| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 常用词语英文缩写 | 第10-13页 |
| 1 前言 | 第13-22页 |
| 1.1 微生物气溶胶 | 第13页 |
| 1.1.1 微生物气溶胶的概念 | 第13页 |
| 1.1.2 微生物气溶胶的性质 | 第13页 |
| 1.1.3 畜禽舍微生物气溶胶 | 第13页 |
| 1.2 畜禽舍微生物气溶胶的危害 | 第13-15页 |
| 1.2.1 畜禽舍空气微生物对人类的危害 | 第14页 |
| 1.2.2 畜禽舍空气微生物对畜禽的危害 | 第14页 |
| 1.2.3 畜禽舍空气微生物带来的经济损失 | 第14-15页 |
| 1.2.4 猪舍空气微生物的危害 | 第15页 |
| 1.3 畜禽舍空气微生物气溶胶的形成 | 第15-16页 |
| 1.4 空气微生物的研究进展 | 第16-19页 |
| 1.4.1 空气微生物研究方法进展 | 第16页 |
| 1.4.2 猪舍空气微生物的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.4.3 空气微生物传播的研究 | 第17-18页 |
| 1.4.4 空气微生物国内外研究现状 | 第18-19页 |
| 1.5 16SRDNA高通量测序 | 第19页 |
| 1.5.1 16SrDNA高通量测序的原理 | 第19页 |
| 1.5.2 16SrDNA高通量测序在科研上的应用 | 第19页 |
| 1.6 空气样品采集方法 | 第19-21页 |
| 1.6.1 液体撞击式空气采样器概述 | 第20页 |
| 1.6.2 液体撞击式空气采样器特点 | 第20-21页 |
| 1.6.3 液体撞击式采样器的应用 | 第21页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-32页 |
| 2.1 材料及取样地点 | 第22-24页 |
| 2.1.1 猪场情况 | 第22-23页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第24页 |
| 2.2 方法 | 第24-32页 |
| 2.2.1 样本的采集与处理 | 第24-29页 |
| 2.2.2 测序结果初步分析 | 第29-30页 |
| 2.2.3 数据分析 | 第30-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-46页 |
| 3.1 样品采集和测序结果的前处理 | 第32页 |
| 3.2 OTU热图 | 第32页 |
| 3.3 物种注释与菌群结构分析 | 第32-35页 |
| 3.4 A多样性分析 | 第35-37页 |
| 3.5 B多样性分析 | 第37-38页 |
| 3.6 样本与因素的差异显著性分析 | 第38-40页 |
| 3.6.1 分析所有样品 | 第38页 |
| 3.6.2 分析空气样品 | 第38-39页 |
| 3.6.3 空气样品中差异显著的OTUs | 第39-40页 |
| 3.7 共享(SHARED)分析 | 第40-45页 |
| 3.7.1 OTUs类型分析 | 第41-45页 |
| 3.8 LDA EFFECT SIZE(LEFSE)分析 | 第45-46页 |
| 4 讨论 | 第46-50页 |
| 4.1 实验方法讨论 | 第46-47页 |
| 4.2 采样方法讨论 | 第47页 |
| 4.3 数据处理方法讨论 | 第47-48页 |
| 4.4 不同距离处的空气微生物差异不显著 | 第48页 |
| 4.5 来源问题的讨论 | 第48-49页 |
| 4.6 D类和E类微生物的病原性 | 第49页 |
| 4.7 污染源传播距离与猪场设计的关系 | 第49-50页 |
| 4.8 气象因素讨论 | 第50页 |
| 5 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-61页 |
| 致谢 | 第61页 |