| 中文摘要 | 第10-11页 |
| 英文摘要 | 第11页 |
| 第一章 大豆抗胞囊线虫基因遗传多样性与功能分析的研究 | 第12-25页 |
| 1.1 大豆胞囊线虫病概述 | 第12-13页 |
| 1.1.1 大豆胞囊线虫病危害及分布 | 第12-13页 |
| 1.1.2 大豆胞囊线虫病防治 | 第13页 |
| 1.2 大豆抗性基因的研究进展 | 第13-15页 |
| 1.2.1 rhg1的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.2.2 Rhg4的研究进展 | 第15页 |
| 1.3 不同物种丝氨酸羟甲基转移酶的研究 | 第15-18页 |
| 1.3.1 丝氨酸羟甲基转移酶在动物体内的研究 | 第16页 |
| 1.3.2 丝氨酸羟甲基转移酶在微生物体内的研究 | 第16-17页 |
| 1.3.3 丝氨酸羟甲基转移酶在植物体内的研究 | 第17-18页 |
| 1.4 DNA分子标记的研究进展 | 第18-21页 |
| 1.4.1 基于Southern杂交技术为核心的分子标记 | 第18-19页 |
| 1.4.2 基于PCR的分子标记 | 第19-21页 |
| 1.5 生物信息学分析的研究进展 | 第21-23页 |
| 1.5.1 生物信息学的产生 | 第21-22页 |
| 1.5.2 主要生物数据库 | 第22页 |
| 1.5.3 常用生物信息学分析工具 | 第22页 |
| 1.5.4 生物信息学研究的方面 | 第22-23页 |
| 1.6 本研究的内容、目的和意义 | 第23-25页 |
| 1.6.1 研究内容 | 第23页 |
| 1.6.2 研究目的和意义 | 第23-25页 |
| 第二章 抗性位点的标记与SHMT基因的克隆测序 | 第25-40页 |
| 2.1 材料 | 第25-28页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第25-27页 |
| 2.1.2 供试线虫材料 | 第27页 |
| 2.1.3 试验仪器 | 第27-28页 |
| 2.1.4 供试药剂 | 第28页 |
| 2.2 方法 | 第28-35页 |
| 2.2.1 接种及取样方法 | 第28-29页 |
| 2.2.2 引物使用 | 第29页 |
| 2.2.3 供试大豆基因组DNA的提取及检测 | 第29-30页 |
| 2.2.4 Rhg4和rhg1位点分子标记 | 第30-31页 |
| 2.2.5 供试大豆根总RNA的提取及检测 | 第31-32页 |
| 2.2.6 cDNA的反转录合成 | 第32页 |
| 2.2.7 供试大豆SHMT基因的克隆与测序 | 第32-35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-39页 |
| 2.3.1 DNA的提取 | 第35-36页 |
| 2.3.2 RNA的提取 | 第36页 |
| 2.3.3 分子标记 | 第36-38页 |
| 2.3.4 SHMT基因的克隆测序 | 第38-39页 |
| 2.4 小结 | 第39-40页 |
| 第三章 SHMT基因编码区序列分析 | 第40-64页 |
| 3.1 试验材料 | 第40页 |
| 3.1.1 数据库 | 第40页 |
| 3.1.2 分析工具 | 第40页 |
| 3.1.3 序列来源 | 第40页 |
| 3.2 方法 | 第40-42页 |
| 3.2.1 SHMT基因编码区序列分析 | 第41页 |
| 3.2.2 突变中性检测 | 第41页 |
| 3.2.3 卡方测验分析 | 第41页 |
| 3.2.4 SHMT基因遗传进化树分析 | 第41页 |
| 3.2.5 蛋白分子一级结构分析 | 第41页 |
| 3.2.6 蛋白分子二级结构分析 | 第41-42页 |
| 3.2.7 蛋白分子三级结构分析 | 第42页 |
| 3.2.8 蛋白分子可溶性预测 | 第42页 |
| 3.2.9 蛋白分子信号肽段分析 | 第42页 |
| 3.2.10 亚细胞定位蛋白分子 | 第42页 |
| 3.3 结果与分析 | 第42-63页 |
| 3.3.1 核苷酸序列分析结果 | 第42-49页 |
| 3.3.2 突变中性检测结果 | 第49页 |
| 3.3.3 SHMT基因与大豆对胞囊线虫的抗性分析结果 | 第49-50页 |
| 3.3.4 SHMT'基因遗传进化树分析结果 | 第50-51页 |
| 3.3.5 蛋白一级结构分析结果 | 第51-54页 |
| 3.3.6 蛋白二级结构分析结果 | 第54-59页 |
| 3.3.7 蛋白分子三级结构分析结果 | 第59-61页 |
| 3.3.8 蛋白分子分析可溶性结果 | 第61页 |
| 3.3.9 蛋白分子信号肽预测结果 | 第61-62页 |
| 3.3.10 蛋白分子亚细胞定位分析结果 | 第62-63页 |
| 3.4 本章小结 | 第63-64页 |
| 第四章 SHMT基因差异表达分析 | 第64-74页 |
| 4.1 材料 | 第64-65页 |
| 4.2 方法 | 第65-66页 |
| 4.2.1 接种及取样方法 | 第65页 |
| 4.2.2 供试大豆根总RNA的提取 | 第65页 |
| 4.2.3 cDNA的反转录合成 | 第65页 |
| 4.2.4 引物设计 | 第65-66页 |
| 4.2.5 Real-Time PCR反应体系及反应程序设置 | 第66页 |
| 4.3 结果与分析 | 第66-72页 |
| 4.3.1 RNA的提取 | 第66-67页 |
| 4.3.2 cDNA第一链的合成 | 第67页 |
| 4.3.3 目的基因和内参基因引物的选择 | 第67页 |
| 4.3.4 小黑豆SHMT基因的表达差异性分析 | 第67-72页 |
| 4.4 讨论 | 第72-74页 |
| 第五章 结论与讨论 | 第74-77页 |
| 5.1 大豆Rhg4和rhg1位点的标记与SHMT基因的克隆 | 第74页 |
| 5.2 大豆SHMT基因的分析 | 第74-76页 |
| 5.3 小黑豆与感病品种中SHMT基因差异表达分析 | 第76页 |
| 5.4 创新点与不足 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-86页 |
| 附录 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87-89页 |
| 攻读学位论文期间发表文章 | 第89页 |
