| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 插表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第12-13页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第12页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第12-13页 |
| 1.2 质谱数据 | 第13-15页 |
| 1.2.1 蛋白质质谱分析 | 第14页 |
| 1.2.2 质谱图 | 第14-15页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第15-18页 |
| 1.3.1 国内研究现状 | 第15-16页 |
| 1.3.2 国外研究现状 | 第16-18页 |
| 1.4 论文结构和内容 | 第18-20页 |
| 第2章 蛋白质鉴定 | 第20-30页 |
| 2.1 概述 | 第20-21页 |
| 2.2 蛋白质质谱鉴定基本流程 | 第21-22页 |
| 2.3 基于质谱串联（MS/MS）的蛋白质鉴定算法 | 第22-29页 |
| 2.3.1 从头测序算法 | 第22-24页 |
| 2.3.2 序列搜索鉴定算法 | 第24-28页 |
| 2.3.3 使用 Tag 的方法 | 第28页 |
| 2.3.4 质谱数据库搜索方法 | 第28-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 蛋白质直接鉴定算法 | 第30-40页 |
| 3.1 基本思想 | 第30-31页 |
| 3.2 质谱数据预处理 | 第31-32页 |
| 3.3 一级质谱数据分析 | 第32-38页 |
| 3.4 二级质谱数据分析 | 第38-39页 |
| 3.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第4章 基于 Galaxy 的蛋白质直接鉴定系统设计 | 第40-50页 |
| 4.1 Galaxy 平台 | 第40-41页 |
| 4.2 系统设计思想 | 第41-43页 |
| 4.3 蛋白质鉴定系统的设计 | 第43-49页 |
| 4.3.1 蛋白质质谱数据提取 | 第43-45页 |
| 4.3.2 分析得到高质量的质谱 | 第45-47页 |
| 4.3.3 获取离子对并匹配鉴定肽段 | 第47-49页 |
| 4.4 本章小结 | 第49-50页 |
| 第5章 基于 Galaxy 的蛋白质直接鉴定系统实现 | 第50-61页 |
| 5.1 系统实现 | 第50-56页 |
| 5.1.1 解析质谱数据流程的实现 | 第50-53页 |
| 5.1.2 一级质谱分析流程实现 | 第53-54页 |
| 5.1.3 二级质谱分析流程实现 | 第54-56页 |
| 5.2 系统测试 | 第56-57页 |
| 5.3 系统演示 | 第57-60页 |
| 5.4 本章小结 | 第60-61页 |
| 结论与展望 | 第61-63页 |
| 一、工作总结 | 第61-62页 |
| 二、工作展望 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录 | 第68-69页 |
| 附录B 攻读学位期间所参与的主要项目 | 第69页 |
