| 1 引言 | 第25页 |
| 2 试验材料 | 第25-28页 |
| 3 技术路线 | 第28页 |
| 4 试验方法 | 第28-30页 |
| 5 结果与分析 | 第30-39页 |
| 6 讨论 | 第39-40页 |
| 7 小结 | 第40-41页 |
| 第二章 猪长链非编码基因图谱及其表达谱 | 第41-60页 |
| 1 引言 | 第41页 |
| 2 试验材料 | 第41-42页 |
| 3 技术路线 | 第42页 |
| 4 试验方法 | 第42-46页 |
| 5 结果与分析 | 第46-58页 |
| 6 讨论 | 第58页 |
| 7 小结 | 第58-60页 |
| 第三章 猪的蛋白组图谱构建及未知蛋白挖掘 | 第60-76页 |
| 1 引言 | 第60页 |
| 2 试验材料 | 第60-62页 |
| 3 技术路线 | 第62页 |
| 4 试验方法 | 第62-66页 |
| 5 结果与分析 | 第66-74页 |
| 6 讨论 | 第74-75页 |
| 7 小结 | 第75-76页 |
| 第三部分 猪的基因组结构多态性注释及应用 | 第76-120页 |
| 第一章 群体水平的基因组变异检测及群体结构分析 | 第76-88页 |
| 1 引言 | 第76-77页 |
| 2 试验材料 | 第77-78页 |
| 3 技术路线 | 第78页 |
| 4 试验方法 | 第78-80页 |
| 5 结果与分析 | 第80-86页 |
| 6 讨论 | 第86-87页 |
| 7 小结 | 第87-88页 |
| 第二章 猪的人工及自然选择的基因组选择信号检测 | 第88-102页 |
| 1 引言 | 第88页 |
| 2 试验材料 | 第88-89页 |
| 3 技术路线 | 第89页 |
| 4 试验方法 | 第89-90页 |
| 5 结果与分析 | 第90-100页 |
| 6 讨论 | 第100-101页 |
| 7 小结 | 第101-102页 |
| 第三章 猪全基因组SV检测及其在探究欧亚猪种基因交流的应用 | 第102-120页 |
| 1 引言 | 第102-103页 |
| 2 试验材料 | 第103页 |
| 3 技术路线 | 第103页 |
| 4 试验方法 | 第103-106页 |
| 5 结果与分析 | 第106-118页 |
| 6 讨论 | 第118-119页 |
| 7 小结 | 第119-120页 |
| 第四部分 结论 | 第120-124页 |
| 1. 基因组功能区域注释-转录组表达谱 | 第120页 |
| 2. 基因组功能区域注释-LNCRNA图谱 | 第120-121页 |
| 3. 基因组功能区域注释-蛋白谱和未知蛋白 | 第121页 |
| 4. 基因组结构多态性注释-遗传变异检测及群体遗传分析 | 第121-122页 |
| 5. 基因组结构多态性注释-基因组选择信号检测 | 第122页 |
| 6. 基因组结构多态性注释-基因组SV变异检测及应用 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
| 附录 | 第138-170页 |
| 作者简介 | 第170-171页 |
