| 中文摘要 | 第10-13页 |
| ABSTRACT | 第13-15页 |
| 1 引言 | 第16-49页 |
| 1.1 绵羊肠道特点 | 第16-23页 |
| 1.1.1 十二指肠的形态、位置和肠壁结构 | 第16-17页 |
| 1.1.2 盲肠、结肠的形态位置和肠壁结构 | 第17-19页 |
| 1.1.3 绵羊肠道消化吸收特点 | 第19-22页 |
| 1.1.4 动物营养基因组学研究进展 | 第22-23页 |
| 1.2 miRNA研究进展 | 第23-38页 |
| 1.2.1 生物系统中的miRNA | 第23-25页 |
| 1.2.2 miRNA序列特征 | 第25-26页 |
| 1.2.3 miRNA的生物合成 | 第26-28页 |
| 1.2.4 miRNA的选择性加工 | 第28-29页 |
| 1.2.5 miRNA基因的表达调节 | 第29-31页 |
| 1.2.6 miRNA靶标和功能 | 第31-32页 |
| 1.2.7 miRNA在生物学过程中的功能 | 第32-38页 |
| 1.3 肠道组织miRNA研究进展 | 第38-46页 |
| 1.3.1 miRNA在肠道上皮增殖和分化中的控制作用 | 第39-40页 |
| 1.3.2 miRNA调控肠道上皮细胞凋亡 | 第40-41页 |
| 1.3.3 miRNA是肠道炎症和自噬的主要调节因子 | 第41-42页 |
| 1.3.4 宿主分泌的miRNA与肠道微生物群的控制 | 第42-43页 |
| 1.3.5 肠道微生物群通过诱导特异性miRNA影响宿主基因表达程序 | 第43-44页 |
| 1.3.6 肠道微生物群的代谢物影响miRNA表达 | 第44-46页 |
| 1.4 小尾寒羊和杜泊羊的种质特性 | 第46-47页 |
| 1.4.1 杜泊羊种质特性 | 第46页 |
| 1.4.2 小尾寒羊品种特性 | 第46页 |
| 1.4.3 小尾寒羊、杜泊羊在生产中的应用 | 第46-47页 |
| 1.5 研究的目的意义 | 第47-49页 |
| 2 材料方法 | 第49-56页 |
| 2.1 实验材料 | 第49-50页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第49页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第49页 |
| 2.1.3 主要数据库及生物分析软件 | 第49-50页 |
| 2.2 实验方法 | 第50-56页 |
| 2.2.1 小RNA文库构建 | 第50页 |
| 2.2.2 小RNA测序数据生物信息学分析 | 第50-53页 |
| 2.2.3 差异表达miRNA实时定量PCR(qRT-PCR)验证 | 第53-56页 |
| 3 结果与分析 | 第56-98页 |
| 3.1 两个绵羊品种肠道组织小RNA文库构建及Solexa测序结果 | 第56-64页 |
| 3.1.1 测序数据质量及序列长度分布特征 | 第56-58页 |
| 3.1.2 文库间sRNA公共与特有序列及基因组定位分析 | 第58-62页 |
| 3.1.3 小RNA序列的分类注释 | 第62-64页 |
| 3.2 肠道组织已知miRNA的鉴定 | 第64-68页 |
| 3.2.1 已知miRNA在不同肠道组织的分布 | 第64-65页 |
| 3.2.2 已知miRNA碱基特性分析 | 第65-67页 |
| 3.2.3 miRNA家族分析 | 第67-68页 |
| 3.3 肠道组织novelmiRNA鉴定 | 第68-70页 |
| 3.3.1 novelmiRNA在不同肠道组织分布 | 第68-69页 |
| 3.3.2 novelmiRNA碱基分布特征 | 第69-70页 |
| 3.4 小尾寒羊肠道组织差异表达miRNA及功能分析 | 第70-78页 |
| 3.4.1 差异表达miRNA鉴定 | 第70-73页 |
| 3.4.2 差异表达miRNA靶基因预测 | 第73页 |
| 3.4.3 差异表达miRNA靶基因的GO注释 | 第73-75页 |
| 3.4.4 差异表达miRNA靶基因的KEGG通路分析和调控网络分析 | 第75-78页 |
| 3.5 杜泊羊肠道组织差异表达miRNA及功能分析 | 第78-86页 |
| 3.5.1 差异表达miRNA鉴定 | 第78-81页 |
| 3.5.2 差异表达miRNA靶基因预测 | 第81页 |
| 3.5.3 差异表达miRNA靶基因的GO注释 | 第81-83页 |
| 3.5.4 差异表达miRNA靶基因的KEGG调控网络分析 | 第83-86页 |
| 3.6 两个绵羊品种肠道组织差异表达miRNA及功能分析 | 第86-96页 |
| 3.6.1 差异表达miRNA鉴定 | 第86-87页 |
| 3.6.2 差异表达miRNA靶基因预测 | 第87-88页 |
| 3.6.3 差异表达miRNA靶基因的GO注释 | 第88-90页 |
| 3.6.4 差异表达miRNA靶基因的KEGG调控网络分析 | 第90-96页 |
| 3.7 差异表达miRNAqRT-PCR验证 | 第96-98页 |
| 4 讨论 | 第98-104页 |
| 4.1 小RNA文库数据质量的可靠性 | 第98页 |
| 4.2 miRNA差异表达及其在染色体上分布偏好 | 第98-99页 |
| 4.3 差异表达miRNA与小尾寒羊肠段间转录水平调控 | 第99-101页 |
| 4.4 差异表达miRNA与杜泊绵羊肠段间转录水平调控 | 第101-102页 |
| 4.5 差异表达miRNA与两品种三段肠道间转录水平调控 | 第102-104页 |
| 5 结论 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第131页 |
