| 中文摘要 | 第3-4页 |
| 英文摘要 | 第4-5页 |
| 引言 | 第8-16页 |
| 1.胁迫对植物的影响 | 第8-14页 |
| 1.1 胁迫可引起遗传学变异 | 第9-11页 |
| 1.2 胁迫可引起表观遗传学变异 | 第11-12页 |
| 1.3 遗传和表观遗传调控胁迫应答机制 | 第12-13页 |
| 1.4 分子生物学检测方法 | 第13-14页 |
| 2.全基因组重测序技术 | 第14页 |
| 3.全基因组表达芯片技术 | 第14-15页 |
| 4.研究目的及意义 | 第15-16页 |
| 材料方法 | 第16-25页 |
| 1 实验材料 | 第16页 |
| 2 实验方法 | 第16-25页 |
| 2.1 基因组DNA的提取和纯化 | 第16-17页 |
| 2.2 mPing转座子PCR特异位点分析 | 第17页 |
| 2.3 AFLP分子标记体系的建立 | 第17-19页 |
| 2.4 MSAP分析标记体系的建立 | 第19-21页 |
| 2.5 转座子展示 | 第21页 |
| 2.6 重测序建库 | 第21页 |
| 2.7 总RNA提取纯化及反转录 | 第21-22页 |
| 2.8 芯片数据处理和分析 | 第22-23页 |
| 2.9 重亚硫酸盐测序 | 第23-25页 |
| 结果与分析 | 第25-35页 |
| 1.变异株后代sd12-14 产生表型差异 | 第25-26页 |
| 2.变异株后代sd12-14 转座子mPing激活 | 第26-27页 |
| 3.变异株后代sd12-14 发生遗传学变异 | 第27-28页 |
| 4.重测序的生物信息学结果分析 | 第28-29页 |
| 4.1 碱基的转换和颠换 | 第28-29页 |
| 4.2 转座子分析 | 第29页 |
| 5 JL307 和变异株后代sd12-14 基因表达芯片分析 | 第29-32页 |
| 5.1 sd12-14 vs JL307 基因表达变化 | 第30页 |
| 5.2 sd12-14 vs JL307 差异表达基因功能注释 | 第30-31页 |
| 5.3 差异表达基因的通路分析 | 第31-32页 |
| 5.4 实时定量PCR验证结果 | 第32页 |
| 6.变异株后代sd12-14 甲基化水平发生改变 | 第32-34页 |
| 7.sd12-14 表达水平发生改变的基因启动子区域甲基化水平变化 | 第34-35页 |
| 讨论 | 第35-37页 |
| 结论 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-41页 |
| 附录 | 第41-45页 |
| 致谢 | 第45页 |
