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我国羊巴贝斯虫TRAP蛋白的分析及多重PCR方法的建立

硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表第4-5页
摘要第5-7页
abstract第7-8页
英文缩略词表第14-15页
第一章 引言第15-26页
    1.1 巴贝斯虫概述第15-18页
        1.1.1 病原第15页
        1.1.2 生活史第15-16页
        1.1.3 流行病学第16-18页
        1.1.4 临床与病理学特征第18页
    1.2 巴贝斯虫病诊断方法研究进展第18-23页
        1.2.1 病原学诊断方法第19页
        1.2.2 分子生物学诊断方法第19-21页
            1.2.2.1 聚合酶链式反应 (PCR)第19-20页
            1.2.2.2 实时荧光定量PCR(Real-time PCR)第20页
            1.2.2.3 反向线状印迹(RLB)第20页
            1.2.2.4 环介导等温扩增(LAMP)第20-21页
            1.2.2.5 限制性内切酶片段多态性( RFLP)第21页
            1.2.2.6 DNA探针技术第21页
        1.2.3 血清学诊断方法第21-23页
            1.2.3.1 补体结合试验(CFT)第21-22页
            1.2.3.2 间接荧光抗体试验(IFAT)第22页
            1.2.3.3 免疫层析技术(IC)第22页
            1.2.3.4 乳胶凝集试验(LAT)第22页
            1.2.3.5 酶联免疫吸附试验(ELISA)第22-23页
    1.3 trap基因研究进展第23-24页
        1.3.1 trap基因的结构特征第23-24页
        1.3.2 TRAP家族蛋白第24页
    1.4 我国羊巴贝斯虫的分类研究第24-25页
    1.5 本研究的目的和意义第25-26页
第二章 羊巴贝斯虫阳性样品的制备第26-32页
    2.1 材料第26-27页
        2.1.1 主要仪器第26页
        2.1.2 主要试剂第26页
        2.1.3 羊巴贝斯虫虫株第26页
        2.1.4 实验动物第26-27页
    2.2 方法第27-28页
        2.2.1 虫体繁殖第27页
        2.2.2 阳性血清以及基因组DNA的制备第27页
        2.2.3 虫种保藏和裂殖子的纯化第27-28页
    2.3 结果第28-30页
        2.3.1 阳性血清及基因组DNA的制备第28页
        2.3.2 裂殖子的纯化第28-30页
    2.4 讨论第30-32页
第三章 我国羊巴贝斯虫trap基因结构及遗传进化分析第32-43页
    3.1 材料第32-33页
        3.1.1 主要仪器第32页
        3.1.2 主要试剂第32-33页
    3.2 方法第33-35页
        3.2.1 DNA的提取第33页
        3.2.2 引物的设计与合成第33页
        3.2.3 trap基因的PCR扩增第33-34页
        3.2.4 trap基因与pGEM-T Easy载体的连接与转化第34页
        3.2.5 羊巴贝斯虫trap基因的结构分析第34页
        3.2.6 trap基因序列比对第34-35页
        3.2.7 基于trap基因的系统发生树构建第35页
    3.3 结果第35-40页
        3.3.1 trap基因的PCR扩增第35页
        3.3.2 羊巴贝斯虫trap基因的结构分析第35-38页
        3.3.3 trap基因序列比对第38-39页
        3.3.4 基于trap基因的系统发生树构建第39-40页
    3.4 讨论第40-43页
第四章 TRAP蛋白的表达及反应原性分析第43-62页
    4.1 材料第43-44页
        4.1.1 主要仪器第43页
        4.1.2 主要试剂第43页
        4.1.3 血清第43-44页
    4.2 方法第44-49页
        4.2.1 总RNA的提取与单链cDNA的合成第44页
        4.2.2 引物的设计与合成第44-45页
        4.2.3 trap基因cDNA序列的PCR扩增第45页
        4.2.4 trap基因与pGEM-T Easy载体的连接与转化第45-46页
        4.2.5 生物信息学分析第46页
        4.2.6 trap基因表达片段的PCR扩增第46-47页
        4.2.7 trap基因表达片段与pGEM-T Easy载体的连接与转化第47页
        4.2.8 表达质粒pET-30a-LTtrap和pET-30a-XJtrap的构建第47页
        4.2.9 重组蛋白的诱导表达第47-48页
        4.2.10 重组蛋白的可溶性分析第48页
        4.2.11 重组蛋白的纯化第48页
        4.2.12 重组蛋白的质谱分析第48页
        4.2.13 重组蛋白的无结构区预测第48页
        4.2.14 用Western-blot分析重组蛋白的反应性第48-49页
        4.2.15 用间接ELISA方法分析重组蛋白的反应性第49页
            4.2.15.1 间接ELISA方法的试验程序第49页
            4.2.15.2 ELISA反应条件的筛选第49页
            4.2.15.3 重组抗原的反应性和特异性评价第49页
    4.3 结果第49-59页
        4.3.1 总RNA的提取第49-50页
        4.3.2 trap基因cDNA序列的PCR扩增第50页
        4.3.3 生物信息学分析第50-51页
        4.3.4 表达质粒pET-30a-LTtrap和pET-30a-XJtrap的构建第51-52页
        4.3.5 重组蛋白的诱导表达与纯化第52-53页
        4.3.6 重组蛋白的质谱分析第53页
        4.3.7 重组蛋白的无结构区预测第53-54页
        4.3.8 Western-blot对重组蛋白的反应原性分析结果第54-55页
        4.3.9 重组蛋白在ELISA中的反应性分析第55-59页
            4.3.9.1 抗原浓度的筛选结果第55-56页
            4.3.9.2 酶结合物工作浓度的测定第56-57页
            4.3.9.3 封闭液的筛选第57-58页
            4.3.9.4 用ELISA评价重组抗原的反应性和特异性第58-59页
    4.4 讨论第59-62页
第五章 基于trap基因的多重PCR方法的建立第62-77页
    5.1 材料第62-63页
        5.1.1 主要仪器第62页
        5.1.2 主要试剂第62-63页
        5.1.3 基因组DNA第63页
    5.2 方法第63-67页
        5.2.1 引物的设计第63页
        5.2.2 单对引物的PCR扩增第63-64页
        5.2.3 单对引物PCR扩增产物的序列验证第64页
        5.2.4 单对引物PCR的特异性第64页
        5.2.5 单对引物PCR的敏感性第64-65页
        5.2.6 多重PCR反应的建立第65页
        5.2.7 多重PCR扩增产物的序列验证第65页
        5.2.8 多重PCR反应的优化第65-66页
        5.2.9 多重PCR反应的特异性第66页
        5.2.10 多重PCR反应的敏感性第66页
        5.2.11 多重PCR反应的重复性第66页
        5.2.12 实验室样品及田间样品检测第66-67页
    5.3 结果第67-74页
        5.3.1 单对引物的PCR扩增第67页
        5.3.2 单对引物PCR扩增产物的序列验证第67页
        5.3.3 单对引物PCR的特异性第67-69页
        5.3.4 单对引物PCR的敏感性及引物浓度的筛选第69-71页
        5.3.5 多重PCR反应的建立第71页
        5.3.6 多重PCR扩增产物的序列验证第71-72页
        5.3.7 多重PCR反应的优化第72页
        5.3.8 多重PCR反应的特异性第72-73页
        5.3.9 多重PCR反应的敏感性第73页
        5.3.10 多重PCR反应的重复性第73-74页
        5.3.11 实验室样品及田间样品检测第74页
    5.4 讨论第74-77页
第六章 全文结论第77-78页
参考文献第78-85页
附件1 获得的基因序列第85-92页
致谢第92-93页
作者简介第93页

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