| 摘要 | 第10-12页 |
| 英文摘要 | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第14-20页 |
| 1.1 乳腺组织发育和乳的合成 | 第14-16页 |
| 1.1.1 乳腺组织发育 | 第14-15页 |
| 1.1.2 乳的合成简介 | 第15-16页 |
| 1.2 miRNA的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.1 miRNA的简介 | 第16页 |
| 1.2.2 miRNA在乳腺中的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3 lncRNA的研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3.1 lncRNA的简介 | 第17页 |
| 1.3.2 lncRNA的功能 | 第17-18页 |
| 1.3.3 lncRNA的研究方法 | 第18-19页 |
| 1.3.4 lncRNA在乳腺和泌乳中的研究进展 | 第19页 |
| 1.4 研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-23页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第20页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第20-22页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第22-23页 |
| 2.2 样品处理 | 第23-27页 |
| 2.2.1 乳腺组织收集 | 第23页 |
| 2.2.2 乳腺组织RNA提取和质检 | 第23-24页 |
| 2.2.3 smallRNA-seq cDNA文库构建和质检 | 第24-25页 |
| 2.2.4 lncRNA-seq cDNA文库构建和质检 | 第25-27页 |
| 2.2.5 上机测序 | 第27页 |
| 2.3 测序数据质控和基因组比对 | 第27-29页 |
| 2.3.1 smallRNA-seq | 第27-28页 |
| 2.3.2 lncRNA-seq | 第28-29页 |
| 2.4 差异表达分析 | 第29页 |
| 2.5 整合分析 | 第29-31页 |
| 2.5.1 泌乳组与非泌乳组差异miRNA整合分析 | 第29-30页 |
| 2.5.2 高品质与低乳品质组miRNA、mRNA和lncRNA整合分析 | 第30-31页 |
| 2.6 miRNA靶基因关系预测、基因功能分析和通路分析 | 第31-32页 |
| 2.7 荧光定量PCR验证 | 第32-34页 |
| 2.8 靶基因验证 | 第34-38页 |
| 2.8.1 合成片段载体转化感受态细胞 | 第34-35页 |
| 2.8.2 质粒提取 | 第35页 |
| 2.8.3 目的片段的纯化 | 第35-36页 |
| 2.8.4 将目的片段与荧光素酶报告载体连接与测序 | 第36页 |
| 2.8.5 HEK-293 细胞的培养与传代 | 第36-37页 |
| 2.8.6 双荧光素酶活性检测 | 第37-38页 |
| 2.9 数据统计与分析 | 第38-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-85页 |
| 3.1 RNA提取后质量检测结果 | 第39-45页 |
| 3.2 测序数据质量控制和基因组比对 | 第45-53页 |
| 3.2.1 miRNA-seq测序后分析 | 第45-51页 |
| 3.2.2 lncRNA-seq测序后分析 | 第51-53页 |
| 3.3 差异表达分析 | 第53-64页 |
| 3.3.1 miRNA差异表达分析 | 第53-61页 |
| 3.3.2 mRNA和lncRNA差异表达分析 | 第61-64页 |
| 3.4 高乳品质组、低乳品质组与干乳期miRNA联合分析 | 第64-68页 |
| 3.4.1 交集miRNA | 第64-66页 |
| 3.4.2 25个交集miRNA靶基因预测和功能通路分析 | 第66-68页 |
| 3.5 高乳品质组与低乳品质组差异基因分析 | 第68-72页 |
| 3.5.1 差异基因功能富集分析 | 第68-69页 |
| 3.5.2 差异基因通路富集分析 | 第69-71页 |
| 3.5.3 差异基因蛋白互作分析 | 第71-72页 |
| 3.6 高乳品质组与低乳品质组差异miRNA和mRNA整合分析 | 第72-79页 |
| 3.6.1 miRNA与mRNA负调控关系的建立 | 第72-74页 |
| 3.6.2 负调控基因的功能和通路分析 | 第74-77页 |
| 3.6.3 负调控基因蛋白互作分析和调控通路的构建 | 第77-79页 |
| 3.7 高品质与低品质差异miRNA、mRNA和lncRNA联合分析 | 第79-85页 |
| 3.7.1 lncRNA与miRNA靶向关系的建立 | 第79-80页 |
| 3.7.2 建立ceRNA调控关系 | 第80-83页 |
| 3.7.3 靶基因验证结果 | 第83-84页 |
| 3.7.4 荧光定量PCR验证 | 第84-85页 |
| 4 讨论 | 第85-89页 |
| 4.1 高乳品质组、低乳品质组与干乳期miRNA联合分析 | 第85-86页 |
| 4.2 高乳品质组与低乳品质组差异基因和差异miRNA联合分析 | 第86-87页 |
| 4.3 高品质与低品质差异miRNA、mRNA和lncRNA联合分析 | 第87-89页 |
| 5 结论 | 第89-90页 |
| 致谢 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-99页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第99页 |
