| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 前言 | 第12-22页 |
| 1.1 一氧化二氮还原酶 | 第12-18页 |
| 1.1.1 反硝化研究简介 | 第12-14页 |
| 1.1.2 一氧化二氮还原酶基因簇(nos基因簇) | 第14-15页 |
| 1.1.3 一氧化二氮还原酶(N_2OR)铜离子活性中心 | 第15-18页 |
| 1.2 微生物基因组学 | 第18-21页 |
| 1.2.1 微生物基因组学发展历史 | 第18页 |
| 1.2.2 微生物基因组学研究现状 | 第18-19页 |
| 1.2.3 微生物基因组学应用 | 第19-21页 |
| 1.3 本研究目的及意义 | 第21-22页 |
| 第二章 反硝化蜡状芽孢杆菌HS-N10 nos基因簇研究 | 第22-41页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第22-28页 |
| 2.2.1 菌株 | 第22页 |
| 2.2.2 主要试剂和酶 | 第22页 |
| 2.2.3 缓冲液配制 | 第22-23页 |
| 2.2.4 基因组的提取 | 第23-24页 |
| 2.2.5 菌株分子鉴定 | 第24页 |
| 2.2.6 nos基因簇相关基因保守区克隆 | 第24-25页 |
| 2.2.7 nosR保守区5’端染色体步移 | 第25-28页 |
| 2.2.8 nosZ完整序列克隆 | 第28页 |
| 2.2.9 nos基因簇相关基因生物信息学分析 | 第28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-39页 |
| 2.3.1 菌株HS-N10分子鉴定 | 第28-30页 |
| 2.3.2 HS-N10 nos基因簇相关基因扩增 | 第30-32页 |
| 2.3.3 HS-N10 nos基因簇相关基因生物信息学分析 | 第32-39页 |
| 2.4 小结 | 第39-41页 |
| 第三章 反硝化菌HS-N03、HS-Nlll基因组扫描分析 | 第41-54页 |
| 3.1 引言 | 第41页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第41-44页 |
| 3.2.1 菌株 | 第41页 |
| 3.2.2 主要试剂和酶 | 第41页 |
| 3.2.3 培养基的配制 | 第41页 |
| 3.2.4 基因组的提取与检测 | 第41页 |
| 3.2.5 测序与拼接 | 第41-42页 |
| 3.2.6 RNA预测 | 第42页 |
| 3.2.7 基因预测与功能注释 | 第42-43页 |
| 3.2.8 KEGG代谢通路分析 | 第43-44页 |
| 3.3 结果与分析 | 第44-52页 |
| 3.3.1 HS-N03和HS-N111基因组的提取与检测 | 第44-45页 |
| 3.3.2 HS-N03和HS-N111测序结果概况 | 第45-46页 |
| 3.3.3 HS-N03和HS-N111基因预测与分析 | 第46-49页 |
| 3.3.4 HS-N03和HS-N111反硝化相关基因分析 | 第49-52页 |
| 3.4 小结 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 硕士期间发表论文 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
