| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 英文缩略表 | 第9-15页 |
| 1 前言 | 第15-25页 |
| 1.1 甘蔗宿根矮化病的研究进展 | 第15-20页 |
| 1.1.1 甘蔗宿根矮化病的发病区域及发病率 | 第15-16页 |
| 1.1.2 甘蔗宿根矮化病的症状与传播 | 第16页 |
| 1.1.3 甘蔗宿根矮化病引起的危害 | 第16-17页 |
| 1.1.4 甘蔗宿根矮化病的检测技术研究 | 第17-18页 |
| 1.1.5 甘蔗宿根矮化病的防治技术 | 第18-19页 |
| 1.1.6 甘蔗宿根矮化病的病原菌及其分离培养 | 第19-20页 |
| 1.1.7 甘蔗宿根矮化病病原菌的基因组学研究 | 第20页 |
| 1.2 植物与病原菌互作 | 第20-23页 |
| 1.2.1 抗氧化物酶在植物与病原菌互作中的响应 | 第20-21页 |
| 1.2.2 内源激素在植物与病原菌互作中的响应 | 第21-22页 |
| 1.2.3 植物与病原菌互作基因 | 第22-23页 |
| 1.3 高通量测序技术在植物病原菌研究中的应用 | 第23-24页 |
| 1.4 研究的目的意义 | 第24页 |
| 1.5 研究的技术路线 | 第24-25页 |
| 2 宿根矮化病病原菌的培养鉴定及对甘蔗叶片解剖结构的影响 | 第25-38页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-27页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第25页 |
| 2.1.2 样品收集与处理 | 第25页 |
| 2.1.3 Lxx的分离与培养 | 第25页 |
| 2.1.4 Lxx的PCR鉴定 | 第25-26页 |
| 2.1.5 Lxx系统发育分析 | 第26页 |
| 2.1.6 扫描电镜样品的制备 | 第26页 |
| 2.1.7 透射电镜样品的制备 | 第26-27页 |
| 2.1.8 石蜡切片样品的制备 | 第27页 |
| 2.2 结果与分析 | 第27-36页 |
| 2.2.1 宿根矮化病病症 | 第27-28页 |
| 2.2.2 DNA提取结果 | 第28页 |
| 2.2.3 PCR检测结果 | 第28页 |
| 2.2.4 Lxx分离培养结果 | 第28-29页 |
| 2.2.5 Lxx的rDNA-ITS序列亲缘关系分析 | 第29-31页 |
| 2.2.6 Lxx形态特征与定殖 | 第31-33页 |
| 2.2.7 Lxx对蔗株叶片的影响 | 第33-36页 |
| 2.3 讨论 | 第36-37页 |
| 2.4 小结 | 第37-38页 |
| 3 LxxGXBZ01全基因组重测序 | 第38-55页 |
| 3.1 材料与方法 | 第38-43页 |
| 3.1.1 菌株来源 | 第38页 |
| 3.1.2 基因组DNA的提取 | 第38页 |
| 3.1.3 基因组测序及组装 | 第38-39页 |
| 3.1.4 比较基因组分析 | 第39-41页 |
| 3.1.5 基因突变的验证 | 第41页 |
| 3.1.6 基因生物信息学分析软件 | 第41-43页 |
| 3.2 结果与分析 | 第43-51页 |
| 3.2.1 基因组DNA提取质量分析 | 第43页 |
| 3.2.2 测序的数据概况 | 第43页 |
| 3.2.3 样品组装分析结果 | 第43-45页 |
| 3.2.4 比较基因组分析结果 | 第45-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-54页 |
| 3.4 小结 | 第54-55页 |
| 4 Lxx对甘蔗光合参数及防御酶活性的影响 | 第55-67页 |
| 4.1 材料与方法 | 第55-57页 |
| 4.1.1 Lxx接种菌液 | 第55页 |
| 4.1.2 材料准备及Lxx接种 | 第55页 |
| 4.1.3 光合参数的测定 | 第55-56页 |
| 4.1.4 农艺性状的调查 | 第56页 |
| 4.1.5 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC,E.C.4.1.1.31)的测定 | 第56页 |
| 4.1.6 抗氧化物酶活性的测定 | 第56页 |
| 4.1.7 数据分析 | 第56-57页 |
| 4.2 结果与分析 | 第57-64页 |
| 4.2.1 PCR检测甘蔗染病情况 | 第57页 |
| 4.2.2 Lxx侵染对甘蔗叶片气体交换参数的影响 | 第57-60页 |
| 4.2.3 Lxx侵染对甘蔗叶片PEPC活性的影响 | 第60页 |
| 4.2.4 Lxx侵染对甘蔗农艺性状的影响 | 第60-61页 |
| 4.2.5 Lxx侵染对甘蔗叶片中O_2·-含量及抗氧化酶活性的影响 | 第61-64页 |
| 4.3 讨论 | 第64-66页 |
| 4.4 小结 | 第66-67页 |
| 5 Lxx侵染对甘蔗内源激素的影响 | 第67-77页 |
| 5.1 材料与方法 | 第67-68页 |
| 5.1.1 材料处理 | 第67页 |
| 5.1.2 样品处理 | 第67页 |
| 5.1.3 赤霉素(GA_3)的测定 | 第67-68页 |
| 5.1.4 脱落酸(ABA)含量的测定 | 第68页 |
| 5.2 结果与分析 | 第68-74页 |
| 5.2.1 赤霉素含量的测定 | 第68-70页 |
| 5.2.2 脱落酸含量的测定 | 第70-72页 |
| 5.2.3 吲哚乙酸含量的测定 | 第72-74页 |
| 5.3 讨论 | 第74-76页 |
| 5.4 小结 | 第76-77页 |
| 6 Lxx侵染下甘蔗基因差异表达分析 | 第77-103页 |
| 6.1 材料与方法 | 第77-80页 |
| 6.1.1 试验品种 | 第77页 |
| 6.1.2 材料准备与处理 | 第77页 |
| 6.1.3 测定参数与方法 | 第77-79页 |
| 6.1.4 qRT-PCR的验证 | 第79-80页 |
| 6.2 结果与分析 | 第80-96页 |
| 6.2.1 出苗率 | 第80页 |
| 6.2.2 采样前蔗株农艺性状 | 第80-81页 |
| 6.2.3 RNA提取质量 | 第81页 |
| 6.2.4 测序数据质量评估 | 第81-82页 |
| 6.2.5 转录本拼接 | 第82-83页 |
| 6.2.6 差异表达基因分析 | 第83-96页 |
| 6.3 讨论 | 第96-102页 |
| 6.3.1 光合作用相光基因 | 第97页 |
| 6.3.2 半胱氨酸和甲硫氨酸代谢相关基因 | 第97-99页 |
| 6.3.3 谷胱甘肽代谢相关基因 | 第99-100页 |
| 6.3.4 植物-病原互作代谢相关基因 | 第100-101页 |
| 6.3.5 过氧物酶体代谢相关基因 | 第101页 |
| 6.3.6 植物激素信号转导途径相关基因 | 第101-102页 |
| 6.4 小结 | 第102-103页 |
| 7 结论 | 第103-106页 |
| 7.1 全文总结 | 第103-104页 |
| 7.2 论文创新点 | 第104-105页 |
| 7.3 问题与展望 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-121页 |
| 附录A | 第121-123页 |
| 附录B | 第123-127页 |
| 附录C | 第127-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第132-133页 |
