二化螟抗药性相关基因家族分析及数据库的构建
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词中英文对照 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-35页 |
| 1 测序技术的发展 | 第12-16页 |
| 1.1 第一代测序技术 | 第13页 |
| 1.2 第二代测序技术 | 第13-15页 |
| 1.3 第三代测序技术 | 第15-16页 |
| 1.4 小结 | 第16页 |
| 2 生物信息学在昆虫学中的应用 | 第16-20页 |
| 2.1 生物信息学 | 第16-17页 |
| 2.2 昆虫是重要的研究对象 | 第17-18页 |
| 2.3 生物信息学在昆虫学中的应用 | 第18-20页 |
| 2.4 小结 | 第20页 |
| 3 昆虫基因组与转录组研究进展 | 第20-27页 |
| 3.1 i5k计划 | 第20-21页 |
| 3.2 昆虫基因组研究进展 | 第21-25页 |
| 3.3 昆虫转录组研究进展 | 第25-26页 |
| 3.4 小结 | 第26-27页 |
| 4 昆虫数据库研究进展 | 第27-34页 |
| 4.1 数据库的功能 | 第27-28页 |
| 4.2 基因组数据库的分类 | 第28-29页 |
| 4.3 基因组数据库的基本构成 | 第29-30页 |
| 4.4 目前昆虫基因组数据库的现状 | 第30-34页 |
| 4.5 小结 | 第34页 |
| 5 本研究目的和意义 | 第34-35页 |
| 第二章 二化螟抗性相关基因家族分析 | 第35-51页 |
| 1 引言 | 第35-36页 |
| 2 材料和方法 | 第36-38页 |
| 2.1 数据 | 第36页 |
| 2.2 生物信息学硬件和软件 | 第36-37页 |
| 2.3 农药抗性相关基因家族鉴定 | 第37页 |
| 2.4 Bt毒素抗性相关基因家族鉴定 | 第37-38页 |
| 2.5 基因家族进化分析 | 第38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-49页 |
| 3.1 农药抗性相关基因 | 第38-45页 |
| 3.2 Bt毒素抗性相关基因 | 第45-49页 |
| 4 讨论 | 第49-51页 |
| 第三章 中肠转录组抗性相关基因表达量分析 | 第51-65页 |
| 1 引言 | 第51-52页 |
| 2 材料方法 | 第52-58页 |
| 2.1 试虫 | 第52页 |
| 2.2 数据 | 第52页 |
| 2.3 主要试剂和分子生物学仪器设备 | 第52-53页 |
| 2.4 生物信息学硬件和软件 | 第53页 |
| 2.5 二化螟混样转录组测序 | 第53-55页 |
| 2.6 二化螟转录组拼接和注释 | 第55-57页 |
| 2.7 二化螟转录组KEGG分析 | 第57页 |
| 2.8 二化螟转录组差异表达分析 | 第57-58页 |
| 3 结果与分析 | 第58-64页 |
| 3.1 二化螟转录组数据的拼接和注释结果 | 第58-59页 |
| 3.2 二化螟转录组数据COG分析 | 第59-60页 |
| 3.3 二化螟转录组数据KEGG分析 | 第60-61页 |
| 3.4 二化螟转录组数据差异表达基因 | 第61-64页 |
| 4 讨论 | 第64-65页 |
| 第四章 二化螟基因组与转录组数据库构建 | 第65-82页 |
| 1 引言 | 第65页 |
| 2 数据 | 第65-66页 |
| 3 数据库设计 | 第66-68页 |
| 3.1 BLAST序列比对模块 | 第67页 |
| 3.2 SEARCH查询模块 | 第67页 |
| 3.3 GBrowse可视化模块 | 第67-68页 |
| 3.4 DOWNLOAD数据服务模块 | 第68页 |
| 4 数据库构建及关键技术 | 第68-73页 |
| 4.1 数据库结构 | 第68-69页 |
| 4.2 关键技术 | 第69-73页 |
| 5 数据库web实现 | 第73-80页 |
| 5.1 系统开发环境 | 第73页 |
| 5.2 系统实现 | 第73-80页 |
| 6 讨论 | 第80-82页 |
| 全文总结 | 第82-84页 |
| 1 总结 | 第82页 |
| 2 创新点 | 第82页 |
| 3 展望 | 第82-84页 |
| 参考文献 | 第84-90页 |
| 附录 中肠转录组下调基因 | 第90-98页 |
| 致谢 | 第98-100页 |
| 攻读硕士学位期间学术论文发表情况 | 第100页 |
