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DEK基因在肝癌细胞中调节肿瘤发生和转移的作用

中文摘要第3-6页
英文摘要第6-8页
英文缩略词表第13-16页
1 引言第16-22页
    1.1 肝细胞癌第16页
    1.2 DEK基因的发现、组成及结构特征第16-17页
    1.3 DEK基因分布及主要功能研究第17页
    1.4 DEK蛋白与肿瘤研究第17-18页
    1.5 研究意义、目的和内容第18-20页
        1.5.1 研究意义第18-19页
        1.5.2 研究目的第19页
        1.5.3 研究内容第19-20页
    1.6 技术路线第20-22页
2 实验材料第22-28页
    2.1 细胞培养试剂及材料第22页
        2.1.1 组织及细胞系第22页
        2.1.2 细胞培养试剂第22页
    2.2 动物培养第22页
    2.3 细菌培养试剂及材料第22页
        2.3.1 细菌菌株第22页
        2.3.2 细菌培养主要试剂第22页
    2.4 载体第22-24页
        2.4.1 重组基因穿梭表达载体第22-23页
        2.4.2 慢病毒表达载体第23-24页
    2.5 试剂及试剂盒第24-27页
        2.5.1 试剂盒第24-25页
        2.5.2 工具酶第25页
        2.5.3 主要溶液的配制第25-27页
    2.6 仪器设备第27-28页
3 实验方法第28-46页
    3.1 肝癌细胞系的复苏、培养和冻存第28-29页
        3.1.1 肝癌细胞的复苏第28页
        3.1.2 肝癌细胞的培养第28页
        3.1.3 肝癌细胞的冻存第28-29页
    3.2 GEO和TCGA数据库分析第29页
        3.2.1 GEO数据分析组织中DEK基因mRNA表达水平第29页
        3.2.2 TCGA数据分析DEK与细胞周期、细胞迁移相关基因的皮尔逊相关系数第29页
    3.3 DEK基因稳定敲减细胞系的构建第29-32页
        3.3.1 构建shDEK慢病毒第29-31页
        3.3.2 构建DEK基因稳定敲减细胞系第31-32页
    3.4 DEK基因稳定过表达细胞系的构建第32-36页
        3.4.1 过表达DEK质粒的构建第32-35页
        3.4.2 构建DEK基因稳定过表达细胞系第35-36页
    3.5 半定量/荧光定量PCR检测肝癌细胞系与正常肝细胞/组织、新建细胞系中mRNA表达水平第36-39页
        3.5.1 总RNA的提取第36-37页
        3.5.2 RT-PCR合成cDNA第一条链第37页
        3.5.3 半定量PCR检测肝癌细胞系与正常肝细胞/组织中DEK isoform表达情况第37-38页
        3.5.4 RT-qPCR检测HCC细胞系与正常肝细胞/组织中相关基mRNA表达水平第38-39页
    3.6 Western blotting检测肝癌细胞系与正常肝细胞/组织、新建细胞系中蛋白表达水平第39-40页
        3.6.1 蛋白样品制备第39页
        3.6.2 BCA蛋白质浓度测定试剂盒测定总蛋白浓度第39页
        3.6.3 蛋白变性第39页
        3.6.4 SDS-PAGE凝胶电泳第39-40页
        3.6.5 转膜第40页
        3.6.6 抗原-抗体反应第40页
        3.6.7 化学发光显色第40页
    3.7 免疫组织化学分析沉默DEK表达对脾静脉转移肝脏结节的影响第40-42页
        3.7.1 石蜡切片的制备第40-41页
        3.7.2 石蜡切片的免疫组化染色第41-42页
    3.8 MTS分析DEK基因敲减/过表达对细胞生长曲线的影响第42页
    3.9 克隆形成分析DEK基因敲减/过表达细胞系与各自对照组的参异第42-43页
    3.10 流式细胞检测DEK基因敲减/过表达对细胞周期的影响第43页
    3.11 镜检观察DEK基因敲减/过表达对细胞形态的影响第43页
    3.12 划痕实验分析DEK基因敲减/过表达对细胞迁移能力的影响第43-44页
    3.13 小鼠体内体内实验观察敲减DEK基因后对肝癌细胞生物学特性的影响第44-46页
        3.13.1 皮下成瘤实验第44页
        3.13.2 脾静脉转移实验第44-46页
4 实验结果第46-68页
    4.1 DEK在肝癌细胞系/组织中出现过表达第46-49页
        4.1.1 DEK在肝癌细胞系中表达情况第46页
        4.1.2 DEK在肝癌组织中表达情况第46-48页
        4.1.3 DEK表达与肝癌病人生存率分析第48-49页
    4.2 DEK剪切体在肝癌细胞系/组织中表达情况第49-50页
        4.2.1 DEK剪切体的比较第49页
        4.2.2 DEK剪切体在肝癌细胞系中的表达情况第49-50页
        4.2.3 DEK剪切体在肝癌组织中的表达情况第50页
    4.3 DEK基因稳定敲减细胞系的构建第50-54页
        4.3.1 实时定量PCR分析慢病毒质粒敲减DEK效率第50-51页
        4.3.2 荧光分析慢病毒感染细胞效率第51-52页
        4.3.3 mRNA水平检测DEK基因敲减效率第52-53页
        4.3.4 蛋白水平检测DEK基因敲减效率第53-54页
    4.4 DEK基因稳定过表达细胞系的构建第54-56页
        4.4.1 重组表达质粒pcDNA3.1(+)-DEK Iso 1 和pcDNA3.1(+)-DEK Iso 2 的测序第54-55页
        4.4.2 mRNA水平检测DEK剪切体表达情况第55-56页
        4.4.3 蛋白水平检测DEK剪切体表达情况第56页
    4.5 DEK水平对增殖相关细胞生物学特性的影响第56-62页
        4.5.1 DEK水平对细胞生长曲线的影响第56-57页
        4.5.2 DEK水平对细胞克隆形成的影响第57-58页
        4.5.3 DEK水平对细胞周期的影响第58-59页
        4.5.4 DEK表达与其细胞周期相关基因相关性分析第59-60页
        4.5.5 DEK水平对细胞周期相关基因mRNA表达的影响第60-62页
    4.6 DEK水平对EMT相关细胞生物学特性的影响第62-66页
        4.6.1 DEK水平对细胞形态的影响第62页
        4.6.2 DEK水平对细胞迁移能力的影响第62-64页
        4.6.3 DEK表达与其细胞迁移相关基因相关性分析第64页
        4.6.4 DEK水平对EMT关键基因表达的影响第64-66页
    4.7 活体小鼠体内DEK水平敲减后抑制肿瘤发生和转移第66-68页
        4.7.1 裸鼠皮下成瘤第66页
        4.7.2 脾静脉转移情况第66-68页
5 结论与展望第68-70页
    5.1 讨论第68-69页
    5.2 主要结论第69页
    5.3 后续研究工作的展望第69-70页
致谢第70-72页
参考文献第72-80页
附录第80页
    A. 作者在攻读硕士学位期间发表的论文目录第80页
    B. 作者在攻读硕士学位期间参加的科研项目及申请专利情况第80页
    C. 作者在攻读硕士学位期间获得奖励情况第80页

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