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全基因组鉴定甘蓝型油菜GRAS基因家族

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
1 引言第11-29页
    1.1 GRAS基因家族第11-16页
        1.1.1 植物转录因子第11-12页
        1.1.2 GRAS转录因子家族的结构与分类第12-14页
        1.1.3 GRAS转录因子家族的功能第14-15页
        1.1.4 GRAS转录因子家族的全基因组鉴定第15-16页
    1.2 甘蓝型油菜与祖先种的简介第16-19页
        1.2.1 芸薹属植物及基因组测序第16-18页
        1.2.2 白菜与甘蓝的起源与进化关系第18-19页
    1.3 全基因组多倍化事件第19-21页
    1.4 异源多倍化第21-23页
    1.5 串联重复事件第23-24页
    1.6 转录组测序简介第24-25页
    1.7 选择压力分析第25-27页
    1.8 本研究的目的与意义第27-29页
2 甘蓝型油菜GRAS家族基因鉴定与分析第29-45页
    2.1 实验方法第29-32页
        2.1.1 甘蓝型油菜GRAS基因家族的鉴定第29-30页
        2.1.2 亚家族与OG分类第30-31页
        2.1.3 基因结构分析第31页
        2.1.4 基因表达水平的计算第31-32页
    2.2 结果与分析第32-43页
        2.2.1 甘蓝型油菜GRAS基因家族鉴定分析第32-36页
        2.2.2 GRAS基因家族的分类分析第36-38页
        2.2.3 GRAS基因结构的分析第38-39页
        2.2.4 GRAS基因家族的组织表达特征分析第39-41页
        2.2.5 GRAS基因家族在非生物胁迫与生物胁迫下的表达分析第41-43页
    2.3 讨论第43-45页
3 甘蓝型油菜GRAS基因家族的进化分析第45-67页
    3.1 实验方法第45-46页
        3.1.1 各物种GRAS基因家族的重新分类与统计第45-46页
        3.1.2 甘蓝型油菜与白菜、甘蓝GRAS基因染色体定位的比较分析第46页
        3.1.3 甘蓝型油菜与白菜、甘蓝GRAS基因表达水平的比较分析第46页
        3.1.4 选择压力值的计算第46页
    3.2 结果与分析第46-66页
        3.2.1 基因组多倍化对甘蓝型油菜GRAS基因家族扩张造成的影响第46-53页
        3.2.2 异源多倍化对甘蓝型油菜GRAS基因结构产生的影响第53-54页
        3.2.3 异源多倍化对甘蓝型油菜GRAS基因染色体定位的影响第54-56页
        3.2.4 异源多倍化对GRAS基因表达特征的影响第56-58页
        3.2.5 选择压力值分析第58-66页
    3.3 讨论第66-67页
4 结论与展望第67-69页
    4.1 结论第67-68页
    4.2 展望第68-69页
参考文献第69-76页
附录第76-87页
个人简历第87-88页
致谢第88-89页

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