| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-22页 |
| 1.1 遗传标记的种类及特点 | 第11-13页 |
| 1.1.1 形态学标记 | 第11-12页 |
| 1.1.2 细胞学标记 | 第12页 |
| 1.1.3 生物化学标记 | 第12页 |
| 1.1.4 分子标记 | 第12-13页 |
| 1.2 陆地棉早熟、产量和纤维品质相关性状的 QTL 定位 | 第13-15页 |
| 1.2.1 早熟相关性状的 QTL 定位 | 第13页 |
| 1.2.2 产量相关性状的 QTL 定位 | 第13-14页 |
| 1.2.3 纤维品质相关性状的 QTL 定位 | 第14-15页 |
| 1.3 关联分析 | 第15-21页 |
| 1.3.1 关联分析的优势 | 第15-16页 |
| 1.3.2 关联分析的两种策略及基本步骤 | 第16-18页 |
| 1.3.3 影响关联分析的因素及假阳性消除 | 第18-19页 |
| 1.3.4 关联分析在植物中的应用 | 第19-20页 |
| 1.3.5 关联分析的发展趋势及展望 | 第20-21页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第21-22页 |
| 第二章 材料和方法 | 第22-31页 |
| 2.1 供试材料 | 第22-24页 |
| 2.2 田间种植和性状调查 | 第24-25页 |
| 2.3 棉花基因组 DNA 的提取及检测 | 第25-27页 |
| 2.3.1 前期准备工作 | 第25-26页 |
| 2.3.2 棉花基因组 DNA 提取过程及检测方法 | 第26-27页 |
| 2.4 分子标记实验 | 第27-29页 |
| 2.4.1 SSR 引物筛选 | 第27页 |
| 2.4.2 PCR 扩增反应 | 第27页 |
| 2.4.3 PCR 产物检测 | 第27-29页 |
| 2.5 数据的统计与分析 | 第29-31页 |
| 2.5.1 表型数据的统计分析 | 第29页 |
| 2.5.2 带型统计方法 | 第29页 |
| 2.5.3 遗传多样性分析 | 第29页 |
| 2.5.4 相似系数计算和聚类分析 | 第29页 |
| 2.5.5 群体结构分析 | 第29-30页 |
| 2.5.6 性状与 SSR 分子标记的关联分析 | 第30-31页 |
| 第三章 结果与分析 | 第31-76页 |
| 3.1 供试材料性状表型数据分析 | 第31-38页 |
| 3.1.1 表型数据的统计描述与方差分析 | 第31-36页 |
| 3.1.2 性状间相关分析 | 第36-38页 |
| 3.2 SSR 引物的筛选和遗传多样性分析 | 第38页 |
| 3.3 供试材料间相似系数和聚类分析 | 第38-40页 |
| 3.3.1 供试材料间相似系数 | 第38-39页 |
| 3.3.2 供试材料的聚类分析 | 第39-40页 |
| 3.4 供试材料的群体结构分析 | 第40-41页 |
| 3.5 SSR 标记与性状的关联分析 | 第41-76页 |
| 3.5.1 利用 GLM 方法检测关联位点 | 第42-62页 |
| 3.5.2 利用 MLM 方法检测关联位点 | 第62-67页 |
| 3.5.3 GLM 方法与 MLM 方法关联分析结果比较 | 第67-68页 |
| 3.5.4 部分关联位点的表型效应 | 第68-76页 |
| 第四章 讨论 | 第76-82页 |
| 4.1 陆地棉品种（系）群体结构分析 | 第76页 |
| 4.2 两种关联分析方法的比较 | 第76-77页 |
| 4.3 与前人研究结果的比较 | 第77-78页 |
| 4.4 与多个性状关联的 SSR 位点 | 第78页 |
| 4.5 研究结果应用展望 | 第78-82页 |
| 第五章 结论 | 第82-84页 |
| 参考文献 | 第84-90页 |
| 缩略词 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 作者简介 | 第92页 |
