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棉花扩展蛋白基因的鉴定及特征研究

摘要第4-6页
abstract第6-8页
第一章 文献综述第11-30页
    引言第11-13页
    1.1 棉纤维发育机制研究进展第13-15页
        1.1.1 棉纤维细胞的起始分化期第13-14页
        1.1.2 棉纤维的伸长和初生壁合成期第14-15页
        1.1.3 次生壁加厚期第15页
        1.1.4 棉纤维的脱水成熟第15页
    1.2 扩展蛋白研究进展第15-27页
        1.2.1 扩展蛋白的发现第15-16页
        1.2.2 扩展蛋白基因家族第16-17页
        1.2.3 扩展蛋白基因的进化第17-19页
        1.2.4 扩展蛋白的结构及作用特点第19-21页
        1.2.5 扩展蛋白伸展细胞壁的机制第21-23页
        1.2.6 扩展蛋白的细胞定位及细胞壁结合特性第23页
        1.2.7 扩展蛋白的基因调节与生理作用第23-27页
    1.3 Expansin在棉花纤维中的研究进展第27-28页
    1.4 本研究的目的及意义第28-30页
第二章 雷蒙德氏棉扩展蛋白基因家族的鉴定和特征分析第30-51页
    2.1 材料和方法第31-33页
        2.1.1 雷蒙德氏棉中搜索扩展蛋白基因家族成员第31页
        2.1.2 系统发育树的构建及基因命名第31页
        2.1.3 基因的结构、染色体定位和基因共线性分析第31页
        2.1.4 序列分析及理化性质分析第31-32页
        2.1.5 深度测序表达谱的获得与分析第32-33页
    2.2 结果与分析第33-47页
        2.2.1 雷蒙德氏棉扩展蛋白基因家族第33-39页
        2.2.2 Expansin基因在染色体上的分布及共线性分析第39-42页
        2.2.3 基因结构分析第42-43页
        2.2.4 序列一致性分析及系统进化树第43页
        2.2.5 密码子偏好性分析第43-45页
        2.2.6 扩展蛋白的一级结构第45页
        2.2.7 扩展蛋白理化特征第45-46页
        2.2.8 扩展蛋白家族成员的表达特征分析第46-47页
    2.3 讨论第47-49页
    2.4 结论第49-51页
第三章 陆地棉中扩展蛋白基因家族的进化和表达研究第51-76页
    3.1 材料与方法第51-53页
        3.1.1 扩展蛋白基因家族的搜索和注释第51页
        3.1.2 序列比对与系统发育树分析第51-52页
        3.1.3 基因内含子-外显子构成和蛋白序列的模体分析第52页
        3.1.4 串联重复和同线性分析第52页
        3.1.5 棉属Expansin基因表达分析第52-53页
    3.2 结果与分析第53-73页
        3.2.1 陆地棉扩展蛋白基因的鉴定第53-59页
        3.2.2 棉属不同物种扩展蛋白家族成员的比较分析第59-60页
        3.2.3 基因的进化树、外显子/内含子结构、蛋白模体分析第60-66页
        3.2.4 扩展蛋白基因家族的倍增/扩张形式第66-68页
        3.2.5 陆地棉和拟南芥Expansin家族基因的进化关系第68-69页
        3.2.6 陆地棉Expansin基因的表达情况第69-71页
        3.2.7 直系同源基因的表达丰度比较第71-72页
        3.2.8 基因芯片表达分析第72-73页
    3.3 讨论第73-75页
    3.4 结论第75-76页
参考文献第76-82页
致谢第82-83页
作者简介第83页
攻读硕士学位期间发表论文第83页

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