摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-8页 |
第一章 文献综述 | 第11-30页 |
引言 | 第11-13页 |
1.1 棉纤维发育机制研究进展 | 第13-15页 |
1.1.1 棉纤维细胞的起始分化期 | 第13-14页 |
1.1.2 棉纤维的伸长和初生壁合成期 | 第14-15页 |
1.1.3 次生壁加厚期 | 第15页 |
1.1.4 棉纤维的脱水成熟 | 第15页 |
1.2 扩展蛋白研究进展 | 第15-27页 |
1.2.1 扩展蛋白的发现 | 第15-16页 |
1.2.2 扩展蛋白基因家族 | 第16-17页 |
1.2.3 扩展蛋白基因的进化 | 第17-19页 |
1.2.4 扩展蛋白的结构及作用特点 | 第19-21页 |
1.2.5 扩展蛋白伸展细胞壁的机制 | 第21-23页 |
1.2.6 扩展蛋白的细胞定位及细胞壁结合特性 | 第23页 |
1.2.7 扩展蛋白的基因调节与生理作用 | 第23-27页 |
1.3 Expansin在棉花纤维中的研究进展 | 第27-28页 |
1.4 本研究的目的及意义 | 第28-30页 |
第二章 雷蒙德氏棉扩展蛋白基因家族的鉴定和特征分析 | 第30-51页 |
2.1 材料和方法 | 第31-33页 |
2.1.1 雷蒙德氏棉中搜索扩展蛋白基因家族成员 | 第31页 |
2.1.2 系统发育树的构建及基因命名 | 第31页 |
2.1.3 基因的结构、染色体定位和基因共线性分析 | 第31页 |
2.1.4 序列分析及理化性质分析 | 第31-32页 |
2.1.5 深度测序表达谱的获得与分析 | 第32-33页 |
2.2 结果与分析 | 第33-47页 |
2.2.1 雷蒙德氏棉扩展蛋白基因家族 | 第33-39页 |
2.2.2 Expansin基因在染色体上的分布及共线性分析 | 第39-42页 |
2.2.3 基因结构分析 | 第42-43页 |
2.2.4 序列一致性分析及系统进化树 | 第43页 |
2.2.5 密码子偏好性分析 | 第43-45页 |
2.2.6 扩展蛋白的一级结构 | 第45页 |
2.2.7 扩展蛋白理化特征 | 第45-46页 |
2.2.8 扩展蛋白家族成员的表达特征分析 | 第46-47页 |
2.3 讨论 | 第47-49页 |
2.4 结论 | 第49-51页 |
第三章 陆地棉中扩展蛋白基因家族的进化和表达研究 | 第51-76页 |
3.1 材料与方法 | 第51-53页 |
3.1.1 扩展蛋白基因家族的搜索和注释 | 第51页 |
3.1.2 序列比对与系统发育树分析 | 第51-52页 |
3.1.3 基因内含子-外显子构成和蛋白序列的模体分析 | 第52页 |
3.1.4 串联重复和同线性分析 | 第52页 |
3.1.5 棉属Expansin基因表达分析 | 第52-53页 |
3.2 结果与分析 | 第53-73页 |
3.2.1 陆地棉扩展蛋白基因的鉴定 | 第53-59页 |
3.2.2 棉属不同物种扩展蛋白家族成员的比较分析 | 第59-60页 |
3.2.3 基因的进化树、外显子/内含子结构、蛋白模体分析 | 第60-66页 |
3.2.4 扩展蛋白基因家族的倍增/扩张形式 | 第66-68页 |
3.2.5 陆地棉和拟南芥Expansin家族基因的进化关系 | 第68-69页 |
3.2.6 陆地棉Expansin基因的表达情况 | 第69-71页 |
3.2.7 直系同源基因的表达丰度比较 | 第71-72页 |
3.2.8 基因芯片表达分析 | 第72-73页 |
3.3 讨论 | 第73-75页 |
3.4 结论 | 第75-76页 |
参考文献 | 第76-82页 |
致谢 | 第82-83页 |
作者简介 | 第83页 |
攻读硕士学位期间发表论文 | 第83页 |