| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 海洋环境重金属污染的研究 | 第10-14页 |
| 1.1.1 重金属污染 | 第10页 |
| 1.1.2 海洋重金属污染 | 第10-12页 |
| 1.1.2.1 海洋重金属污染现状和危害 | 第10-11页 |
| 1.1.2.2 海洋汞污染现状和危害 | 第11-12页 |
| 1.1.3 重金属污染的治理 | 第12-14页 |
| 1.1.3.1 重金属污染治理的方法 | 第12-13页 |
| 1.1.3.2 利用海洋生物处理污水重金属 | 第13-14页 |
| 1.2 微生物抗性机制的研究 | 第14-18页 |
| 1.2.1 阻止金属离子流入细胞 | 第14-15页 |
| 1.2.2 促进细胞排出金属离子 | 第15-16页 |
| 1.2.3 细胞内的隔离和解毒作用 | 第16页 |
| 1.2.4 金属的转化作用 | 第16-18页 |
| 1.3 假单胞菌的金属抗性研究进展 | 第18页 |
| 1.4 转录组研究概述 | 第18-19页 |
| 1.5 研究内容、意义与创新点 | 第19-21页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第19页 |
| 1.5.2 研究意义 | 第19-20页 |
| 1.5.3 创新点 | 第20-21页 |
| 第2章 假单胞菌A1重金属抗性基因表达的转录组学分析 | 第21-43页 |
| 2.1 材料、试剂和仪器 | 第21-23页 |
| 2.1.1 菌株 | 第21页 |
| 2.1.2 人工海水的配置方法 | 第21-22页 |
| 2.1.3 培养基 | 第22页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第22页 |
| 2.1.5 主要仪器 | 第22-23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-24页 |
| 2.2.1 菌体培养 | 第23页 |
| 2.2.2 RNA的提取和质量鉴定 | 第23-24页 |
| 2.2.3 转录组测序 | 第24页 |
| 2.3 测序数据处理 | 第24-27页 |
| 2.3.1 原始数据的处理 | 第24-25页 |
| 2.3.2 功能注释、分类及代谢途径的分析 | 第25-26页 |
| 2.3.3 差异表达基因的分析 | 第26-27页 |
| 2.3.4 重金属抗性基因的筛选及其生物信息学分析 | 第27页 |
| 2.4 结果与分析 | 第27-40页 |
| 2.4.1 RNA质量检测 | 第27页 |
| 2.4.2 Unigene组装 | 第27-28页 |
| 2.4.3 功能注释、分类及代谢途径分析 | 第28-30页 |
| 2.4.4 差异表达基因分析 | 第30-31页 |
| 2.4.4.1 基因差异表达统计 | 第30-31页 |
| 2.4.4.2 差异表达基因的GO富集和Pathway分析 | 第31页 |
| 2.4.5 重金属抗性基因的筛选 | 第31-32页 |
| 2.4.6 Unigene97-All和CL78.Contig1-All生物信息学分析 | 第32-40页 |
| 2.4.6.1 Unigene97-All基因生物信息学分析 | 第32-36页 |
| 2.4.6.2 CL78.Contig1-All基因生物信息学分析 | 第36-40页 |
| 2.5 讨论 | 第40-42页 |
| 2.6 小结 | 第42-43页 |
| 第3章 基因工程菌的构建 | 第43-52页 |
| 3.1 材料、试剂和仪器 | 第43-45页 |
| 3.1.1 实验菌株和质粒 | 第43页 |
| 3.1.2 培养基 | 第43-44页 |
| 3.1.3 抗生素、酶和试剂 | 第44页 |
| 3.1.4 引物设计以及合成 | 第44页 |
| 3.1.5 主要仪器 | 第44-45页 |
| 3.2 实验方法 | 第45-47页 |
| 3.2.1 基因模板的提取 | 第45页 |
| 3.2.1.1 A1基因组的提取 | 第45页 |
| 3.2.1.2 p ET-28a质粒的提取 | 第45页 |
| 3.2.2 Unigene97-All和CL78.Contig1-All的PCR扩增 | 第45-46页 |
| 3.2.3 重组质粒的构建 | 第46页 |
| 3.2.4 感受态细胞的制备 | 第46-47页 |
| 3.2.5 连接产物的转化 | 第47页 |
| 3.2.6 重组子的验证 | 第47页 |
| 3.3 结果与分析 | 第47-49页 |
| 3.3.1 基因模板提取 | 第47-48页 |
| 3.3.2 Unigene97-All和CL78.Contig1-All PCR扩增 | 第48-49页 |
| 3.3.3 重组子的验证 | 第49页 |
| 3.4 讨论 | 第49-51页 |
| 3.5 小结 | 第51-52页 |
| 第4章 重组菌汞抗性及对汞离子富集的研究 | 第52-63页 |
| 4.1 材料、试剂与仪器 | 第52-53页 |
| 4.1.1 材料 | 第52页 |
| 4.1.2 培养基 | 第52页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第52页 |
| 4.1.4 主要仪器 | 第52-53页 |
| 4.2 实验方法 | 第53-55页 |
| 4.2.1 菌体制备 | 第53页 |
| 4.2.2 重组菌对Hg~(2+)的生长抗性研究 | 第53页 |
| 4.2.3 海洋细菌A1和U97重组菌汞还原研究 | 第53-54页 |
| 4.2.4 重组菌对Hg~(2+)平衡富集量研究 | 第54-55页 |
| 4.3 结果与分析 | 第55-60页 |
| 4.3.1 重组菌对Hg~(2+)的生长抗性 | 第55-57页 |
| 4.3.2 海洋细菌A1和U97重组菌汞还原研究 | 第57-58页 |
| 4.3.3 重组菌对Hg~(2+)的富集 | 第58-60页 |
| 4.4 讨论 | 第60-62页 |
| 4.4.1 重组菌对Hg~(2+)的抗性 | 第60-61页 |
| 4.4.2 重组菌对Hg~(2+)的富集 | 第61-62页 |
| 4.5 小结 | 第62-63页 |
| 第5章 结论与建议 | 第63-65页 |
| 5.1 主要结论 | 第63-64页 |
| 5.2 建议 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-72页 |
| 附录 | 第72-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第77页 |
