| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 序言 | 第12-18页 |
| 第二章 LPS诱导何首乌的动物肝损伤评价模型的建立 | 第18-29页 |
| 1 实验材料 | 第18-20页 |
| 1.1 药品和主要试剂 | 第18-19页 |
| 1.2 动物 | 第19页 |
| 1.3 仪器 | 第19-20页 |
| 2 实验方法 | 第20-22页 |
| 2.1 LPS诱导何首乌的大鼠肝损伤模型的建立 | 第20页 |
| 2.2 肝功能生化指标的检测 | 第20页 |
| 2.3 血清中LPS含量的检测 | 第20-21页 |
| 2.4 肝脏指数及病理学检查 | 第21页 |
| 2.5 粪便样本的采集 | 第21-22页 |
| 2.6 统计学分析 | 第22页 |
| 3 实验结果 | 第22-27页 |
| 3.1 不同时间点不同组别动物常规笼旁观察 | 第22页 |
| 3.2 不同时间点不同组别动物体重变化 | 第22页 |
| 3.3 不同时间点不同组别动物血清ALT、AST和LPS值变化 | 第22-23页 |
| 3.4 不同时间点不同组别动物肝脏指数的变化 | 第23页 |
| 3.5 大鼠肝组织病理学的变化 | 第23-27页 |
| 4 讨论 | 第27-29页 |
| 第三章 高通量测序技术和qRT-PCR法研究何首乌肝损伤大鼠肠道菌群的变化 | 第29-56页 |
| 1 实验材料 | 第30-31页 |
| 1.1 主要试剂/ 试剂盒 | 第30页 |
| 1.2 主要仪器与耗材 | 第30-31页 |
| 2 实验方法 | 第31-38页 |
| 2.1 实验粪便样本的收集与保存 | 第31页 |
| 2.2 菌群总DNA的提取及质量检测 | 第31-33页 |
| 2.2.1 菌群总DNA的提取 | 第31-32页 |
| 2.2.2 菌群总DNA质量检测 | 第32-33页 |
| 2.3 Illumina测序技术 | 第33-35页 |
| 2.3.1 菌群总DNA的提取和PCR扩增 | 第33页 |
| 2.3.2 文库构建和上机测序 | 第33-34页 |
| 2.3.3 测序数据的处理 | 第34页 |
| 2.3.4 OTU聚类和物种注释 | 第34页 |
| 2.3.5 α 多样性分析 | 第34页 |
| 2.3.6 β 多样性分析 | 第34-35页 |
| 2.3.7 群落结构差异分析 | 第35页 |
| 2.4 差异菌种引物的Real- Time PCR | 第35-38页 |
| 2.4.1 目的基因质粒标准样品的制备 | 第35-37页 |
| 2.4.2 Real-time quantitative PCR反应 | 第37-38页 |
| 2.5 统计学分析 | 第38页 |
| 3 实验结果 | 第38-53页 |
| 3.1 粪便样本的采集及测序信息 | 第38页 |
| 3.2 微生态构成及分布丰度分析结果 | 第38-40页 |
| 3.2.1 门水平微生态构成及分布丰度分析结果 | 第38-39页 |
| 3.2.2 科水平微生态构成及分布丰度分析结果 | 第39-40页 |
| 3.3 α 多样性分析结果 | 第40-45页 |
| 3.3.1 稀释曲线结果 | 第40-41页 |
| 3.3.2 物种累积曲线结果 | 第41页 |
| 3.3.3 α 多样性指数结果 | 第41-45页 |
| 3.4 β 多样性分析结果 | 第45页 |
| 3.4.1 主成分分析结果 | 第45页 |
| 3.4.2 主坐标分析结果 | 第45页 |
| 3.4.3 样品聚类分析结果 | 第45页 |
| 3.5 群落结构差异统计分析结果 | 第45-49页 |
| 3.6 实时荧光定量PCR分析结果 | 第49-53页 |
| 4 讨论 | 第53-56页 |
| 总结与展望 | 第56-57页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第57-58页 |
| 附件 | 第58-74页 |
| 英文缩略语名词对照表 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
