| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 前言 | 第15-28页 |
| 1. 海洋微生物 | 第15页 |
| 2. 深海沉积物 | 第15-16页 |
| 3. 南太平洋环流区 | 第16-17页 |
| 4 海洋新菌的分类鉴定 | 第17-27页 |
| 4.1 表型特征的分类鉴定 | 第18-22页 |
| 4.1.1. 形态学指标 | 第19-20页 |
| 4.1.2 细胞革兰氏染色 | 第20页 |
| 4.1.3 肽聚糖 | 第20页 |
| 4.1.4 呼吸醌 | 第20-21页 |
| 4.1.5 脂肪酸及其衍生物 | 第21-22页 |
| 4.1.6 极性脂 | 第22页 |
| 4.1.7 快速鉴定系统 | 第22页 |
| 4.2 基于遗传学的分类鉴定 | 第22-25页 |
| 4.2.1 16S rRNA 基因序列分析 | 第23-24页 |
| 4.2.2 系统进化树 | 第24页 |
| 4.2.3 其他基因 | 第24页 |
| 4.2.4 核酸分子杂交 | 第24-25页 |
| 4.2.5 DNA G+C 含量 | 第25页 |
| 4.2.6 全基因组序列 | 第25页 |
| 4.2.7 核酸指纹 | 第25页 |
| 4.3 海洋新菌的鉴定流程 | 第25-27页 |
| 5 本论文研究的目的和意义 | 第27-28页 |
| 第二章 三株海洋细菌新种—深渊藤黄单胞菌（Luteimonas abyssi sp.nov.）的分类鉴定 | 第28-50页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第29-31页 |
| 1.1 主要仪器 | 第29-30页 |
| 1.2 试剂及培养基 | 第30-31页 |
| 1.2.1 实验试剂 | 第30页 |
| 1.2.2 生长培养基 | 第30-31页 |
| 1.2.3 酶活性检测培养基 | 第31页 |
| 2. 实验方法 | 第31-38页 |
| 2.1 实验菌株及来源 | 第31-32页 |
| 2.1.1 待测菌株 XH031T、XH038-3 和 XH80-1 | 第31-32页 |
| 2.1.2 参考菌株 | 第32页 |
| 2.2 基于遗传学的分类鉴定 | 第32-33页 |
| 2.2.1 实验菌株 16S rDNA 序列分析 | 第32页 |
| 2.2.2 系统进化树的构建 | 第32页 |
| 2.2.3 DNA G+C 含量测定 | 第32-33页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第33-38页 |
| 2.3.1 实验菌株菌落、菌体形态及运动性观察 | 第33页 |
| 2.3.2 实验菌株经典生理生化鉴定 | 第33-36页 |
| 2.3.3 实验菌株快速鉴定系统 | 第36-37页 |
| 2.3.4 化学类指标特征鉴定 | 第37-38页 |
| 3. 实验结果 | 第38-47页 |
| 3.1 基于遗传学的分析结果 | 第38-40页 |
| 3.1.1 XH031~T、XH038-3 和 XH80-116S rDNA 测序结果、分析及系统发生树 | 第38-40页 |
| 3.1.2 DNA G+C 含量 | 第40页 |
| 3.2 基于表型特征的鉴定结果 | 第40-47页 |
| 3.2.1 菌落形态、菌体形态及运动性 | 第40-41页 |
| 3.2.2 经典生理生化特征 | 第41页 |
| 3.2.3 快速鉴定系统 | 第41-45页 |
| 3.2.4 化学分类特征 | 第45-47页 |
| 4. 讨论 | 第47-50页 |
| 第三章 一株海洋细菌新属新种—沉积物海洋杆菌（Oceanobacterium sediminum gen. nov., sp. nov.）的分类鉴定 | 第50-60页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第50页 |
| 2. 实验方法 | 第50-51页 |
| 2.1 实验菌株及来源 | 第50-51页 |
| 2.2 基于遗传学的分类鉴定 | 第51页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第51页 |
| 3. 实验结果 | 第51-57页 |
| 3.1 基于遗传学的分析结果 | 第51-53页 |
| 3.1.1 XH089T的 16S rDNA 测序结果、分析及系统发生树 | 第51-53页 |
| 3.1.2 DNA G+C 含量 | 第53页 |
| 3.2 基于表型特征的鉴定结果 | 第53-57页 |
| 3.2.1 菌落形态、菌体形态及运动性 | 第53-54页 |
| 3.2.2 经典生理生化特征 | 第54页 |
| 3.2.3 快速鉴定系统 | 第54-56页 |
| 3.2.4 化学分类特征 | 第56-57页 |
| 4. 讨论 | 第57-60页 |
| 第四章 一株海洋细菌新种—太平洋类诺卡氏菌（Nocardioides pacificus sp. nov.）的分类鉴定 | 第60-70页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第60页 |
| 2. 实验方法 | 第60-61页 |
| 2.1 实验菌株及来源 | 第60页 |
| 2.2 基于遗传学的分类鉴定 | 第60-61页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第61页 |
| 2.3.4 化学分类特征 | 第61页 |
| 3. 实验结果 | 第61-68页 |
| 3.1 基于遗传学的分析结果 | 第61-63页 |
| 3.1.1 XH274~T的 16S rDNA 测序结果、分析及系统发生树 | 第61-63页 |
| 3.1.2 DNA G+C 含量 | 第63页 |
| 3.2 基于表型特征的鉴定结果 | 第63-68页 |
| 3.2.1 菌落形态、菌体形态及运动性 | 第63-64页 |
| 3.2.2 经典生理生化特征 | 第64页 |
| 3.2.3 快速鉴定系统 | 第64-66页 |
| 3.2.4 化学分类特征 | 第66-68页 |
| 4. 讨论 | 第68-70页 |
| 第五章 一株海洋细菌新种—沉积物黄球菌（Luteococcus sediminum sp. nov.）的分类鉴定 | 第70-80页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第70-71页 |
| 1.1 主要仪器 | 第70页 |
| 1.2 试剂及培养基 | 第70-71页 |
| 1.2.2 生长培养基 | 第70-71页 |
| 1.2.3 酶活性检测培养基 | 第71页 |
| 2. 实验方法 | 第71-72页 |
| 2.1 实验菌株及来源 | 第71-72页 |
| 2.2 基于遗传学的分类鉴定 | 第72页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第72页 |
| 2.3.4 化学分类特征 | 第72页 |
| 3. 实验结果 | 第72-77页 |
| 3.1 基于遗传学的分析结果 | 第72-74页 |
| 3.1.1 XH208~T的 16S rDNA 测序结果、分析及系统发生树 | 第72-74页 |
| 3.1.2 DNA G+C 含量 | 第74页 |
| 3.2 基于表型特征的鉴定结果 | 第74-77页 |
| 3.2.1 菌落形态、菌体形态及运动性 | 第74页 |
| 3.2.2 经典生理生化特征 | 第74页 |
| 3.2.3 快速鉴定系统 | 第74-76页 |
| 3.2.4 化学分类特征 | 第76-77页 |
| 4. 讨论 | 第77-80页 |
| 总结 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 个人简历 | 第89页 |
| 发表的或正在撰写的学术论文 | 第89-90页 |
