| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第1章 总论 | 第11-41页 |
| 1.1 引言 | 第11-12页 |
| 1.2 高分子链的静力学性质 | 第12-21页 |
| 1.2.1 理想链模型 | 第12-17页 |
| 1.2.2 真实链模型 | 第17-21页 |
| 1.3 高分子链的动力学性质 | 第21-24页 |
| 1.3.1 Rouse模型 | 第21-22页 |
| 1.3.2 Zime模型 | 第22-23页 |
| 1.3.3 Reptation模型 | 第23-24页 |
| 1.4 分子拥挤 | 第24-30页 |
| 1.4.1 排除体积效应 | 第25-27页 |
| 1.4.2 拥挤环境对粒子扩散的影响 | 第27-29页 |
| 1.4.3 拥挤环境下大分子的构象转变 | 第29-30页 |
| 1.5 分子拥挤 | 第30-36页 |
| 1.5.1 受限于纳米管道中 | 第31-33页 |
| 1.5.2 受限于平行板中 | 第33-34页 |
| 1.5.3 吸附于平面上 | 第34-35页 |
| 1.5.4 聚合物受力拉伸 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-41页 |
| 第2章 模拟模型与计算方法 | 第41-52页 |
| 2.1 引言 | 第41-42页 |
| 2.2 模拟方法介绍 | 第42-46页 |
| 2.2.1 分子动力学模拟(MD) | 第42-44页 |
| 2.2.2 朗之万动力学模拟(LD) | 第44-46页 |
| 2.3 模拟中的常见处理技巧 | 第46-49页 |
| 2.3.1 珠簧链模型 | 第46-47页 |
| 2.3.2 周期性边界条件与截断半径 | 第47-48页 |
| 2.3.3 Verlet邻近列表算法 | 第48-49页 |
| 2.4 本章小结 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-52页 |
| 第3章 不对称拥挤环境诱导的高分子链穿越纳米孔的动力学 | 第52-74页 |
| 3.1 引言 | 第52-54页 |
| 3.2 模型及模拟方法 | 第54-56页 |
| 3.3 结果及讨论 | 第56-66页 |
| 3.3.1 理论分析 | 第56-60页 |
| 3.3.2 数值模拟结果 | 第60-66页 |
| 3.4 本章小结 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-74页 |
| 第4章 分子拥挤和蛋白结合效应对DNA链分离动力学的影响 | 第74-94页 |
| 4.1 引言 | 第74-76页 |
| 4.2 模型及模拟方法 | 第76-78页 |
| 4.3 结果及讨论 | 第78-88页 |
| 4.3.1 在没有结合粒子存在的拥挤环境中的链分离 | 第78-84页 |
| 4.3.2 有结合粒子存在的拥挤环境中的链分离 | 第84-88页 |
| 4.4 本章小结 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-94页 |
| 第5章 受限在纳米管道中的半刚性高分子链的逃逸动力学 | 第94-113页 |
| 5.1 引言 | 第94-95页 |
| 5.2 模型及模拟方法 | 第95-97页 |
| 5.3 结果及讨论 | 第97-106页 |
| 5.3.1 理论分析 | 第97-99页 |
| 5.3.2 数值模拟结果 | 第99-106页 |
| 5.4 本章小结 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-113页 |
| 第6章 全文总结 | 第113-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第116页 |
