摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
目录 | 第8-10页 |
缩略词表 | 第10-11页 |
前言 | 第11-13页 |
第一章 比较基因组杂交芯片研究胃癌组织 DNA 拷贝数变异 | 第13-24页 |
1.1 材料和方法 | 第13-16页 |
1.1.1 样本收集 | 第13-14页 |
1.1.2 激光捕获显微切割 | 第14页 |
1.1.3 基因组 DNA 提取 | 第14页 |
1.1.4 比较基因组杂交芯片实验 | 第14-15页 |
1.1.5 数据分析 | 第15-16页 |
1.2 结果 | 第16-22页 |
1.2.1 胃癌中的 DNA 拷贝数变异 | 第16-20页 |
1.2.2 不同病理分期或分化阶段之间差异的拷贝数变异区段 | 第20-22页 |
1.3 讨论 | 第22-23页 |
1.4 小结 | 第23-24页 |
第二章 表达谱芯片研究胃癌组织差异表达的 mRNA | 第24-35页 |
2.1 材料和方法 | 第24-25页 |
2.1.1 样本收集 | 第24页 |
2.1.2 总 RNA 提取 | 第24页 |
2.1.3 表达谱芯片实验 | 第24页 |
2.1.4 数据分析 | 第24-25页 |
2.2 结果 | 第25-31页 |
2.2.1 胃癌中差异表达的基因 | 第25-30页 |
2.2.2 功能网络分析 | 第30-31页 |
2.3 讨论 | 第31-34页 |
2.4 小结 | 第34-35页 |
第三章 DNA 拷贝数与基因表达芯片数据的整合分析 | 第35-69页 |
3.1 材料和方法 | 第35-37页 |
3.1.1 样本收集 | 第35页 |
3.1.2 芯片实验 | 第35页 |
3.1.3 芯片数据分析 | 第35-36页 |
3.1.4 qRT-PCR 定量实验 | 第36页 |
3.1.5 功能预测分析 | 第36-37页 |
3.1.6 统计分析 | 第37页 |
3.2 结果 | 第37-61页 |
3.2.1 拷贝数相关的基因表达变异 | 第37-42页 |
3.2.2 染色体 8q 区段内的胃癌相关基因 | 第42-52页 |
3.2.3 四基因组合对胃癌诊断的价值 | 第52-56页 |
3.2.4 功能预测分析 | 第56-61页 |
3.3 讨论 | 第61-68页 |
3.4 小结 | 第68-69页 |
总结 | 第69-71页 |
参考文献 | 第71-83页 |
附录 | 第83-94页 |
连接酶链式反应的研究进展 | 第94-107页 |
参考文献 | 第103-107页 |
致谢 | 第107-108页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第108页 |