| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 引言 | 第9-10页 |
| 第一章 综述 | 第10-24页 |
| 1.1 鸻形目鸟类研究进展 | 第10-14页 |
| 1.2 DNA 序列分析在鸟类分子生态学上的应用及研究概况 | 第14-24页 |
| 1.2.1 前言 | 第14-15页 |
| 1.2.2 重建系统进化树，研究种内或种间的系统发生与进化 | 第15-19页 |
| 1.2.3 估计进化分歧时间 | 第19-21页 |
| 1.2.4 分析种群的地理分布模式 | 第21-22页 |
| 1.2.5 存在的问题与展望 | 第22-23页 |
| 1.2.6 小结 | 第23-24页 |
| 第二章 鸻形目鸟类12S rRNA 基因序列变异及其分子系统学研究 | 第24-55页 |
| 2.1 引言 | 第24-25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-30页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第25页 |
| 2.2.2 仪器和主要设备 | 第25-27页 |
| 2.2.3 方法 | 第27-30页 |
| 2.2.3.1 基因组DNA 的提取 | 第27-28页 |
| 2.2.3.2 纯度检验及浓度计算 | 第28页 |
| 2.2.3.3 12S rRNA 基因的PCR 扩增 | 第28-29页 |
| 2.2.3.4 PCR 产物的回收与纯化 | 第29页 |
| 2.2.3.5 序列测定 | 第29-30页 |
| 2.2.3.6 序列检验与分析 | 第30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-47页 |
| 2.3.1 DNA 提取结果 | 第30页 |
| 2.3.2 PCR 扩增结果 | 第30页 |
| 2.3.3 测序结果 | 第30-32页 |
| 2.3.4 鸻形目鸟类12S rRNA 基因的序列分析 | 第32-36页 |
| 2.3.4.1 碱基组成 | 第33页 |
| 2.3.4.2 序列变异分析 | 第33-34页 |
| 2.3.4.3 遗传距离 | 第34-36页 |
| 2.3.5 系统树的构建与检验 | 第36-47页 |
| 2.3.5.1 距离法构建系统树 | 第36-38页 |
| 2.3.5.2 简约法构建系统树 | 第38-39页 |
| 2.3.5.3 似然法构建系统树 | 第39-46页 |
| 2.3.5.4 系统发育树的检验 | 第46-47页 |
| 2.4 讨论 | 第47-55页 |
| 2.4.1 几种DNA 未扩增出目的片段的原因 | 第47页 |
| 2.4.2 12S rRNA 基因在系统发育中的适用性 | 第47-48页 |
| 2.4.3 本文中所涉及到的鸻形目鸟类的系统发育关系 | 第48-50页 |
| 2.4.3.1 科及科以上阶元的系统关系 | 第48-50页 |
| 2.4.3.2 科以下阶元的系统关系 | 第50页 |
| 2.4.4 关于分子系统学与传统系统学的歧异问题 | 第50-55页 |
| 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-64页 |
| 后记（含致谢） | 第64-65页 |
| 攻读学位期间取得的科研成果清单 | 第65页 |
