| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第11-18页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第11-13页 |
| 1.2 国内外研究现状及发展趋势 | 第13-16页 |
| 1.2.1 读段定位的研究现状及发展趋势 | 第13-14页 |
| 1.2.2 可变剪接的研究现状及发展趋势 | 第14-16页 |
| 1.2.3 Hadoop的研究现状及发展趋势 | 第16页 |
| 1.3 本文主要研究工作 | 第16-17页 |
| 1.4 章节安排 | 第17-18页 |
| 第2章 RNA-seq分析的理论与方法 | 第18-37页 |
| 2.1 RNA-seq数据 | 第18-21页 |
| 2.1.1 数据来源及形式 | 第18-20页 |
| 2.1.2 数据分析流程 | 第20-21页 |
| 2.2 读段定位 | 第21-26页 |
| 2.2.1 读段定位流程 | 第21-23页 |
| 2.2.2 读段定位的分析工具及算法 | 第23-26页 |
| 2.3 可变剪接 | 第26-31页 |
| 2.3.1 可变剪接的发生过程 | 第26-27页 |
| 2.3.2 可变剪接的类型 | 第27-29页 |
| 2.3.3 可变剪接的识别工具及算法 | 第29-31页 |
| 2.4 分析平台Hadoop的相关介绍 | 第31-36页 |
| 2.4.1 Hadoop组件 | 第32-35页 |
| 2.4.2 Hadoop集群 | 第35-36页 |
| 2.5 本章小结 | 第36-37页 |
| 第3章 基于Hadoop的RNA-seq读段定位算法的研究 | 第37-46页 |
| 3.1 引言 | 第37页 |
| 3.2 算法过程 | 第37-41页 |
| 3.2.1 算法框架 | 第37-38页 |
| 3.2.2 算法具体实现过程 | 第38-41页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第41-44页 |
| 3.3.1 实验平台及实验数据 | 第41-42页 |
| 3.3.2 实验结果分析 | 第42-44页 |
| 3.4 本章小结 | 第44-46页 |
| 第4章 基于Hadoop的RNA-seq可变剪接识别算法的研究 | 第46-61页 |
| 4.1 引言 | 第46页 |
| 4.2 算法过程 | 第46-51页 |
| 4.2.1 算法框架 | 第46-47页 |
| 4.2.2 算法具体实现过程 | 第47-51页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第51-55页 |
| 4.3.1 实验平台及实验数据 | 第51-52页 |
| 4.3.2 实验结果分析 | 第52-55页 |
| 4.4 可变剪接识别结果的可视化 | 第55-59页 |
| 4.4.1 可变剪接可视化现状 | 第56-57页 |
| 4.4.2 可视化实现流程 | 第57-58页 |
| 4.4.3 可视化结果 | 第58-59页 |
| 4.5 本章小结 | 第59-61页 |
| 结论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-68页 |
| 致谢 | 第68-70页 |